145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5060 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3255  IucA/IucC family protein  56.53 
 
 
621 aa  675    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5060  IucA/IucC family protein  100 
 
 
615 aa  1201    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00130311 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0920  IucA/IucC family protein  43.85 
 
 
582 aa  463  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185756  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2658  IucA/IucC family protein  40.28 
 
 
572 aa  462  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.539637  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0712  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  43.29 
 
 
582 aa  451  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0192  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  43.34 
 
 
582 aa  449  1e-125  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000752976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0784  IucA/IucC family protein  43.34 
 
 
582 aa  449  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0949  IucA/IucC family protein  43.06 
 
 
577 aa  440  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3180  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  42 
 
 
580 aa  429  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4632  aerobactin synthase, IucC component  41.31 
 
 
580 aa  420  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0407  IucA/IucC  40.24 
 
 
601 aa  388  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27175  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2833  IucA/IucC  34.85 
 
 
813 aa  383  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76703  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1812  siderophore synthetase component, IucA/IucC  33.51 
 
 
578 aa  368  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0218  IucA/IucC family protein  33.9 
 
 
621 aa  355  1e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0594  siderophore biosynthesis protein  32.64 
 
 
639 aa  348  1e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00413673  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1811  IucA/IucC family protein  39.21 
 
 
599 aa  348  2e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3328  IucA/IucC family protein  36.27 
 
 
614 aa  332  2e-89  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.935658 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3174  IucA/IucC family protein  28.5 
 
 
615 aa  309  8e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.443243  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0658  IucA/IucC family protein  39.15 
 
 
616 aa  306  6e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.577175  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2544  IucA/IucC family protein  32.29 
 
 
614 aa  287  4e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2445  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  32.11 
 
 
614 aa  285  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2836  IucA/IucC family protein  31.35 
 
 
608 aa  284  3.0000000000000004e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160458  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3462  IucA/IucC family protein  35.14 
 
 
594 aa  284  4.0000000000000003e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.479032  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0288  IucA/IucC family protein  34.08 
 
 
635 aa  283  9e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0515  IucA/IucC family protein  33.33 
 
 
625 aa  280  6e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2548  IucA/IucC family protein  35.84 
 
 
596 aa  280  7e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.507194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4292  IucA/IucC family protein  34.59 
 
 
597 aa  278  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489466  hitchhiker  0.00330556 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2737  IucA/IucC family protein  35.61 
 
 
596 aa  275  3e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425518  normal  0.263271 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2732  IucA/IucC family protein  29.81 
 
 
642 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00744667  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  33.11 
 
 
842 aa  268  2e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1452  IucA/IucC family protein  29.73 
 
 
629 aa  268  2e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1654  IucA/IucC family protein  30.16 
 
 
642 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000012306 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1518  IucA/IucC family protein  29.41 
 
 
631 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.918024 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2710  IucA/IucC family protein  29.98 
 
 
642 aa  266  8.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2811  IucA/IucC family protein  29.98 
 
 
642 aa  266  1e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1071  IucA/IucC family protein  35.73 
 
 
613 aa  263  4.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.549269  normal  0.885774 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1508  IucA/IucC family protein  29.55 
 
 
631 aa  263  6e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2837  IucA/IucC family protein  29.39 
 
 
607 aa  262  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18665  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2413  IucA/IucC family protein  29.62 
 
 
642 aa  261  3e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4058  IucA/IucC  34.27 
 
 
716 aa  260  6e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.309342  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3032  siderophore biosynthesis protein, putative  29.16 
 
 
601 aa  257  5e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0136  siderophore biosynthesis protein  27.56 
 
 
819 aa  256  7e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1801  IucA/IucC family protein  35.04 
 
 
799 aa  252  1e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000155987  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0199  IucA/IucC family protein  36.17 
 
 
602 aa  244  3e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0412549 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2439  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  28.84 
 
 
604 aa  241  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2538  IucA/IucC family protein  28.67 
 
 
604 aa  235  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.836144  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2587  IucA/IucC  30.62 
 
 
619 aa  220  5e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.296644  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  29.89 
 
 
1148 aa  220  5e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1112  IucA/IucC  32.57 
 
