101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001065 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_001065  vibrioferrin amide bond forming protein PvsB  100 
 
 
610 aa  1263    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1278  IucA/IucC  47.1 
 
 
602 aa  543  1e-153  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09330  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  45.96 
 
 
592 aa  497  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0934837  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3092  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  47.45 
 
 
587 aa  486  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3137  IucA/IucC family protein  44.63 
 
 
570 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01930  vibrioferrin biosynthesis protein PvsB  45 
 
 
600 aa  449  1e-125  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4785  IucA/IucC  40.3 
 
 
599 aa  395  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0720  hypothetical protein  35.56 
 
 
640 aa  353  5.9999999999999994e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.72234  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8364  putative siderophore biosynthesis protein  31.93 
 
 
545 aa  239  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2970  IucA/IucC family protein  36.1 
 
 
546 aa  237  4e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3749  IucA/IucC family protein  34 
 
 
563 aa  234  3e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.959058  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0105  IucA/IucC family protein  24.63 
 
 
584 aa  107  8e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.379013  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0109  IucA/IucC family protein  24.63 
 
 
584 aa  107  8e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110366  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2672  IucA/IucC family protein  25.06 
 
 
637 aa  100  6e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2589  IucA/IucC  24.52 
 
 
627 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0521559  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1652  siderophore synthase  26.35 
 
 
588 aa  97.4  7e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1280  hypothetical protein  25.24 
 
 
580 aa  94.4  6e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6950  IucA/IucC family protein  27.08 
 
 
587 aa  90.5  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00876  putative siderophore biosynthesis protein  25 
 
 
629 aa  89  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0231635  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1279  hypothetical protein  24.52 
 
 
580 aa  87.4  7e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0174  IucA/IucC family protein  26.9 
 
 
655 aa  83.6  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0181  IucA/IucC family protein  26.27 
 
 
655 aa  80.1  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0215  IucA/IucC family protein  25.06 
 
 
645 aa  79.7  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1115  IucA/IucC  23.46 
 
 
589 aa  79.3  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134793  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3522  IucA/IucC family protein  28.82 
 
 
610 aa  78.6  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3906  IucA/IucC family protein  28.62 
 
 
633 aa  77.8  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4016  IucA/IucC family protein  26.02 
 
 
595 aa  77.8  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0306734  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3760  IucA/IucC family protein  24.59 
 
 
594 aa  77.4  0.0000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.130185 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  24.52 
 
 
998 aa  77  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1808  IucA/IucC family protein  26.75 
 
 
601 aa  76.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.653544  normal  0.276743 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  25.54 
 
 
998 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  24.95 
 
 
991 aa  75.1  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4055  IucA/IucC family protein  24.07 
 
 
594 aa  74.3  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0250939  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0660  IucA/IucC family protein  24.22 
 
 
570 aa  72.8  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00702947  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0107  IucA/IucC family protein  28.57 
 
 
578 aa  72  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0111  IucA/IucC family protein  28.57 
 
 
578 aa  72  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  26.56 
 
 
1153 aa  71.2  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1781  hypothetical protein  22.09 
 
 
653 aa  70.9  0.00000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1779  hypothetical protein  25.89 
 
 
585 aa  70.1  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.762831  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0635  putative siderophore biosynthesis protein  25.32 
 
 
610 aa  68.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.809608  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3682  IucA/IucC  27.36 
 
 
637 aa  68.6  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3331  IucA/IucC family protein  21.33 
 
 
601 aa  68.2  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3733  IucA/IucC family protein  26.67 
 
 
557 aa  67  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0935352  normal  0.031282 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  26.13 
 
 
1148 aa  66.2  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3334  IucA/IucC family protein  24.32 
 
 
591 aa  65.5  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2837  IucA/IucC  22.56 
 
 
606 aa  64.3  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.296013  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2632  IucA/IucC family protein  26.52 
 
 
593 aa  64.3  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0108  IucA/IucC family protein  23.58 
 
 
592 aa  63.5  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0112  IucA/IucC family protein  23.58 
 
 
592 aa  63.5  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0410  IucA/IucC  24.67 
 
 
578 aa  63.2  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.4179  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4392  IucA/IucC  25.08 
 
 
596 aa  62.4  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1844  IucA/IucC family protein  22.55 
 
 
602 aa  62  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0027586  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2302  siderophore synthetase component  24.06 
 
 
609 aa  60.8  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.867655  normal  0.869204 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2210  hypothetical protein  21.54 
 
