113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0720 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0720  hypothetical protein  100 
 
 		 640 aa  1271    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.72234  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4785  IucA/IucC  58.32 
 
 		 599 aa  642    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3092  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  43.06 
 
 		 587 aa  411  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09330  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  43.04 
 
 		 592 aa  407  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0934837  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01930  vibrioferrin biosynthesis protein PvsB  42.31 
 
 		 600 aa  395  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001065  vibrioferrin amide bond forming protein PvsB  36.07 
 
 		 610 aa  355  1e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3137  IucA/IucC family protein  39.29 
 
 		 570 aa  355  1e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1278  IucA/IucC  34.92 
 
 		 602 aa  351  2e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2970  IucA/IucC family protein  40.04 
 
 		 546 aa  248  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8364  putative siderophore biosynthesis protein  40.24 
 
 		 545 aa  245  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3749  IucA/IucC family protein  38.4 
 
 		 563 aa  223  9e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.959058  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0174  IucA/IucC family protein  30.46 
 
 		 655 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6950  IucA/IucC family protein  34.47 
 
 		 587 aa  107  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0181  IucA/IucC family protein  31.1 
 
 		 655 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0635  putative siderophore biosynthesis protein  29.67 
 
 		 610 aa  101  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.809608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1652  siderophore synthase  25.51 
 
 		 588 aa  101  5e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1280  hypothetical protein  24.34 
 
 		 580 aa  100  7e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1279  hypothetical protein  23.86 
 
 		 580 aa  93.6  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2672  IucA/IucC family protein  25.27 
 
 		 637 aa  91.7  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0105  IucA/IucC family protein  22.82 
 
 		 584 aa  87  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.379013  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0109  IucA/IucC family protein  22.82 
 
 		 584 aa  87  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110366  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3906  IucA/IucC family protein  25.11 
 
 		 633 aa  85.1  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1115  IucA/IucC  27.23 
 
 		 589 aa  84  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3682  IucA/IucC  29.54 
 
 		 637 aa  81.6  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2589  IucA/IucC  25.06 
 
 		 627 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0521559  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1796  siderophore biosynthesis protein  24.82 
 
 		 610 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1813  siderophore biosynthesis protein  25.49 
 
 		 610 aa  77.4  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00844264  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1982  siderophore biosynthesis protein  25.49 
 
 		 612 aa  77.4  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1839  siderophore biosynthesis protein  25.49 
 
 		 610 aa  77  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  28.95 
 
 		 998 aa  77  0.0000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2017  petrobactin biosynthesis protein AsbB  25.49 
 
 		 610 aa  77  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0614699999999996e-42 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0108  IucA/IucC family protein  23.89 
 
 		 592 aa  77  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0112  IucA/IucC family protein  23.89 
 
 		 592 aa  77  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  28.95 
 
 		 998 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2846  FrgA protein  22.26 
 
 		 575 aa  75.5  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  30.36 
 
 		 991 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3345  petrobactin biosynthesis protein AsbB  24.09 
 
 		 612 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0268839  hitchhiker  0.0000000000000416803 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2631  IucA/IucC family protein  27.97 
 
 		 577 aa  72  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2715  FrgA protein  22.5 
 
 		 575 aa  71.6  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0888  IucA/IucC family protein  26.23 
 
 		 720 aa  71.6  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4393  IucA/IucC  27.81 
 
 		 577 aa  71.2  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1984  petrobactin biosynthesis protein AsbB  23.77 
 
 		 612 aa  70.5  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.216331  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2301  siderophore synthetase component  27.06 
 
 		 562 aa  69.7  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3328  IucA/IucC family protein  25.55 
 
 		 614 aa  69.7  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.935658 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1845  IucA/IucC family protein  24.02 
 
 		 613 aa  68.2  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.330256  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2210  hypothetical protein  24.15 
 
 		 585 aa  65.5  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2249  hypothetical protein  24.15 
 
 		 585 aa  65.5  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0215  IucA/IucC family protein  28.12 
 
 		 645 aa  64.7  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  27.44 
 
 		 1148 aa  64.3  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1779  hypothetical protein  22.47 
 
 		 585 aa  63.9  0.000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.762831  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2302  siderophore synthetase component  27.63 
 
 		 609 aa  63.5  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.867655  normal  0.869204 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1113  IucA/IucC  26.8 
 