 
617 aa  209  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28831  normal  0.852167 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1796  siderophore biosynthesis protein  25.54 
 
 
610 aa  199  9e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1839  siderophore biosynthesis protein  25.54 
 
 
610 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2017  petrobactin biosynthesis protein AsbB  25.54 
 
 
610 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0614699999999996e-42 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1982  siderophore biosynthesis protein  25.54 
 
 
612 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00879  siderophore biosynthesis protein  34.81 
 
 
589 aa  199  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0128879  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1813  siderophore biosynthesis protein  25.37 
 
 
610 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00844264  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2674  IucA/IucC family protein  31.36 
 
 
618 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.247069  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3345  petrobactin biosynthesis protein AsbB  24.13 
 
 
612 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0268839  hitchhiker  0.0000000000000416803 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  33.95 
 
 
1153 aa  195  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1984  petrobactin biosynthesis protein AsbB  24.5 
 
 
612 aa  194  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.216331  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1845  IucA/IucC family protein  24.34 
 
 
613 aa  189  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.330256  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  34.33 
 
 
991 aa  178  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  36.22 
 
 
998 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  33.08 
 
 
998 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3523  IucA/IucC family protein  29.04 
 
 
615 aa  166  8e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0108  IucA/IucC family protein  23.99 
 
 
592 aa  165  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0112  IucA/IucC family protein  23.99 
 
 
592 aa  165  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4393  IucA/IucC  34.67 
 
 
577 aa  162  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2301  siderophore synthetase component  33.33 
 
 
562 aa  157  7e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2631  IucA/IucC family protein  33.33 
 
 
577 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3906  IucA/IucC family protein  31.65 
 
 
633 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0635  putative siderophore biosynthesis protein  28.29 
 
 
610 aa  103  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.809608  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0174  IucA/IucC family protein  30.77 
 
 
655 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0181  IucA/IucC family protein  30.77 
 
 
655 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0888  IucA/IucC family protein  30.22 
 
 
720 aa  94.7  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3734  IucA/IucC family protein  27.58 
 
 
563 aa  94  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0245205  normal  0.144633 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1280  hypothetical protein  24.68 
 
 
580 aa  82.4  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1279  hypothetical protein  25 
 
 
580 aa  79.7  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4783  IucA/IucC  28.31 
 
 
610 aa  76.6  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0105  IucA/IucC family protein  22.75 
 
 
584 aa  77  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.379013  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0109  IucA/IucC family protein  22.75 
 
 
584 aa  77  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110366  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1652  siderophore synthase  20.81 
 
 
588 aa  76.6  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001063  vibrioferrin amide bond forming protein PvsD  23.58 
 
 
580 aa  76.3  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0585  IucA/IucC family protein  25.9 
 
 
925 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0107  IucA/IucC family protein  23.55 
 
 
578 aa  75.1  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0111  IucA/IucC family protein  23.55 
 
 
578 aa  75.1  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1779  hypothetical protein  25.14 
 
 
585 aa  74.3  0.000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.762831  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0718  iron transporter  29.38 
 
 
613 aa  74.3  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0698719 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2672  IucA/IucC family protein  25.54 
 
 
637 aa  72  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2715  FrgA protein  21.61 
 
 
575 aa  70.9  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3733  IucA/IucC family protein  30.41 
 
 
557 aa  70.9  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0935352  normal  0.031282 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2210  hypothetical protein  24.77 
 
 
585 aa  70.9  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2249  hypothetical protein  24.77 
 
 
585 aa  70.9  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3682  IucA/IucC  27.71 
 
 
637 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2212  hypothetical protein  22.71 
 
 
656 aa  70.1  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2251  hypothetical protein  22.71 
 
 
656 aa  70.1  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3331  IucA/IucC family protein  28.57 
 
 
601 aa  70.1  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0215  IucA/IucC family protein  28.4 
 
 
645 aa  67.4  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0410  IucA/IucC  27.44 
 
 
578 aa  67.4  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.4179  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3334  IucA/IucC family protein  26.75 
 
 
591 aa  67.4  0.0000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1781  hypothetical protein  20.65 
 
 
653 aa  67  0.0000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>