221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0585 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_0585  IucA/IucC family protein  100 
 
 
925 aa  1915    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0947  IucA/IucC family protein  37.48 
 
 
574 aa  361  3e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.251332  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3182  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucA  37.39 
 
 
574 aa  358  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0922  IucA/IucC family protein  38.08 
 
 
581 aa  358  2.9999999999999997e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.285296  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4634  aerobactin synthase, IucA component  37.2 
 
 
574 aa  353  7e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0786  IucA/IucC family protein  37.07 
 
 
590 aa  336  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0714  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucA  37.07 
 
 
590 aa  336  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3257  IucA/IucC family protein  34.83 
 
 
584 aa  335  3e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5062  IucA/IucC family protein  33.33 
 
 
588 aa  298  4e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806169 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1814  siderophore synthetase component, IucA/IucC  32.42 
 
 
560 aa  292  2e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00455454  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2837  IucA/IucC  33.39 
 
 
606 aa  281  4e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.296013  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3331  IucA/IucC family protein  31.4 
 
 
601 aa  249  1e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0215  IucA/IucC family protein  30.22 
 
 
645 aa  234  5e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1983  petrobactin biosynthesis protein AsbA  30.1 
 
 
602 aa  234  6e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0967971  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3346  petrobactin biosynthesis protein AsbA  30.22 
 
 
602 aa  233  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00585589  hitchhiker  0.0000000000000409747 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0410  IucA/IucC  31.83 
 
 
578 aa  233  2e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.4179  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1844  IucA/IucC family protein  31.79 
 
 
602 aa  229  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0027586  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1838  siderophore biosynthesis protein  30.8 
 
 
602 aa  229  3e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.846084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1981  siderophore biosynthesis protein  30.8 
 
 
602 aa  229  3e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.978268  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2016  petrobactin biosynthesis protein AsbA  30.8 
 
 
602 aa  228  3e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2796000000000001e-41 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1795  siderophore biosynthesis protein  30.6 
 
 
602 aa  227  8e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1812  siderophore biosynthesis protein  30.6 
 
 
602 aa  225  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000021038  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2302  siderophore synthetase component  30.31 
 
 
609 aa  225  3e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.867655  normal  0.869204 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3334  IucA/IucC family protein  29.03 
 
 
591 aa  225  3e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0591  siderophore biosynthesis protein  26.23 
 
 
810 aa  219  2e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124028  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4392  IucA/IucC  31.35 
 
 
596 aa  216  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4016  IucA/IucC family protein  31.08 
 
 
595 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0306734  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3522  IucA/IucC family protein  28.57 
 
 
610 aa  202  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4035  hypothetical protein  42.15 
 
 
316 aa  201  6e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.610793  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1808  IucA/IucC family protein  30.62 
 
 
601 aa  200  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.653544  normal  0.276743 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4056  IucA/IucC  26.96 
 
 
672 aa  199  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.512402  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2632  IucA/IucC family protein  27.87 
 
 
593 aa  200  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3760  IucA/IucC family protein  31.24 
 
 
594 aa  197  9e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.130185 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3172  IucA/IucC family protein  28.09 
 
 
818 aa  197  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1813  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  41.2 
 
 
274 aa  193  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.419117  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25460  hypothetical protein  41.7 
 
 
352 aa  192  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4055  IucA/IucC family protein  30.92 
 
 
594 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0250939  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4792  hypothetical protein  39.83 
 
 
338 aa  191  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0336601  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1621  hypothetical protein  40.25 
 
 
338 aa  191  8e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185713 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3942  hypothetical protein  40.81 
 
 
337 aa  188  5e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.291769  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1592  hypothetical protein  41.07 
 
 
336 aa  187  7e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0260061  normal  0.0225725 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1166  hypothetical protein  41.1 
 
 
338 aa  187  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74147  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1646  hypothetical protein  41.1 
 
 
338 aa  187  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1543  hypothetical protein  41.07 
 
 
338 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1564  hypothetical protein  41.07 
 
 
338 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31691  normal  0.229802 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2826  PvdYII  41.78 
 
 
337 aa  186  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5061  hypothetical protein  45.08 
 
 
354 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00103312 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2862  hypothetical protein  35.01 
 
 
328 aa  179  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.276239  normal  0.0557452 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0660  IucA/IucC family protein  31.86 
 
