141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS00879 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS00879  siderophore biosynthesis protein  100 
 
 		 589 aa  1188    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0128879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1112  IucA/IucC  62.01 
 
 		 617 aa  726    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28831  normal  0.852167 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  43.13 
 
 		 1148 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2674  IucA/IucC family protein  39.36 
 
 		 618 aa  396  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.247069  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2587  IucA/IucC  39.15 
 
 		 619 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.296644  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0108  IucA/IucC family protein  36.71 
 
 		 592 aa  378  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0112  IucA/IucC family protein  36.71 
 
 		 592 aa  378  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1796  siderophore biosynthesis protein  32.99 
 
 		 610 aa  363  4e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1982  siderophore biosynthesis protein  32.49 
 
 		 612 aa  360  5e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1813  siderophore biosynthesis protein  32.49 
 
 		 610 aa  360  6e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00844264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1839  siderophore biosynthesis protein  32.49 
 
 		 610 aa  359  7e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2017  petrobactin biosynthesis protein AsbB  32.49 
 
 		 610 aa  359  7e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0614699999999996e-42 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1984  petrobactin biosynthesis protein AsbB  32.37 
 
 		 612 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.216331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3345  petrobactin biosynthesis protein AsbB  32.37 
 
 		 612 aa  355  8.999999999999999e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0268839  hitchhiker  0.0000000000000416803 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  40.52 
 
 		 1153 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1845  IucA/IucC family protein  31.68 
 
 		 613 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.330256  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  36.76 
 
 		 998 aa  253  6e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  36.4 
 
 		 998 aa  251  3e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4393  IucA/IucC  35.25 
 
 		 577 aa  251  3e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2631  IucA/IucC family protein  32.85 
 
 		 577 aa  243  6e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3523  IucA/IucC family protein  31.03 
 
 		 615 aa  240  5e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  36.61 
 
 		 991 aa  239  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2301  siderophore synthetase component  35.43 
 
 		 562 aa  234  4.0000000000000004e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1071  IucA/IucC family protein  34.33 
 
 		 613 aa  219  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.549269  normal  0.885774 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3174  IucA/IucC family protein  26.51 
 
 		 615 aa  208  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.443243  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2833  IucA/IucC  26.82 
 
 		 813 aa  206  8e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76703  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0594  siderophore biosynthesis protein  27.66 
 
 		 639 aa  206  9e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00413673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0288  IucA/IucC family protein  30.27 
 
 		 635 aa  204  3e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0407  IucA/IucC  30.96 
 
 		 601 aa  204  5e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27175  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1811  IucA/IucC family protein  32.1 
 
 		 599 aa  201  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0218  IucA/IucC family protein  29.12 
 
 		 621 aa  196  8.000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2837  IucA/IucC family protein  28.78 
 
 		 607 aa  195  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3255  IucA/IucC family protein  29.23 
 
 		 621 aa  192  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4292  IucA/IucC family protein  30.87 
 
 		 597 aa  192  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489466  hitchhiker  0.00330556 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5060  IucA/IucC family protein  34.81 
 
 		 615 aa  192  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00130311 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1452  IucA/IucC family protein  27.66 
 
 		 629 aa  188  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  31.36 
 
 		 842 aa  187  5e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3462  IucA/IucC family protein  30.38 
 
 		 594 aa  187  7e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.479032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1518  IucA/IucC family protein  27.66 
 
 		 631 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.918024 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3328  IucA/IucC family protein  28.38 
 
 		 614 aa  186  1.0000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.935658 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1508  IucA/IucC family protein  27.25 
 
 		 631 aa  182  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1654  IucA/IucC family protein  27.37 
 
 		 642 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000012306 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3032  siderophore biosynthesis protein, putative  27.7 
 
 		 601 aa  182  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0515  IucA/IucC family protein  29.67 
 
 		 625 aa  181  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0920  IucA/IucC family protein  29.84 
 
 		 582 aa  181  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2737  IucA/IucC family protein  31.7 
 
 		 596 aa  181  4e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425518  normal  0.263271 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2413  IucA/IucC family protein  27.25 
 
 		 642 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2710  IucA/IucC family protein  27.16 
 
 		 642 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2732  IucA/IucC family protein  27.42 
 
