132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2413 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_3032  siderophore biosynthesis protein, putative  83.45 
 
 
601 aa  1046    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1452  IucA/IucC family protein  80.13 
 
 
629 aa  1061    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1518  IucA/IucC family protein  79.97 
 
 
631 aa  1054    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.918024 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1508  IucA/IucC family protein  78.35 
 
 
631 aa  1051    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2710  IucA/IucC family protein  93.61 
 
 
642 aa  1241    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2413  IucA/IucC family protein  100 
 
 
642 aa  1336    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2732  IucA/IucC family protein  94.07 
 
 
642 aa  1258    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00744667  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2439  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  56.76 
 
 
604 aa  688    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2811  IucA/IucC family protein  93.61 
 
 
642 aa  1244    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2538  IucA/IucC family protein  56.59 
 
 
604 aa  684    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.836144  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0136  siderophore biosynthesis protein  58.8 
 
 
819 aa  753    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1654  IucA/IucC family protein  93.61 
 
 
642 aa  1239    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000012306 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  49.05 
 
 
842 aa  628  1e-178  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2544  IucA/IucC family protein  52.83 
 
 
614 aa  628  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2445  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  52.86 
 
 
614 aa  624  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2836  IucA/IucC family protein  49.91 
 
 
608 aa  595  1e-169  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160458  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0288  IucA/IucC family protein  48.36 
 
 
635 aa  594  1e-168  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1071  IucA/IucC family protein  50 
 
 
613 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.549269  normal  0.885774 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0515  IucA/IucC family protein  48.83 
 
 
625 aa  583  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2548  IucA/IucC family protein  48.89 
 
 
596 aa  580  1e-164  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.507194 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2737  IucA/IucC family protein  48.72 
 
 
596 aa  578  1e-164  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425518  normal  0.263271 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4292  IucA/IucC family protein  47.72 
 
 
597 aa  577  1.0000000000000001e-163  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489466  hitchhiker  0.00330556 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3462  IucA/IucC family protein  47.04 
 
 
594 aa  568  1e-160  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.479032  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2837  IucA/IucC family protein  47.05 
 
 
607 aa  555  1e-156  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18665  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0199  IucA/IucC family protein  44.5 
 
 
602 aa  501  1e-140  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0412549 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1801  IucA/IucC family protein  44.24 
 
 
799 aa  484  1e-135  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000155987  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0594  siderophore biosynthesis protein  39.36 
 
 
639 aa  437  1e-121  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00413673  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3174  IucA/IucC family protein  37.73 
 
 
615 aa  409  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.443243  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0407  IucA/IucC  34.88 
 
 
601 aa  369  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27175  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3328  IucA/IucC family protein  33.84 
 
 
614 aa  364  3e-99  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.935658 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2833  IucA/IucC  34.07 
 
 
813 aa  335  1e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76703  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1811  IucA/IucC family protein  34.13 
 
 
599 aa  308  3e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0218  IucA/IucC family protein  32.46 
 
 
621 aa  306  8.000000000000001e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4632  aerobactin synthase, IucC component  29.19 
 
 
580 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0920  IucA/IucC family protein  30.34 
 
 
582 aa  270  4e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185756  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0949  IucA/IucC family protein  29.01 
 
 
577 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0658  IucA/IucC family protein  31.35 
 
 
616 aa  268  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.577175  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3180  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  29.01 
 
 
580 aa  268  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3255  IucA/IucC family protein  30.14 
 
 
621 aa  263  8.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0712  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  30.07 
 
 
582 aa  258  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0192  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  30.07 
 
 
582 aa  258  3e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000752976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0784  IucA/IucC family protein  30.07 
 
 
582 aa  258  3e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5060  IucA/IucC family protein  29.41 
 
 
615 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00130311 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2658  IucA/IucC family protein  28.57 
 
 
572 aa  239  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.539637  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1812  siderophore synthetase component, IucA/IucC  26.37 
 
 
578 aa  228  3e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4058  IucA/IucC  27.11 
 
 
716 aa  225  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.309342  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2587  IucA/IucC  27.79 
 
 
619 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.296644  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1796  siderophore biosynthesis protein  24.79 
 
 
610 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1839  siderophore biosynthesis protein  24.83 
 
