135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2836 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2837  IucA/IucC family protein  58.46 
 
 		 607 aa  744    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  53.79 
 
 		 842 aa  659    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2836  IucA/IucC family protein  100 
 
 		 608 aa  1274    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2445  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  53.89 
 
 		 614 aa  667    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2544  IucA/IucC family protein  54.05 
 
 		 614 aa  669    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3462  IucA/IucC family protein  49.83 
 
 		 594 aa  616  1e-175  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.479032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2811  IucA/IucC family protein  50.43 
 
 		 642 aa  609  1e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2710  IucA/IucC family protein  50.09 
 
 		 642 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2732  IucA/IucC family protein  49.34 
 
 		 642 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00744667  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1654  IucA/IucC family protein  50.34 
 
 		 642 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000012306 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2413  IucA/IucC family protein  50 
 
 		 642 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0288  IucA/IucC family protein  47.79 
 
 		 635 aa  598  1e-170  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4292  IucA/IucC family protein  48.6 
 
 		 597 aa  601  1e-170  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489466  hitchhiker  0.00330556 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1071  IucA/IucC family protein  48.4 
 
 		 613 aa  596  1e-169  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.549269  normal  0.885774 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1452  IucA/IucC family protein  48.47 
 
 		 629 aa  596  1e-169  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1518  IucA/IucC family protein  48.81 
 
 		 631 aa  594  1e-168  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.918024 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2548  IucA/IucC family protein  48.91 
 
 		 596 aa  594  1e-168  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.507194 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2439  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  48.64 
 
 		 604 aa  593  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2538  IucA/IucC family protein  48.47 
 
 		 604 aa  589  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.836144  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3032  siderophore biosynthesis protein, putative  48.47 
 
 		 601 aa  586  1e-166  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1508  IucA/IucC family protein  47.96 
 
 		 631 aa  586  1e-166  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2737  IucA/IucC family protein  47.84 
 
 		 596 aa  584  1.0000000000000001e-165  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425518  normal  0.263271 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0515  IucA/IucC family protein  48.75 
 
 		 625 aa  580  1e-164  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0136  siderophore biosynthesis protein  44.93 
 
 		 819 aa  561  1e-158  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0199  IucA/IucC family protein  46.53 
 
 		 602 aa  504  1e-141  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0412549 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1801  IucA/IucC family protein  43.2 
 
 		 799 aa  448  1.0000000000000001e-124  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000155987  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0594  siderophore biosynthesis protein  37.98 
 
 		 639 aa  448  1.0000000000000001e-124  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00413673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3174  IucA/IucC family protein  37.54 
 
 		 615 aa  414  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.443243  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0407  IucA/IucC  35.17 
 
 		 601 aa  358  9.999999999999999e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27175  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3328  IucA/IucC family protein  34.4 
 
 		 614 aa  352  8e-96  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.935658 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2833  IucA/IucC  33.39 
 
 		 813 aa  343  5e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76703  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0218  IucA/IucC family protein  31.39 
 
 		 621 aa  308  3e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1811  IucA/IucC family protein  30.63 
 
 		 599 aa  298  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3255  IucA/IucC family protein  31.96 
 
 		 621 aa  286  5e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5060  IucA/IucC family protein  31.71 
 
 		 615 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00130311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0658  IucA/IucC family protein  31.04 
 
 		 616 aa  269  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.577175  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0920  IucA/IucC family protein  30.67 
 
 		 582 aa  264  4e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0949  IucA/IucC family protein  29.46 
 
 		 577 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0712  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  28.78 
 
 		 582 aa  250  6e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0192  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  28.78 
 
 		 582 aa  249  8e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000752976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0784  IucA/IucC family protein  28.78 
 
 		 582 aa  249  8e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2658  IucA/IucC family protein  29.54 
 
 		 572 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.539637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3180  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  28.42 
 
 		 580 aa  243  9e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4632  aerobactin synthase, IucC component  28.6 
 
 		 580 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1812  siderophore synthetase component, IucA/IucC  27.58 
 
 		 578 aa  231  3e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4058  IucA/IucC  27.7 
 
 		 716 aa  215  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.309342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2587  IucA/IucC  27.81 
 
 		 619 aa  209  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.296644  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1984  petrobactin biosynthesis protein AsbB  24.38 
 
 		 612 aa  204  5e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.216331  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1112  IucA/IucC  26 
 