 		 642 aa  178  3e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00744667  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2811  IucA/IucC family protein  26.95 
 
 		 642 aa  177  7e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2836  IucA/IucC family protein  27.4 
 
 		 608 aa  176  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4632  aerobactin synthase, IucC component  29.4 
 
 		 580 aa  171  3e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2548  IucA/IucC family protein  30.31 
 
 		 596 aa  171  5e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.507194 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3180  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  29.58 
 
 		 580 aa  171  5e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0949  IucA/IucC family protein  29.81 
 
 		 577 aa  169  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2544  IucA/IucC family protein  25.34 
 
 		 614 aa  168  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2445  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  25.15 
 
 		 614 aa  164  4.0000000000000004e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0712  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  28.07 
 
 		 582 aa  158  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0192  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  28.07 
 
 		 582 aa  158  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000752976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0784  IucA/IucC family protein  28.07 
 
 		 582 aa  158  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0199  IucA/IucC family protein  32.45 
 
 		 602 aa  157  4e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0412549 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0136  siderophore biosynthesis protein  24.73 
 
 		 819 aa  155  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2439  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  25.69 
 
 		 604 aa  154  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1801  IucA/IucC family protein  31.18 
 
 		 799 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000155987  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2538  IucA/IucC family protein  25.27 
 
 		 604 aa  148  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.836144  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2658  IucA/IucC family protein  27.83 
 
 		 572 aa  148  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.539637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1812  siderophore synthetase component, IucA/IucC  23.11 
 
 		 578 aa  139  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0658  IucA/IucC family protein  30.39 
 
 		 616 aa  139  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.577175  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4058  IucA/IucC  32.1 
 
 		 716 aa  135  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.309342  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3906  IucA/IucC family protein  28.57 
 
 		 633 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1279  hypothetical protein  25.5 
 
 		 580 aa  110  6e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1280  hypothetical protein  25.06 
 
 		 580 aa  109  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3734  IucA/IucC family protein  29.74 
 
 		 563 aa  108  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0245205  normal  0.144633 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3682  IucA/IucC  28.16 
 
 		 637 aa  102  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0635  putative siderophore biosynthesis protein  26.76 
 
 		 610 aa  99.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.809608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0888  IucA/IucC family protein  28 
 
 		 720 aa  95.9  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0181  IucA/IucC family protein  29.58 
 
 		 655 aa  90.9  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0174  IucA/IucC family protein  27.89 
 
 		 655 aa  86.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1652  siderophore synthase  21.54 
 
 		 588 aa  83.2  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2846  FrgA protein  21.29 
 
 		 575 aa  79.7  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2715  FrgA protein  21.94 
 
 		 575 aa  80.1  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0718  iron transporter  28.14 
 
 		 613 aa  79  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0698719 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2672  IucA/IucC family protein  26.63 
 
 		 637 aa  75.9  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3092  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  30.17 
 
 		 587 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0107  IucA/IucC family protein  24.05 
 
 		 578 aa  74.3  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0111  IucA/IucC family protein  24.05 
 
 		 578 aa  74.3  0.000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1113  IucA/IucC  27.8 
 
 		 608 aa  72.8  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2212  hypothetical protein  22.25 
 
 		 656 aa  70.9  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2251  hypothetical protein  22.25 
 
 		 656 aa  70.9  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0105  IucA/IucC family protein  23.16 
 
 		 584 aa  70.5  0.00000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.379013  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0109  IucA/IucC family protein  23.16 
 
 		 584 aa  70.5  0.00000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110366  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6950  IucA/IucC family protein  26.09 
 
 		 587 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01930  vibrioferrin biosynthesis protein PvsB  28.99 
 
 		 600 aa  68.9  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00878  siderophore biosynthesis protein  26.14 
 
 		 611 aa  67.4  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0338478  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00876  putative siderophore biosynthesis protein  28.12 
 
 		 629 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0231635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4783  IucA/IucC  27.89 
 
 		 610 aa  65.1  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1781  hypothetical protein  21.61 
 
 		 653 aa  64.3  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5062  IucA/IucC family protein  28.49 
 
 		 588 aa  64.3  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806169 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01928  iron transporter  26.38 
 
 		 576 aa  63.9  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2837  IucA/IucC  24.11 
 
 		 606 aa  62.4  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.296013  normal  0.292104 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>