159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0586 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  100 
 
 		 1148 aa  2361    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  36.97 
 
 		 1153 aa  580  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00879  siderophore biosynthesis protein  43.13 
 
 		 589 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0128879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1112  IucA/IucC  44.29 
 
 		 617 aa  432  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28831  normal  0.852167 
 
 
-
 
NC_003296  RS00878  siderophore biosynthesis protein  42.69 
 
 		 611 aa  393  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0338478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2587  IucA/IucC  38.27 
 
 		 619 aa  386  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.296644  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2674  IucA/IucC family protein  38.55 
 
 		 618 aa  366  1e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.247069  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0108  IucA/IucC family protein  35.8 
 
 		 592 aa  351  6e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0112  IucA/IucC family protein  35.8 
 
 		 592 aa  351  6e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1113  IucA/IucC  39.52 
 
 		 608 aa  333  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3345  petrobactin biosynthesis protein AsbB  32.01 
 
 		 612 aa  317  6e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0268839  hitchhiker  0.0000000000000416803 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1984  petrobactin biosynthesis protein AsbB  32.14 
 
 		 612 aa  313  1e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.216331  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1813  siderophore biosynthesis protein  32.82 
 
 		 610 aa  310  1.0000000000000001e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00844264  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  37.79 
 
 		 998 aa  310  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1839  siderophore biosynthesis protein  32.35 
 
 		 610 aa  309  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1982  siderophore biosynthesis protein  32.82 
 
 		 612 aa  309  2.0000000000000002e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2017  petrobactin biosynthesis protein AsbB  32.35 
 
 		 610 aa  309  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0614699999999996e-42 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  36.95 
 
 		 998 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1796  siderophore biosynthesis protein  32 
 
 		 610 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1845  IucA/IucC family protein  31.37 
 
 		 613 aa  292  3e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.330256  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  36.02 
 
 		 991 aa  290  9e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2631  IucA/IucC family protein  32.92 
 
 		 577 aa  280  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4393  IucA/IucC  32.14 
 
 		 577 aa  276  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2301  siderophore synthetase component  34 
 
 		 562 aa  275  3e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0107  IucA/IucC family protein  32.04 
 
 		 578 aa  273  1e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0111  IucA/IucC family protein  32.04 
 
 		 578 aa  273  1e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3523  IucA/IucC family protein  31.6 
 
 		 615 aa  251  4e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1811  IucA/IucC family protein  30.77 
 
 		 599 aa  214  7e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5060  IucA/IucC family protein  30.44 
 
 		 615 aa  210  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00130311 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3255  IucA/IucC family protein  29.88 
 
 		 621 aa  209  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0920  IucA/IucC family protein  30.9 
 
 		 582 aa  209  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2833  IucA/IucC  28.5 
 
 		 813 aa  207  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76703  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0594  siderophore biosynthesis protein  27.78 
 
 		 639 aa  205  3e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00413673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0407  IucA/IucC  28.17 
 
 		 601 aa  198  5.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27175  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0712  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  29.97 
 
 		 582 aa  197  9e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0718  iron transporter  29.95 
 
 		 613 aa  197  1e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0698719 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3328  IucA/IucC family protein  28.95 
 
 		 614 aa  197  1e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.935658 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0192  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  29.82 
 
 		 582 aa  197  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000752976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0784  IucA/IucC family protein  29.82 
 
 		 582 aa  197  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0410  IucA/IucC  30.36 
 
 		 578 aa  191  8e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.4179  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09310  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  30.89 
 
 		 586 aa  190  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00047621  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3331  IucA/IucC family protein  30.44 
 
 		 601 aa  189  2e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4292  IucA/IucC family protein  28.15 
 
 		 597 aa  189  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489466  hitchhiker  0.00330556 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2837  IucA/IucC family protein  27.62 
 
 		 607 aa  188  6e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2836  IucA/IucC family protein  30.07 
 
 		 608 aa  186  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2837  IucA/IucC  28.6 
 
 		 606 aa  181  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.296013  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01928  iron transporter  27.94 
 
 		 576 aa  180  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0288  IucA/IucC family protein  29.6 
 
 		 635 aa  181  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3522  IucA/IucC family protein  29.61 
 
 		 610 aa  179  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2732  IucA/IucC family protein  28.71 
 
 		 642 aa  178  4e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00744667  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1508  IucA/IucC family protein  28.36 
 
