131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3139 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3139  IucA/IucC family protein  100 
 
 
586 aa  1200    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001063  vibrioferrin amide bond forming protein PvsD  46.75 
 
 
580 aa  500  1e-140  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3094  iron transporter  47.81 
 
 
584 aa  491  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09310  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  47.12 
 
 
586 aa  483  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00047621  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01928  iron transporter  45.11 
 
 
576 aa  472  1e-132  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1276  IucA/IucC  37.87 
 
 
684 aa  407  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4783  IucA/IucC  37.06 
 
 
610 aa  358  1.9999999999999998e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0718  iron transporter  34.16 
 
 
613 aa  339  9.999999999999999e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0698719 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2584  IucA/IucC  33.84 
 
 
594 aa  269  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0652267  decreased coverage  0.000722878 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3750  IucA/IucC family protein  35.9 
 
 
599 aa  243  7e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2677  IucA/IucC family protein  33.28 
 
 
628 aa  236  9e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.211511  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8365  putative iron transport protein  34.69 
 
 
519 aa  236  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2971  IucA/IucC family protein  33.39 
 
 
555 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.963882 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0107  IucA/IucC family protein  29.01 
 
 
578 aa  189  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0111  IucA/IucC family protein  29.01 
 
 
578 aa  189  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0410  IucA/IucC  29.15 
 
 
578 aa  181  4e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.4179  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4392  IucA/IucC  27.65 
 
 
596 aa  170  7e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2302  siderophore synthetase component  27.91 
 
 
609 aa  168  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.867655  normal  0.869204 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2837  IucA/IucC  26.44 
 
 
606 aa  168  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.296013  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2632  IucA/IucC family protein  26.79 
 
 
593 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0215  IucA/IucC family protein  29.68 
 
 
645 aa  164  4.0000000000000004e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1983  petrobactin biosynthesis protein AsbA  25.25 
 
 
602 aa  162  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0967971  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3334  IucA/IucC family protein  28.51 
 
 
591 aa  161  3e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3346  petrobactin biosynthesis protein AsbA  25.25 
 
 
602 aa  159  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00585589  hitchhiker  0.0000000000000409747 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1795  siderophore biosynthesis protein  24.75 
 
 
602 aa  158  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1113  IucA/IucC  27.79 
 
 
608 aa  158  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1838  siderophore biosynthesis protein  24.92 
 
 
602 aa  157  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.846084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1981  siderophore biosynthesis protein  24.92 
 
 
602 aa  157  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.978268  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2016  petrobactin biosynthesis protein AsbA  24.75 
 
 
602 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2796000000000001e-41 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  29.63 
 
 
1148 aa  153  7e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1812  siderophore biosynthesis protein  24.58 
 
 
602 aa  152  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000021038  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4016  IucA/IucC family protein  28.01 
 
 
595 aa  150  9e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0306734  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3182  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucA  30.35 
 
 
574 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1844  IucA/IucC family protein  24.26 
 
 
602 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0027586  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1808  IucA/IucC family protein  27.3 
 
 
601 aa  148  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.653544  normal  0.276743 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4634  aerobactin synthase, IucA component  28.8 
 
 
574 aa  148  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00878  siderophore biosynthesis protein  28.48 
 
 
611 aa  147  7.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0338478  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3760  IucA/IucC family protein  27.56 
 
 
594 aa  146  9e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.130185 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4055  IucA/IucC family protein  28.08 
 
 
594 aa  146  9e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0250939  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0947  IucA/IucC family protein  29.85 
 
 
574 aa  145  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.251332  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3257  IucA/IucC family protein  27.45 
 
 
584 aa  145  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3522  IucA/IucC family protein  27.04 
 
 
610 aa  143  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  30.66 
 
 
1153 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0591  siderophore biosynthesis protein  24.46 
 
 
810 aa  139  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124028  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3331  IucA/IucC family protein  27.15 
 
 
601 aa  139  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0585  IucA/IucC family protein  27.55 
 
 
925 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3172  IucA/IucC family protein  22.65 
 
 
818 aa  130  6e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0714  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucA  30.81 
 
 
590 aa  128  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0786  IucA/IucC family protein  30.81 
 
 
590 aa  128  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5062  IucA/IucC family protein  29.78 
 
