16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0588 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0588  putative siderophore biosynthesis protein  100 
 
 		 564 aa  1158    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00876  putative siderophore biosynthesis protein  34.09 
 
 		 629 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0231635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1115  IucA/IucC  30.58 
 
 		 589 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0105  IucA/IucC family protein  28.86 
 
 		 584 aa  180  5.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.379013  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0109  IucA/IucC family protein  28.86 
 
 		 584 aa  180  5.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110366  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2589  IucA/IucC  27.73 
 
 		 627 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0521559  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2672  IucA/IucC family protein  27.13 
 
 		 637 aa  125  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6950  IucA/IucC family protein  27.93 
 
 		 587 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4785  IucA/IucC  26.37 
 
 		 599 aa  59.7  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3749  IucA/IucC family protein  23.91 
 
 		 563 aa  59.3  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.959058  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3092  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  25.09 
 
 		 587 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001065  vibrioferrin amide bond forming protein PvsB  26.47 
 
 		 610 aa  55.1  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09330  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  24.83 
 
 		 592 aa  53.5  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0934837  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2970  IucA/IucC family protein  24.29 
 
 		 546 aa  48.1  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3137  IucA/IucC family protein  24.56 
 
 		 570 aa  47.8  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0410  IucA/IucC  27.12 
 
 		 578 aa  45.4  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.4179  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>