 		 608 aa  63.5  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  29.19 
 
 		 1153 aa  63.5  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00878  siderophore biosynthesis protein  27.11 
 
 		 611 aa  62.8  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0338478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2439  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  23.66 
 
 		 604 aa  62  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00876  putative siderophore biosynthesis protein  25.25 
 
 		 629 aa  61.6  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0231635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4392  IucA/IucC  27.16 
 
 		 596 aa  61.6  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2677  IucA/IucC family protein  26.84 
 
 		 628 aa  60.5  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.211511  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0591  siderophore biosynthesis protein  22.82 
 
 		 810 aa  60.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1808  IucA/IucC family protein  27.27 
 
 		 601 aa  60.1  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.653544  normal  0.276743 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3331  IucA/IucC family protein  26.55 
 
 		 601 aa  60.1  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3734  IucA/IucC family protein  27.16 
 
 		 563 aa  59.3  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0245205  normal  0.144633 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3255  IucA/IucC family protein  30.95 
 
 		 621 aa  58.9  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1781  hypothetical protein  23.42 
 
 		 653 aa  58.5  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3522  IucA/IucC family protein  25.27 
 
 		 610 aa  58.5  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2632  IucA/IucC family protein  25.18 
 
 		 593 aa  58.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0949  IucA/IucC family protein  27.63 
 
 		 577 aa  57.8  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3334  IucA/IucC family protein  26.83 
 
 		 591 aa  55.8  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0136  siderophore biosynthesis protein  21.12 
 
 		 819 aa  55.8  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1071  IucA/IucC family protein  26.96 
 
 		 613 aa  55.1  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.549269  normal  0.885774 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0107  IucA/IucC family protein  25.9 
 
 		 578 aa  55.1  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0111  IucA/IucC family protein  25.9 
 
 		 578 aa  55.1  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2538  IucA/IucC family protein  23.03 
 
 		 604 aa  55.1  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.836144  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0407  IucA/IucC  27.61 
 
 		 601 aa  53.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27175  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2737  IucA/IucC family protein  27.44 
 
 		 596 aa  53.5  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425518  normal  0.263271 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2548  IucA/IucC family protein  27.3 
 
 		 596 aa  52.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.507194 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3346  petrobactin biosynthesis protein AsbA  21.13 
 
 		 602 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00585589  hitchhiker  0.0000000000000409747 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2674  IucA/IucC family protein  24.49 
 
 		 618 aa  52.8  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.247069  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0920  IucA/IucC family protein  26.35 
 
 		 582 aa  52  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0218  IucA/IucC family protein  23.78 
 
 		 621 aa  51.2  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1795  siderophore biosynthesis protein  23.24 
 
 		 602 aa  50.8  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2837  IucA/IucC  25.47 
 
 		 606 aa  50.8  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.296013  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1983  petrobactin biosynthesis protein AsbA  21.99 
 
 		 602 aa  50.8  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0967971  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2837  IucA/IucC family protein  20.71 
 
 		 607 aa  50.8  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0947  IucA/IucC family protein  24.56 
 
 		 574 aa  50.8  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.251332  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00879  siderophore biosynthesis protein  27.47 
 
 		 589 aa  50.1  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0128879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2584  IucA/IucC  23.82 
 
 		 594 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0652267  decreased coverage  0.000722878 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4783  IucA/IucC  27.03 
 
 		 610 aa  50.4  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0288  IucA/IucC family protein  23.81 
 
 		 635 aa  50.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3523  IucA/IucC family protein  22.97 
 
 		 615 aa  49.7  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0712  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  25.16 
 
 		 582 aa  50.1  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4632  aerobactin synthase, IucC component  26.97 
 
 		 580 aa  50.4  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0658  IucA/IucC family protein  26.04 
 
 		 616 aa  49.3  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.577175  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0192  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  25.16 
 
 		 582 aa  49.7  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000752976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0784  IucA/IucC family protein  25.16 
 
 		 582 aa  49.7  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3180  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  27.6 
 
 		 580 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5060  IucA/IucC family protein  26.67 
 
 		 615 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00130311 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4016  IucA/IucC family protein  26.54 
 
 		 595 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0306734  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3174  IucA/IucC family protein  20.75 
 
 		 615 aa  48.9  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.443243  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2016  petrobactin biosynthesis protein AsbA  23.24 
 
 		 602 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2796000000000001e-41 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>