 
588 aa  128  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806169 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0660  IucA/IucC family protein  27.36 
 
 
570 aa  125  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00702947  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0922  IucA/IucC family protein  32.1 
 
 
581 aa  124  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.285296  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1781  hypothetical protein  25.53 
 
 
653 aa  100  5e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2212  hypothetical protein  25.12 
 
 
656 aa  99.4  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2251  hypothetical protein  25.12 
 
 
656 aa  99.4  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1814  siderophore synthetase component, IucA/IucC  21.59 
 
 
560 aa  94.4  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00455454  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0174  IucA/IucC family protein  26.18 
 
 
655 aa  87  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0181  IucA/IucC family protein  25.87 
 
 
655 aa  81.6  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0108  IucA/IucC family protein  24.85 
 
 
592 aa  81.6  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0112  IucA/IucC family protein  24.85 
 
 
592 aa  81.6  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1652  siderophore synthase  24.76 
 
 
588 aa  80.1  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2833  IucA/IucC  24.78 
 
 
813 aa  73.9  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76703  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0594  siderophore biosynthesis protein  22.84 
 
 
639 aa  73.2  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00413673  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4056  IucA/IucC  26.38 
 
 
672 aa  71.6  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.512402  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2587  IucA/IucC  24.46 
 
 
619 aa  70.5  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.296644  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3523  IucA/IucC family protein  24.57 
 
 
615 aa  70.5  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2674  IucA/IucC family protein  23.43 
 
 
618 aa  70.1  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.247069  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0407  IucA/IucC  25.21 
 
 
601 aa  68.6  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27175  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1811  IucA/IucC family protein  25.61 
 
 
599 aa  68.9  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3174  IucA/IucC family protein  20.25 
 
 
615 aa  67.8  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.443243  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3734  IucA/IucC family protein  24.24 
 
 
563 aa  67  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0245205  normal  0.144633 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1779  hypothetical protein  21.72 
 
 
585 aa  65.5  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.762831  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2445  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  22.82 
 
 
614 aa  65.5  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1801  IucA/IucC family protein  25.74 
 
 
799 aa  64.3  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000155987  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0888  IucA/IucC family protein  25.95 
 
 
720 aa  63.9  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0920  IucA/IucC family protein  25 
 
 
582 aa  63.9  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185756  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0218  IucA/IucC family protein  24.56 
 
 
621 aa  63.2  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3255  IucA/IucC family protein  27.27 
 
 
621 aa  63.2  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2544  IucA/IucC family protein  22.97 
 
 
614 aa  63.5  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0949  IucA/IucC family protein  25 
 
 
577 aa  60.5  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0515  IucA/IucC family protein  22.28 
 
 
625 aa  60.5  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3180  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  24.24 
 
 
580 aa  60.5  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2301  siderophore synthetase component  23.97 
 
 
562 aa  60.1  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2737  IucA/IucC family protein  24.02 
 
 
596 aa  60.1  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425518  normal  0.263271 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2210  hypothetical protein  21.22 
 
 
585 aa  59.3  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2249  hypothetical protein  21.22 
 
 
585 aa  59.3  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0712  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  25.22 
 
 
582 aa  59.3  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0192  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  25.22 
 
 
582 aa  58.9  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000752976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0784  IucA/IucC family protein  25.22 
 
 
582 aa  58.9  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4632  aerobactin synthase, IucC component  24.24 
 
 
580 aa  58.9  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1812  siderophore synthetase component, IucA/IucC  22.93 
 
 
578 aa  58.9  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  21.92 
 
 
842 aa  58.5  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  23.51 
 
 
991 aa  58.9  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2837  IucA/IucC family protein  23.19 
 
 
607 aa  58.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18665  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1071  IucA/IucC family protein  24.26 
 
 
613 aa  57  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.549269  normal  0.885774 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2631  IucA/IucC family protein  25.37 
 
 
577 aa  57  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3328  IucA/IucC family protein  23.1 
 
 
614 aa  56.6  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.935658 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  25.35 
 
 
998 aa  57  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2658  IucA/IucC family protein  24.3 
 
 
572 aa  56.2  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.539637  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2836  IucA/IucC family protein  21.1 
 
 
608 aa  55.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160458  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>