158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0174 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0174  IucA/IucC family protein  100 
 
 		 655 aa  1307    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0181  IucA/IucC family protein  96.03 
 
 		 655 aa  1231    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0635  putative siderophore biosynthesis protein  36.45 
 
 		 610 aa  300  6e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.809608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3682  IucA/IucC  33.82 
 
 		 637 aa  286  9e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3906  IucA/IucC family protein  30.88 
 
 		 633 aa  258  3e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1652  siderophore synthase  29.7 
 
 		 588 aa  243  7.999999999999999e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1280  hypothetical protein  29.75 
 
 		 580 aa  191  4e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1279  hypothetical protein  29.51 
 
 		 580 aa  190  9e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0888  IucA/IucC family protein  29.61 
 
 		 720 aa  153  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2210  hypothetical protein  27.95 
 
 		 585 aa  153  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2249  hypothetical protein  27.95 
 
 		 585 aa  153  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1779  hypothetical protein  24.33 
 
 		 585 aa  152  2e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.762831  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2846  FrgA protein  26.1 
 
 		 575 aa  132  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2715  FrgA protein  24.27 
 
 		 575 aa  129  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2212  hypothetical protein  24.15 
 
 		 656 aa  124  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2251  hypothetical protein  24.15 
 
 		 656 aa  124  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1781  hypothetical protein  23.71 
 
 		 653 aa  123  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0288  IucA/IucC family protein  27.64 
 
 		 635 aa  111  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0720  hypothetical protein  30.46 
 
 		 640 aa  108  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.72234  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3345  petrobactin biosynthesis protein AsbB  23.41 
 
 		 612 aa  107  8e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0268839  hitchhiker  0.0000000000000416803 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1984  petrobactin biosynthesis protein AsbB  23.66 
 
 		 612 aa  106  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.216331  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  32.24 
 
 		 1153 aa  105  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1112  IucA/IucC  29.2 
 
 		 617 aa  105  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28831  normal  0.852167 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3734  IucA/IucC family protein  27.52 
 
 		 563 aa  104  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0245205  normal  0.144633 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0515  IucA/IucC family protein  25.97 
 
 		 625 aa  102  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2587  IucA/IucC  28.57 
 
 		 619 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.296644  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0108  IucA/IucC family protein  24.65 
 
 		 592 aa  102  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2672  IucA/IucC family protein  30.3 
 
 		 637 aa  102  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0112  IucA/IucC family protein  24.65 
 
 		 592 aa  102  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0407  IucA/IucC  26.42 
 
 		 601 aa  102  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27175  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2589  IucA/IucC  28.5 
 
 		 627 aa  100  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0521559  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001063  vibrioferrin amide bond forming protein PvsD  25.26 
 
 		 580 aa  99.8  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1796  siderophore biosynthesis protein  22.25 
 
 		 610 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1839  siderophore biosynthesis protein  22.98 
 
 		 610 aa  99.4  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1813  siderophore biosynthesis protein  22.98 
 
 		 610 aa  99.4  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00844264  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1982  siderophore biosynthesis protein  22.98 
 
 		 612 aa  99.4  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2017  petrobactin biosynthesis protein AsbB  22.98 
 
 		 610 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0614699999999996e-42 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5060  IucA/IucC family protein  30.49 
 
 		 615 aa  99.4  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00130311 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01930  vibrioferrin biosynthesis protein PvsB  30.42 
 
 		 600 aa  99.8  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3328  IucA/IucC family protein  26.28 
 
 		 614 aa  97.4  7e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.935658 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3523  IucA/IucC family protein  24.14 
 
 		 615 aa  97.1  9e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1845  IucA/IucC family protein  21.33 
 
 		 613 aa  96.7  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.330256  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3180  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  26.06 
 
 		 580 aa  96.3  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2833  IucA/IucC  26.09 
 
 		 813 aa  94  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76703  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0949  IucA/IucC family protein  26.67 
 
 		 577 aa  93.2  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1812  siderophore synthetase component, IucA/IucC  23.87 
 
 		 578 aa  92.8  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4632  aerobactin synthase, IucC component  25.71 
 
 		 580 aa  92.8  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0218  IucA/IucC family protein  25.3 
 
 		 621 aa  92  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4785  IucA/IucC  28.89 
 
