98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1115 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1115  IucA/IucC  100 
 
 		 589 aa  1179    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134793  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00876  putative siderophore biosynthesis protein  51.28 
 
 		 629 aa  525  1e-147  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0231635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0109  IucA/IucC family protein  29.82 
 
 		 584 aa  235  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110366  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0105  IucA/IucC family protein  29.82 
 
 		 584 aa  235  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.379013  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6950  IucA/IucC family protein  33.55 
 
 		 587 aa  209  9e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2672  IucA/IucC family protein  32.11 
 
 		 637 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2589  IucA/IucC  32.03 
 
 		 627 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0521559  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0588  putative siderophore biosynthesis protein  30.58 
 
 		 564 aa  191  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3092  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  28.38 
 
 		 587 aa  91.7  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09330  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  28.67 
 
 		 592 aa  91.3  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0934837  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3734  IucA/IucC family protein  24.29 
 
 		 563 aa  84.7  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0245205  normal  0.144633 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0720  hypothetical protein  27.37 
 
 		 640 aa  84  0.000000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.72234  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1984  petrobactin biosynthesis protein AsbB  24.31 
 
 		 612 aa  84  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.216331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3345  petrobactin biosynthesis protein AsbB  23.92 
 
 		 612 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0268839  hitchhiker  0.0000000000000416803 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2301  siderophore synthetase component  25.32 
 
 		 562 aa  77.4  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8364  putative siderophore biosynthesis protein  25.55 
 
 		 545 aa  77.4  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001065  vibrioferrin amide bond forming protein PvsB  24.86 
 
 		 610 aa  76.6  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01930  vibrioferrin biosynthesis protein PvsB  28.06 
 
 		 600 aa  76.6  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3749  IucA/IucC family protein  27.17 
 
 		 563 aa  75.9  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.959058  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0718  iron transporter  27.71 
 
 		 613 aa  72  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0698719 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0108  IucA/IucC family protein  20.89 
 
 		 592 aa  70.1  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0112  IucA/IucC family protein  20.89 
 
 		 592 aa  70.1  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  29.35 
 
 		 842 aa  69.7  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1278  IucA/IucC  23.41 
 
 		 602 aa  70.1  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1796  siderophore biosynthesis protein  23.44 
 
 		 610 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3137  IucA/IucC family protein  24.31 
 
 		 570 aa  68.9  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1839  siderophore biosynthesis protein  23.83 
 
 		 610 aa  66.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1813  siderophore biosynthesis protein  23.83 
 
 		 610 aa  66.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00844264  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2017  petrobactin biosynthesis protein AsbB  23.83 
 
 		 610 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0614699999999996e-42 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1982  siderophore biosynthesis protein  23.83 
 
 		 612 aa  66.6  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2837  IucA/IucC family protein  24.92 
 
 		 607 aa  65.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18665  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1781  hypothetical protein  20.37 
 
 		 653 aa  66.2  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4393  IucA/IucC  23.64 
 
 		 577 aa  66.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0515  IucA/IucC family protein  27.8 
 
 		 625 aa  64.7  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3255  IucA/IucC family protein  25.59 
 
 		 621 aa  64.3  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3523  IucA/IucC family protein  24.52 
 
 		 615 aa  64.3  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  28.18 
 
 		 998 aa  63.9  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3174  IucA/IucC family protein  22.62 
 
 		 615 aa  63.9  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.443243  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  23.37 
 
 		 1148 aa  63.2  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1845  IucA/IucC family protein  23.37 
 
 		 613 aa  63.5  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.330256  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  27.84 
 
 		 998 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2970  IucA/IucC family protein  26.67 
 
 		 546 aa  62  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1518  IucA/IucC family protein  24.83 
 
 		 631 aa  60.5  0.00000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.918024 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0174  IucA/IucC family protein  26.73 
 
 		 655 aa  60.1  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4785  IucA/IucC  26.43 
 
 		 599 aa  60.1  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1452  IucA/IucC family protein  24.49 
 
 		 629 aa  59.3  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1654  IucA/IucC family protein  25 
 
 		 642 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000012306 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1508  IucA/IucC family protein  24.49 
 
 		 631 aa  58.5  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2836  IucA/IucC family protein  29.86 
 