 
585 aa  60.5  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2249  hypothetical protein  21.54 
 
 
585 aa  60.5  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1838  siderophore biosynthesis protein  23.55 
 
 
602 aa  60.1  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.846084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1981  siderophore biosynthesis protein  23.55 
 
 
602 aa  60.1  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.978268  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1812  siderophore biosynthesis protein  23.55 
 
 
602 aa  59.3  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000021038  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1795  siderophore biosynthesis protein  23.62 
 
 
602 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2016  petrobactin biosynthesis protein AsbA  23.55 
 
 
602 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2796000000000001e-41 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09310  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  24.93 
 
 
586 aa  58.9  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00047621  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3750  IucA/IucC family protein  26.69 
 
 
599 aa  58.9  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3734  IucA/IucC family protein  22.64 
 
 
563 aa  58.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0245205  normal  0.144633 
 
 
-
 
NC_003296  RS00878  siderophore biosynthesis protein  25.3 
 
 
611 aa  58.2  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0338478  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2212  hypothetical protein  22.4 
 
 
656 aa  58.2  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2251  hypothetical protein  22.4 
 
 
656 aa  58.2  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1983  petrobactin biosynthesis protein AsbA  22.06 
 
 
602 aa  58.2  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0967971  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3346  petrobactin biosynthesis protein AsbA  22.06 
 
 
602 aa  57.4  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00585589  hitchhiker  0.0000000000000409747 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2301  siderophore synthetase component  24.2 
 
 
562 aa  57.4  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0718  iron transporter  20.84 
 
 
613 aa  56.6  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0698719 
 
 
-
 
NC_003296  RS00879  siderophore biosynthesis protein  25.21 
 
 
589 aa  55.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0128879  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2846  FrgA protein  23.62 
 
 
575 aa  55.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2715  FrgA protein  23.77 
 
 
575 aa  55.5  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0588  putative siderophore biosynthesis protein  26.47 
 
 
564 aa  55.5  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0591  siderophore biosynthesis protein  20.71 
 
 
810 aa  55.5  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124028  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0888  IucA/IucC family protein  22.29 
 
 
720 aa  55.1  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4056  IucA/IucC  43.86 
 
 
672 aa  54.3  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.512402  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4783  IucA/IucC  24.78 
 
 
610 aa  54.3  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1845  IucA/IucC family protein  23.1 
 
 
613 aa  53.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.330256  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1984  petrobactin biosynthesis protein AsbB  24.26 
 
 
612 aa  52.4  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.216331  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2631  IucA/IucC family protein  25.71 
 
 
577 aa  51.6  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3345  petrobactin biosynthesis protein AsbB  23.27 
 
 
612 aa  51.6  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0268839  hitchhiker  0.0000000000000416803 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4393  IucA/IucC  21.39 
 
 
577 aa  51.2  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3523  IucA/IucC family protein  24.35 
 
 
615 aa  51.6  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3257  IucA/IucC family protein  21.2 
 
 
584 aa  51.2  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1796  siderophore biosynthesis protein  21.31 
 
 
610 aa  50.8  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1113  IucA/IucC  24.68 
 
 
608 aa  50.8  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2584  IucA/IucC  23.17 
 
 
594 aa  50.4  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0652267  decreased coverage  0.000722878 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2674  IucA/IucC family protein  22.35 
 
 
618 aa  50.4  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.247069  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1814  siderophore synthetase component, IucA/IucC  22.34 
 
 
560 aa  50.4  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00455454  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3172  IucA/IucC family protein  21.76 
 
 
818 aa  49.7  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8365  putative iron transport protein  23.18 
 
 
519 aa  50.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1839  siderophore biosynthesis protein  23.15 
 
 
610 aa  48.1  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1813  siderophore biosynthesis protein  23.15 
 
 
610 aa  48.1  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00844264  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1982  siderophore biosynthesis protein  23.15 
 
 
612 aa  48.1  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2017  petrobactin biosynthesis protein AsbB  23.15 
 
 
610 aa  48.1  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0614699999999996e-42 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0949  IucA/IucC family protein  23.08 
 
 
577 aa  47  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5062  IucA/IucC family protein  22.99 
 
 
588 aa  45.8  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806169 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001063  vibrioferrin amide bond forming protein PvsD  23.48 
 
 
580 aa  45.8  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3180  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  24 
 
 
580 aa  45.4  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>