 		 617 aa  202  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28831  normal  0.852167 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3345  petrobactin biosynthesis protein AsbB  24.02 
 
 		 612 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0268839  hitchhiker  0.0000000000000416803 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1796  siderophore biosynthesis protein  24.38 
 
 		 610 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2674  IucA/IucC family protein  30.24 
 
 		 618 aa  200  6e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.247069  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1839  siderophore biosynthesis protein  23.67 
 
 		 610 aa  200  7.999999999999999e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1813  siderophore biosynthesis protein  23.67 
 
 		 610 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00844264  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2017  petrobactin biosynthesis protein AsbB  23.67 
 
 		 610 aa  200  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0614699999999996e-42 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1982  siderophore biosynthesis protein  23.67 
 
 		 612 aa  199  9e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  30.07 
 
 		 1148 aa  187  7e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00879  siderophore biosynthesis protein  27.4 
 
 		 589 aa  179  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0128879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1845  IucA/IucC family protein  22.97 
 
 		 613 aa  166  9e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.330256  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  25.33 
 
 		 1153 aa  159  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0108  IucA/IucC family protein  23.56 
 
 		 592 aa  145  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0112  IucA/IucC family protein  23.56 
 
 		 592 aa  145  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3523  IucA/IucC family protein  23.49 
 
 		 615 aa  144  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  25.28 
 
 		 998 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  24.55 
 
 		 991 aa  140  8.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4393  IucA/IucC  26.38 
 
 		 577 aa  140  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2301  siderophore synthetase component  25.81 
 
 		 562 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  24.6 
 
 		 998 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2631  IucA/IucC family protein  25.52 
 
 		 577 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1280  hypothetical protein  26.17 
 
 		 580 aa  106  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1279  hypothetical protein  25.23 
 
 		 580 aa  99.8  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0718  iron transporter  22.3 
 
 		 613 aa  89.4  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0698719 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1652  siderophore synthase  20.74 
 
 		 588 aa  89.7  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0105  IucA/IucC family protein  27.3 
 
 		 584 aa  87.8  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.379013  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0109  IucA/IucC family protein  27.3 
 
 		 584 aa  87.8  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110366  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2715  FrgA protein  23.69 
 
 		 575 aa  83.6  0.000000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2846  FrgA protein  23.88 
 
 		 575 aa  77.4  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4783  IucA/IucC  23.15 
 
 		 610 aa  75.9  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0585  IucA/IucC family protein  23.98 
 
 		 925 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0181  IucA/IucC family protein  22.87 
 
 		 655 aa  75.1  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3734  IucA/IucC family protein  22.03 
 
 		 563 aa  75.1  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0245205  normal  0.144633 
 
 
-
 
NC_003296  RS00878  siderophore biosynthesis protein  22.13 
 
 		 611 aa  75.1  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0338478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0174  IucA/IucC family protein  23.17 
 
 		 655 aa  74.7  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0107  IucA/IucC family protein  23.75 
 
 		 578 aa  72.8  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0111  IucA/IucC family protein  23.75 
 
 		 578 aa  72.8  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3733  IucA/IucC family protein  27.75 
 
 		 557 aa  68.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0935352  normal  0.031282 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3906  IucA/IucC family protein  21.74 
 
 		 633 aa  68.9  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3182  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucA  22.35 
 
 		 574 aa  67.8  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8365  putative iron transport protein  23.84 
 
 		 519 aa  67.4  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09330  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  25.47 
 
 		 592 aa  67  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0934837  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2971  IucA/IucC family protein  23.33 
 
 		 555 aa  67  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.963882 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0410  IucA/IucC  22.05 
 
 		 578 aa  66.6  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.4179  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3092  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  24.84 
 
 		 587 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0922  IucA/IucC family protein  20 
 
 		 581 aa  64.3  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.285296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001063  vibrioferrin amide bond forming protein PvsD  21.13 
 
 		 580 aa  62  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4634  aerobactin synthase, IucA component  21.83 
 
 		 574 aa  62  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01928  iron transporter  21.67 
 
 		 576 aa  62  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1113  IucA/IucC  22.92 
 
 		 608 aa  60.1  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3750  IucA/IucC family protein  23.44 
 
 		 599 aa  59.7  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1115  IucA/IucC  29.86 
 
 		 589 aa  58.9  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134793  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>