 
610 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1982  siderophore biosynthesis protein  24.83 
 
 
612 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2017  petrobactin biosynthesis protein AsbB  24.83 
 
 
610 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0614699999999996e-42 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1813  siderophore biosynthesis protein  24.83 
 
 
610 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00844264  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2674  IucA/IucC family protein  28.24 
 
 
618 aa  213  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.247069  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1984  petrobactin biosynthesis protein AsbB  24.1 
 
 
612 aa  212  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.216331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3345  petrobactin biosynthesis protein AsbB  23.42 
 
 
612 aa  206  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0268839  hitchhiker  0.0000000000000416803 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1112  IucA/IucC  28.45 
 
 
617 aa  196  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28831  normal  0.852167 
 
 
-
 
NC_003296  RS00879  siderophore biosynthesis protein  27.25 
 
 
589 aa  180  7e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0128879  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1845  IucA/IucC family protein  23.39 
 
 
613 aa  177  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.330256  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  25.52 
 
 
1153 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  27.95 
 
 
1148 aa  170  9e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  27.1 
 
 
998 aa  162  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  27.16 
 
 
998 aa  160  5e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0108  IucA/IucC family protein  25.61 
 
 
592 aa  159  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0112  IucA/IucC family protein  25.61 
 
 
592 aa  159  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2301  siderophore synthetase component  23.27 
 
 
562 aa  156  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  25.94 
 
 
991 aa  150  7e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2631  IucA/IucC family protein  25.36 
 
 
577 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4393  IucA/IucC  24.77 
 
 
577 aa  139  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3523  IucA/IucC family protein  23.05 
 
 
615 aa  121  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1280  hypothetical protein  22.42 
 
 
580 aa  104  5e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1279  hypothetical protein  22.64 
 
 
580 aa  102  3e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3906  IucA/IucC family protein  23.19 
 
 
633 aa  93.2  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1652  siderophore synthase  20.35 
 
 
588 aa  89.4  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2715  FrgA protein  24.12 
 
 
575 aa  81.3  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3734  IucA/IucC family protein  22.11 
 
 
563 aa  80.9  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0245205  normal  0.144633 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0174  IucA/IucC family protein  23.1 
 
 
655 aa  80.1  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0718  iron transporter  23.61 
 
 
613 aa  79.7  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0698719 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0888  IucA/IucC family protein  23.8 
 
 
720 aa  78.2  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2846  FrgA protein  23.47 
 
 
575 aa  76.3  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0181  IucA/IucC family protein  21.28 
 
 
655 aa  74.7  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0635  putative siderophore biosynthesis protein  22.12 
 
 
610 aa  74.7  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.809608  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4783  IucA/IucC  22.54 
 
 
610 aa  69.3  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0410  IucA/IucC  23.62 
 
 
578 aa  69.3  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.4179  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3682  IucA/IucC  22.42 
 
 
637 aa  67  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3750  IucA/IucC family protein  22.67 
 
 
599 aa  62.4  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0585  IucA/IucC family protein  19.44 
 
 
925 aa  61.6  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3733  IucA/IucC family protein  25.08 
 
 
557 aa  58.5  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0935352  normal  0.031282 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1795  siderophore biosynthesis protein  20.06 
 
 
602 aa  57.4  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0105  IucA/IucC family protein  23.75 
 
 
584 aa  57.4  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.379013  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0109  IucA/IucC family protein  23.75 
 
 
584 aa  57.4  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110366  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1115  IucA/IucC  24.66 
 
 
589 aa  56.6  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134793  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3092  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  23.08 
 
 
587 aa  57  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09330  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  23.43 
 
 
592 aa  56.2  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0934837  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1838  siderophore biosynthesis protein  20.06 
 
 
602 aa  56.2  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.846084  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2837  IucA/IucC  21.56 
 
 
606 aa  56.6  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.296013  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1981  siderophore biosynthesis protein  20.06 
 
 
602 aa  56.2  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.978268  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1113  IucA/IucC  23.78 
 
 
608 aa  55.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01928  iron transporter  22.49 
 
 
576 aa  55.8  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3257  IucA/IucC family protein  23.7 
 
 
584 aa  55.8  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00878  siderophore biosynthesis protein  22.16 
 
 
611 aa  55.1  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0338478  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>