 
570 aa  178  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00702947  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1824  hypothetical protein  39.57 
 
 
364 aa  177  6e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0274  siderophore biosynthesis protein IucB (N6-hydroxylysine acetyl transferase)  41.88 
 
 
303 aa  177  8e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173921  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2789  hypothetical protein  40.36 
 
 
357 aa  176  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.112907 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5729  acetylase  40.09 
 
 
349 aa  175  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.404247  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0107  IucA/IucC family protein  25.86 
 
 
578 aa  175  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0111  IucA/IucC family protein  25.86 
 
 
578 aa  175  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4748  hypothetical protein  44.1 
 
 
400 aa  174  5e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.586037 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4806  N6-hydroxylysine O-acetyltransferase protein  45.13 
 
 
343 aa  174  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.223021  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3739  hypothetical protein  40.95 
 
 
344 aa  173  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.531376  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3181  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  38.43 
 
 
315 aa  172  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3256  hypothetical protein  47.03 
 
 
357 aa  172  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3564  siderophore biosynthesis protein  40 
 
 
337 aa  171  5e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0921  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  34.22 
 
 
316 aa  171  7e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.62624  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4633  N(6)-hydroxylysine O-acetyltransferase, aerobactin biosynthetic  39.13 
 
 
315 aa  170  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1682  hypothetical protein  38.82 
 
 
339 aa  168  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0948  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  38.91 
 
 
315 aa  167  8e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.633043  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4245  siderophore biosynthesis protein, putative  41.97 
 
 
205 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1092  putative acetylase  37.21 
 
 
366 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.474828 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0785  putative siderophore biosynthesis protein IucB  34.21 
 
 
316 aa  164  8.000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0191  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  33.96 
 
 
316 aa  164  9e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000449097 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0713  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  33.96 
 
 
316 aa  164  9e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3811  siderophore biosynthesis protein  38.12 
 
 
337 aa  164  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3320  putative siderophore biosynthesis protein  37.77 
 
 
380 aa  161  5e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0248153 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4037  hypothetical protein  35.59 
 
 
341 aa  160  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0718  iron transporter  27.25 
 
 
613 aa  159  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0698719 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3727  hypothetical protein  36.04 
 
 
366 aa  153  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.752292  normal  0.168128 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1346  hypothetical protein  36.89 
 
 
347 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.299655  normal  0.123425 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  26.24 
 
 
1148 aa  145  4e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10080  siderophore biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04450)  35.59 
 
 
503 aa  143  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.277497  normal  0.331437 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00608  conserved hypothetical protein  35.32 
 
 
443 aa  139  3.0000000000000003e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3139  IucA/IucC family protein  27.55 
 
 
586 aa  135  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2971  IucA/IucC family protein  26.2 
 
 
555 aa  133  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.963882 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4783  IucA/IucC  26.54 
 
 
610 aa  132  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001063  vibrioferrin amide bond forming protein PvsD  26.36 
 
 
580 aa  132  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3750  IucA/IucC family protein  27.16 
 
 
599 aa  131  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00878  siderophore biosynthesis protein  26.14 
 
 
611 aa  130  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0338478  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1113  IucA/IucC  25.45 
 
 
608 aa  126  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8365  putative iron transport protein  25.81 
 
 
519 aa  118  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01928  iron transporter  26.94 
 
 
576 aa  116  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06234  siderophore biosynthesis acetylase AceI, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03400)  32.68 
 
 
443 aa  115  4.0000000000000004e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0685832  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2836  hypothetical protein  32.04 
 
 
192 aa  108  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.513936  normal  0.134808 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09310  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  24.87 
 
 
586 aa  107  9e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00047621  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3094  iron transporter  23.91 
 
 
584 aa  105  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1276  IucA/IucC  25.72 
 
 
684 aa  103  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0409  hypothetical protein  32.02 
 
 
195 aa  99.8  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.141827  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1162  hypothetical protein  34.86 
 
 
343 aa  99  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1642  hypothetical protein  34.86 
 
 
343 aa  99  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118312  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  23.98 
 
 
1153 aa  98.2  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0216  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  31.67 
 
 
225 aa  96.3  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4412  hypothetical protein  28.66 
 
 
222 aa  94  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4788  hypothetical protein  33.14 
 
 
344 aa  92.8  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173815  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>