116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2589 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2589  IucA/IucC  100 
 
 		 627 aa  1294    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0521559  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2672  IucA/IucC family protein  66.07 
 
 		 637 aa  837    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0105  IucA/IucC family protein  33.48 
 
 		 584 aa  272  1e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.379013  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0109  IucA/IucC family protein  33.48 
 
 		 584 aa  272  1e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110366  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00876  putative siderophore biosynthesis protein  32.98 
 
 		 629 aa  213  7e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0231635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6950  IucA/IucC family protein  34.05 
 
 		 587 aa  205  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1115  IucA/IucC  32.03 
 
 		 589 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0588  putative siderophore biosynthesis protein  27.73 
 
 		 564 aa  133  7.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01930  vibrioferrin biosynthesis protein PvsB  29.57 
 
 		 600 aa  129  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3092  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  25.52 
 
 		 587 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09330  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  27.02 
 
 		 592 aa  113  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0934837  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3137  IucA/IucC family protein  26.35 
 
 		 570 aa  111  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1280  hypothetical protein  23.86 
 
 		 580 aa  104  5e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1652  siderophore synthase  22.86 
 
 		 588 aa  102  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0181  IucA/IucC family protein  28.33 
 
 		 655 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1279  hypothetical protein  23.86 
 
 		 580 aa  100  7e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0174  IucA/IucC family protein  28.5 
 
 		 655 aa  100  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001065  vibrioferrin amide bond forming protein PvsB  24.6 
 
 		 610 aa  96.7  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3682  IucA/IucC  25.69 
 
 		 637 aa  94  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1278  IucA/IucC  23.11 
 
 		 602 aa  87.4  7e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3906  IucA/IucC family protein  24.81 
 
 		 633 aa  87.4  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0108  IucA/IucC family protein  23.63 
 
 		 592 aa  86.7  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0112  IucA/IucC family protein  23.63 
 
 		 592 aa  86.7  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2846  FrgA protein  22.92 
 
 		 575 aa  80.9  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3734  IucA/IucC family protein  25.17 
 
 		 563 aa  80.9  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0245205  normal  0.144633 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0720  hypothetical protein  25.06 
 
 		 640 aa  80.5  0.00000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.72234  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3345  petrobactin biosynthesis protein AsbB  22.95 
 
 		 612 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0268839  hitchhiker  0.0000000000000416803 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3749  IucA/IucC family protein  23.76 
 
 		 563 aa  78.6  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.959058  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8364  putative siderophore biosynthesis protein  26.02 
 
 		 545 aa  78.6  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1796  siderophore biosynthesis protein  22.72 
 
 		 610 aa  77.4  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2674  IucA/IucC family protein  24.72 
 
 		 618 aa  77.4  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.247069  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0949  IucA/IucC family protein  27.08 
 
 		 577 aa  77  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2631  IucA/IucC family protein  25.76 
 
 		 577 aa  76.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1781  hypothetical protein  21.24 
 
 		 653 aa  76.3  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2587  IucA/IucC  25.38 
 
 		 619 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.296644  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1984  petrobactin biosynthesis protein AsbB  22.11 
 
 		 612 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.216331  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2715  FrgA protein  22.69 
 
 		 575 aa  75.5  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4393  IucA/IucC  27.2 
 
 		 577 aa  75.5  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0635  putative siderophore biosynthesis protein  24.83 
 
 		 610 aa  75.5  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.809608  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1839  siderophore biosynthesis protein  22.72 
 
 		 610 aa  74.3  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1813  siderophore biosynthesis protein  22.72 
 
 		 610 aa  74.3  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00844264  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1982  siderophore biosynthesis protein  22.72 
 
 		 612 aa  74.3  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2017  petrobactin biosynthesis protein AsbB  22.72 
 
 		 610 aa  74.3  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0614699999999996e-42 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2212  hypothetical protein  21.77 
 
 		 656 aa  73.9  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2251  hypothetical protein  21.77 
 
 		 656 aa  73.9  0.000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2301  siderophore synthetase component  24.32 
 
 		 562 aa  72.8  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4785  IucA/IucC  26.13 
 
 		 599 aa  72.4  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3180  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  26.46 
 
 		 580 aa  70.1  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  27.72 
 
 		 991 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1845  IucA/IucC family protein  21.87 
 
 		 613 aa  68.6  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.330256  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2439  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  25.5 
 