 		 631 aa  178  6e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2548  IucA/IucC family protein  29.12 
 
 		 596 aa  178  6e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.507194 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2439  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  27.09 
 
 		 604 aa  178  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2710  IucA/IucC family protein  28.87 
 
 		 642 aa  177  9e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  27.1 
 
 		 842 aa  177  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3750  IucA/IucC family protein  33.18 
 
 		 599 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1452  IucA/IucC family protein  28.34 
 
 		 629 aa  176  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0136  siderophore biosynthesis protein  25.72 
 
 		 819 aa  175  3.9999999999999995e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2811  IucA/IucC family protein  28.59 
 
 		 642 aa  175  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0515  IucA/IucC family protein  29.1 
 
 		 625 aa  174  6.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2538  IucA/IucC family protein  26.92 
 
 		 604 aa  174  6.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.836144  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3032  siderophore biosynthesis protein, putative  28.06 
 
 		 601 aa  174  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8365  putative iron transport protein  33.49 
 
 		 519 aa  174  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1071  IucA/IucC family protein  28.23 
 
 		 613 aa  174  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.549269  normal  0.885774 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0591  siderophore biosynthesis protein  27.37 
 
 		 810 aa  174  1e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0218  IucA/IucC family protein  29.86 
 
 		 621 aa  173  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2737  IucA/IucC family protein  29.3 
 
 		 596 aa  174  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425518  normal  0.263271 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1518  IucA/IucC family protein  28.72 
 
 		 631 aa  172  5e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.918024 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1654  IucA/IucC family protein  28.12 
 
 		 642 aa  171  6e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000012306 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4783  IucA/IucC  28.63 
 
 		 610 aa  171  8e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0215  IucA/IucC family protein  27.69 
 
 		 645 aa  170  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3462  IucA/IucC family protein  25.65 
 
 		 594 aa  170  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.479032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2413  IucA/IucC family protein  27.95 
 
 		 642 aa  169  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3334  IucA/IucC family protein  30.54 
 
 		 591 aa  170  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001063  vibrioferrin amide bond forming protein PvsD  27.22 
 
 		 580 aa  169  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2658  IucA/IucC family protein  28.77 
 
 		 572 aa  169  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.539637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1808  IucA/IucC family protein  30.72 
 
 		 601 aa  168  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.653544  normal  0.276743 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2544  IucA/IucC family protein  27.54 
 
 		 614 aa  168  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2445  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  27.54 
 
 		 614 aa  167  8e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0949  IucA/IucC family protein  30.52 
 
 		 577 aa  164  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3180  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  29.38 
 
 		 580 aa  162  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1276  IucA/IucC  26.18 
 
 		 684 aa  161  6e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3346  petrobactin biosynthesis protein AsbA  25.85 
 
 		 602 aa  159  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00585589  hitchhiker  0.0000000000000409747 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3174  IucA/IucC family protein  25.52 
 
 		 615 aa  159  4e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.443243  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1983  petrobactin biosynthesis protein AsbA  26.37 
 
 		 602 aa  158  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0967971  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1844  IucA/IucC family protein  26.95 
 
 		 602 aa  158  6e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0027586  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4632  aerobactin synthase, IucC component  29.52 
 
 		 580 aa  158  6e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2016  petrobactin biosynthesis protein AsbA  26.25 
 
 		 602 aa  158  7e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2796000000000001e-41 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1838  siderophore biosynthesis protein  26.49 
 
 		 602 aa  157  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.846084  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1812  siderophore biosynthesis protein  26.25 
 
 		 602 aa  157  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000021038  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1981  siderophore biosynthesis protein  26.49 
 
 		 602 aa  157  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.978268  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3094  iron transporter  29.94 
 
 		 584 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2971  IucA/IucC family protein  32.53 
 
 		 555 aa  155  5.9999999999999996e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.963882 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1795  siderophore biosynthesis protein  26.49 
 
 		 602 aa  154  7e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3139  IucA/IucC family protein  29.63 
 
 		 586 aa  153  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2632  IucA/IucC family protein  29.87 
 
 		 593 aa  153  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4392  IucA/IucC  29.78 
 
 		 596 aa  152  4e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1812  siderophore synthetase component, IucA/IucC  24.62 
 
 		 578 aa  150  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3257  IucA/IucC family protein  26.09 
 
 		 584 aa  149  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0660  IucA/IucC family protein  30.47 
 
 		 570 aa  147  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00702947  normal  0.916687 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>