 		 608 aa  58.9  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0949  IucA/IucC family protein  26.79 
 
 		 577 aa  58.5  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2631  IucA/IucC family protein  25.21 
 
 		 577 aa  58.9  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  27.12 
 
 		 991 aa  57.8  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2732  IucA/IucC family protein  23.24 
 
 		 642 aa  57.8  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00744667  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1112  IucA/IucC  27.86 
 
 		 617 aa  57.8  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28831  normal  0.852167 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2710  IucA/IucC family protein  23.24 
 
 		 642 aa  57.4  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2413  IucA/IucC family protein  24.66 
 
 		 642 aa  57  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2251  hypothetical protein  21.32 
 
 		 656 aa  55.8  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3032  siderophore biosynthesis protein, putative  24.41 
 
 		 601 aa  56.2  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0136  siderophore biosynthesis protein  23.34 
 
 		 819 aa  56.2  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1279  hypothetical protein  21.05 
 
 		 580 aa  55.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2212  hypothetical protein  21.32 
 
 		 656 aa  55.8  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2658  IucA/IucC family protein  25 
 
 		 572 aa  55.1  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.539637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1811  IucA/IucC family protein  24.3 
 
 		 599 aa  54.7  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2811  IucA/IucC family protein  24.66 
 
 		 642 aa  53.9  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2439  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  24.25 
 
 		 604 aa  53.9  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1812  siderophore synthetase component, IucA/IucC  24.12 
 
 		 578 aa  53.9  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4632  aerobactin synthase, IucC component  28.4 
 
 		 580 aa  53.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0181  IucA/IucC family protein  25.56 
 
 		 655 aa  52.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3328  IucA/IucC family protein  23.15 
 
 		 614 aa  52  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.935658 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3180  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  27.43 
 
 		 580 aa  52  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4292  IucA/IucC family protein  24.41 
 
 		 597 aa  51.2  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489466  hitchhiker  0.00330556 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1280  hypothetical protein  20.5 
 
 		 580 aa  51.2  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1801  IucA/IucC family protein  26.1 
 
 		 799 aa  51.2  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000155987  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3182  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucA  26.92 
 
 		 574 aa  50.4  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2538  IucA/IucC family protein  23.98 
 
 		 604 aa  50.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.836144  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2587  IucA/IucC  21.51 
 
 		 619 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.296644  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0199  IucA/IucC family protein  26.18 
 
 		 602 aa  50.1  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0412549 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0585  IucA/IucC family protein  28 
 
 		 925 aa  50.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2674  IucA/IucC family protein  23.37 
 
 		 618 aa  50.1  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.247069  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4634  aerobactin synthase, IucA component  26.92 
 
 		 574 aa  49.7  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00879  siderophore biosynthesis protein  26.37 
 
 		 589 aa  48.9  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0128879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3733  IucA/IucC family protein  25.74 
 
 		 557 aa  47.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0935352  normal  0.031282 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5060  IucA/IucC family protein  26.58 
 
 		 615 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00130311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1808  IucA/IucC family protein  23.69 
 
 		 601 aa  47.4  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.653544  normal  0.276743 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0712  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  24.23 
 
 		 582 aa  46.6  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2715  FrgA protein  18.42 
 
 		 575 aa  47  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2737  IucA/IucC family protein  25.25 
 
 		 596 aa  46.6  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425518  normal  0.263271 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0192  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  24.23 
 
 		 582 aa  46.6  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000752976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0784  IucA/IucC family protein  24.23 
 
 		 582 aa  46.6  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0215  IucA/IucC family protein  25.95 
 
 		 645 aa  45.8  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3760  IucA/IucC family protein  25.77 
 
 		 594 aa  46.2  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.130185 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2445  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  24.21 
 
 		 614 aa  45.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2544  IucA/IucC family protein  24.21 
 
 		 614 aa  45.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0288  IucA/IucC family protein  25 
 
 		 635 aa  44.7  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1113  IucA/IucC  28.57 
 
 		 608 aa  45.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3462  IucA/IucC family protein  25.78 
 
 		 594 aa  43.9  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.479032  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00878  siderophore biosynthesis protein  26.21 
 
 		 611 aa  43.5  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0338478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2548  IucA/IucC family protein  26.67 
 
 		 596 aa  43.5  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.507194 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>