 		 604 aa  65.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4632  aerobactin synthase, IucC component  25.08 
 
 		 580 aa  65.9  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0888  IucA/IucC family protein  21.97 
 
 		 720 aa  64.3  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2970  IucA/IucC family protein  26.6 
 
 		 546 aa  63.5  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3174  IucA/IucC family protein  22.59 
 
 		 615 aa  63.2  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.443243  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0920  IucA/IucC family protein  23.46 
 
 		 582 aa  63.5  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2658  IucA/IucC family protein  23.71 
 
 		 572 aa  63.2  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.539637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3328  IucA/IucC family protein  22.22 
 
 		 614 aa  62.8  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.935658 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2833  IucA/IucC  21.73 
 
 		 813 aa  62  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76703  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2548  IucA/IucC family protein  23.51 
 
 		 596 aa  61.6  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.507194 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2538  IucA/IucC family protein  25.17 
 
 		 604 aa  61.6  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.836144  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2737  IucA/IucC family protein  23.51 
 
 		 596 aa  61.2  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425518  normal  0.263271 
 
 
-
 
NC_003296  RS00879  siderophore biosynthesis protein  25 
 
 		 589 aa  61.2  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0128879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  26.17 
 
 		 998 aa  60.8  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0288  IucA/IucC family protein  26.44 
 
 		 635 aa  60.1  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  25.9 
 
 		 998 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5060  IucA/IucC family protein  25.37 
 
 		 615 aa  58.5  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00130311 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1812  siderophore synthetase component, IucA/IucC  21.5 
 
 		 578 aa  56.6  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0712  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  23.36 
 
 		 582 aa  57  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0192  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  23.36 
 
 		 582 aa  56.6  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000752976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0784  IucA/IucC family protein  23.36 
 
 		 582 aa  56.6  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3523  IucA/IucC family protein  22.95 
 
 		 615 aa  55.5  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3255  IucA/IucC family protein  25.48 
 
 		 621 aa  55.5  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  25.75 
 
 		 1153 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0515  IucA/IucC family protein  26.12 
 
 		 625 aa  54.7  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1779  hypothetical protein  22.87 
 
 		 585 aa  54.3  0.000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.762831  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0718  iron transporter  25.2 
 
 		 613 aa  53.9  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0698719 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3032  siderophore biosynthesis protein, putative  22.08 
 
 		 601 aa  53.5  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0922  IucA/IucC family protein  24.86 
 
 		 581 aa  53.5  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.285296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1452  IucA/IucC family protein  22.6 
 
 		 629 aa  52.8  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3733  IucA/IucC family protein  25.73 
 
 		 557 aa  52.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0935352  normal  0.031282 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1071  IucA/IucC family protein  27.88 
 
 		 613 aa  52  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.549269  normal  0.885774 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1811  IucA/IucC family protein  23.46 
 
 		 599 aa  52  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1518  IucA/IucC family protein  22.25 
 
 		 631 aa  51.2  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.918024 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3182  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucA  29.1 
 
 		 574 aa  51.6  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  23.62 
 
 		 1148 aa  50.8  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0218  IucA/IucC family protein  24.03 
 
 		 621 aa  50.8  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  23.53 
 
 		 842 aa  50.4  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0199  IucA/IucC family protein  23.9 
 
 		 602 aa  50.4  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0412549 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1808  IucA/IucC family protein  28.74 
 
 		 601 aa  50.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.653544  normal  0.276743 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4292  IucA/IucC family protein  27.46 
 
 		 597 aa  50.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489466  hitchhiker  0.00330556 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2811  IucA/IucC family protein  27.93 
 
 		 642 aa  48.5  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4634  aerobactin synthase, IucA component  23.23 
 
 		 574 aa  48.9  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1814  siderophore synthetase component, IucA/IucC  21.54 
 
 		 560 aa  48.5  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00455454  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0947  IucA/IucC family protein  23.96 
 
 		 574 aa  48.1  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.251332  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3522  IucA/IucC family protein  24.04 
 
 		 610 aa  48.1  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4783  IucA/IucC  22.02 
 
 		 610 aa  47.8  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0136  siderophore biosynthesis protein  20.25 
 
 		 819 aa  47.8  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1654  IucA/IucC family protein  27.48 
 
 		 642 aa  47.8  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000012306 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2413  IucA/IucC family protein  27.48 
 
 		 642 aa  47.8  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>