 		 599 aa  91.3  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1452  IucA/IucC family protein  23.85 
 
 		 629 aa  91.3  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1508  IucA/IucC family protein  23.85 
 
 		 631 aa  90.5  8e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3032  siderophore biosynthesis protein, putative  22.94 
 
 		 601 aa  90.1  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1518  IucA/IucC family protein  23.85 
 
 		 631 aa  90.1  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.918024 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  30.06 
 
 		 991 aa  90.1  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09330  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  31.01 
 
 		 592 aa  89  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0934837  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3255  IucA/IucC family protein  27.58 
 
 		 621 aa  89.4  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3092  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  29.94 
 
 		 587 aa  88.6  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2674  IucA/IucC family protein  24.79 
 
 		 618 aa  87.4  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.247069  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1811  IucA/IucC family protein  26.04 
 
 		 599 aa  87.4  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0594  siderophore biosynthesis protein  24.32 
 
 		 639 aa  87.4  8e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00413673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2301  siderophore synthetase component  25.84 
 
 		 562 aa  86.7  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2439  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  22.16 
 
 		 604 aa  86.7  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3139  IucA/IucC family protein  26.18 
 
 		 586 aa  87  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00879  siderophore biosynthesis protein  28.64 
 
 		 589 aa  85.9  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0128879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0215  IucA/IucC family protein  28.73 
 
 		 645 aa  85.9  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09310  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  25.76 
 
 		 586 aa  85.9  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00047621  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0660  IucA/IucC family protein  33.02 
 
 		 570 aa  86.3  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00702947  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3733  IucA/IucC family protein  28.76 
 
 		 557 aa  86.3  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0935352  normal  0.031282 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0658  IucA/IucC family protein  30.24 
 
 		 616 aa  85.5  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.577175  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0712  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  27.16 
 
 		 582 aa  85.1  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0192  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  27.16 
 
 		 582 aa  85.1  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000752976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0784  IucA/IucC family protein  27.16 
 
 		 582 aa  85.1  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2631  IucA/IucC family protein  26.39 
 
 		 577 aa  84.7  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8365  putative iron transport protein  25 
 
 		 519 aa  84.3  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2837  IucA/IucC family protein  24.16 
 
 		 607 aa  84.3  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001065  vibrioferrin amide bond forming protein PvsB  26.9 
 
 		 610 aa  84  0.000000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0591  siderophore biosynthesis protein  25.45 
 
 		 810 aa  83.6  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3174  IucA/IucC family protein  21.17 
 
 		 615 aa  83.6  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.443243  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2732  IucA/IucC family protein  22.8 
 
 		 642 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00744667  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1654  IucA/IucC family protein  22.49 
 
 		 642 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000012306 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2811  IucA/IucC family protein  22.8 
 
 		 642 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2971  IucA/IucC family protein  26.6 
 
 		 555 aa  82.4  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.963882 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0920  IucA/IucC family protein  26.13 
 
 		 582 aa  82  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2538  IucA/IucC family protein  21.86 
 
 		 604 aa  82  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.836144  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4056  IucA/IucC  25.84 
 
 		 672 aa  82  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.512402  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1071  IucA/IucC family protein  28.31 
 
 		 613 aa  81.6  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.549269  normal  0.885774 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  27.85 
 
 		 998 aa  80.9  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  23.85 
 
 		 1148 aa  80.9  0.00000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  25.91 
 
 		 842 aa  80.9  0.00000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2710  IucA/IucC family protein  22.49 
 
 		 642 aa  80.9  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2413  IucA/IucC family protein  23.1 
 
 		 642 aa  80.5  0.00000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3172  IucA/IucC family protein  25.23 
 
 		 818 aa  80.5  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0718  iron transporter  26.93 
 
 		 613 aa  79.3  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0698719 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4393  IucA/IucC  23.24 
 
 		 577 aa  79  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3334  IucA/IucC family protein  26.09 
 
 		 591 aa  79.3  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  27.85 
 
 		 998 aa  79.7  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4783  IucA/IucC  25.86 
 
 		 610 aa  78.6  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3331  IucA/IucC family protein  28.79 
 
 		 601 aa  77.8  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1278  IucA/IucC  24.85 
 
 		 602 aa  76.6  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0410  IucA/IucC  29.61 
 
 		 578 aa  76.6  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.4179  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>