142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0409 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0409  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  401  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.141827  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2836  hypothetical protein  51.58 
 
 		 192 aa  210  1e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.513936  normal  0.134808 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3332  siderophore biosynthesis protein (malonyl-CoA decarboxylase)  46.07 
 
 		 209 aa  177  7e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0216  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  43.78 
 
 		 225 aa  158  6e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1809  GCN5-related N-acetyltransferase  43.67 
 
 		 194 aa  137  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.548795 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2833  IucA/IucC  34.9 
 
 		 813 aa  133  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76703  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0274  siderophore biosynthesis protein IucB (N6-hydroxylysine acetyl transferase)  33.51 
 
 		 303 aa  122  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173921  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3942  hypothetical protein  37.78 
 
 		 337 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.291769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3256  hypothetical protein  33.71 
 
 		 357 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4245  siderophore biosynthesis protein, putative  36.31 
 
 		 205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2862  hypothetical protein  37.64 
 
 		 328 aa  108  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.276239  normal  0.0557452 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0713  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  32.6 
 
 		 316 aa  108  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0191  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  32.6 
 
 		 316 aa  108  5e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000449097 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0785  putative siderophore biosynthesis protein IucB  32.6 
 
 		 316 aa  108  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4748  hypothetical protein  34.95 
 
 		 400 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586037 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3564  siderophore biosynthesis protein  35.75 
 
 		 337 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3811  siderophore biosynthesis protein  35.2 
 
 		 337 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0921  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  33.52 
 
 		 316 aa  104  7e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.62624  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25460  hypothetical protein  33.51 
 
 		 352 aa  103  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3727  hypothetical protein  33.15 
 
 		 366 aa  102  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.752292  normal  0.168128 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4035  hypothetical protein  32.97 
 
 		 316 aa  102  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.610793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2826  PvdYII  35.71 
 
 		 337 aa  101  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4037  hypothetical protein  35.84 
 
 		 341 aa  101  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0948  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  32.96 
 
 		 315 aa  100  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.633043  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3181  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  32.4 
 
 		 315 aa  100  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5061  hypothetical protein  33.33 
 
 		 354 aa  100  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00103312 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4633  N(6)-hydroxylysine O-acetyltransferase, aerobactin biosynthetic  32.4 
 
 		 315 aa  100  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0585  IucA/IucC family protein  32.02 
 
 		 925 aa  99.8  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1682  hypothetical protein  31.28 
 
 		 339 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2557  hypothetical protein  36.09 
 
 		 184 aa  96.7  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.463676  normal  0.298043 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1564  hypothetical protein  32.77 
 
 		 338 aa  96.7  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31691  normal  0.229802 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2839  hypothetical protein  29.69 
 
 		 447 aa  95.9  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00269793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1543  hypothetical protein  32.77 
 
 		 338 aa  96.3  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3739  hypothetical protein  32.26 
 
 		 344 aa  95.5  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.531376  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3457  IucA/IucC  38.25 
 
 		 207 aa  95.5  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  31.03 
 
 		 842 aa  95.5  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1813  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  29.05 
 
 		 274 aa  94.7  7e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.419117  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1721  hypothetical protein  34.73 
 
 		 244 aa  94.7  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.880139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1768  hypothetical protein  34.73 
 
 		 224 aa  94.7  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.258477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1700  hypothetical protein  34.73 
 
 		 244 aa  94.7  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2594  hypothetical protein  32.8 
 
 		 187 aa  94.7  7e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184474  normal  0.69464 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4792  hypothetical protein  31.64 
 
 		 338 aa  94.7  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0336601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1166  hypothetical protein  31.64 
 
 		 338 aa  94.4  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74147  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0591  siderophore biosynthesis protein  29.21 
 
 		 810 aa  94.4  9e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1646  hypothetical protein  31.64 
 
 		 338 aa  94.4  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2789  hypothetical protein  31.15 
 
 		 357 aa  94.4  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.112907 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1621  hypothetical protein  31.64 
 
 		 338 aa  94.4  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185713 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1824  hypothetical protein  32.94 
 
 		 364 aa  94  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1592  hypothetical protein  31.64 
 
 		 336 aa  94  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0260061  normal  0.0225725 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2446  hypothetical protein  29.12 
 
 		 192 aa  93.2  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4806  N6-hydroxylysine O-acetyltransferase protein  30.73 
 
 		 343 aa  92.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.223021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2439  hypothetical protein  32.29 
 
 		 187 aa  90.9  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.397369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1092  putative acetylase  30.34 
 
 		 366 aa  90.5  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474828 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2746  hypothetical protein  34.32 
 
 		 191 aa  90.1  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.126222  hitchhiker  0.000868803 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2545  putative siderophore biosynthetic enzyme  30.06 
 
 		 192 aa  90.1  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3320  putative siderophore biosynthesis protein  31.74 
 
 		 380 aa  89.7  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0248153 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3461  IucA/IucC  30.22 
 
 		 189 aa  88.6  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3273  putative acetyltransferase  32.74 
 
 		 203 aa  87.8  8e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1346  hypothetical protein  31.72 
 
 		 347 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.299655  normal  0.123425 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5729  acetylase  28.49 
 
 		 349 aa  85.9  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.404247  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0287  aceytltranferase  34.15 
 
 		 187 aa  85.5  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3172  IucA/IucC family protein  31.21 
 
 		 818 aa  84.3  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10080  siderophore biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04450)  32.5 
 
 		 503 aa  83.6  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.277497  normal  0.331437 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4412  hypothetical protein  32.94 
 
 		 222 aa  81.6  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1072  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  29.44 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0309618  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0514  aceytltranferase  31.33 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2738  hypothetical protein  30.46 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.482702  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2549  hypothetical protein  31.03 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.432912 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1943  hypothetical protein  32.32 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11377  hypothetical protein  31.54 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.512198 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1162  hypothetical protein  29.48 
 
 		 343 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1642  hypothetical protein  29.48 
 
 		 343 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118312  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1539  hypothetical protein  29.48 
 
 		 341 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4293  hypothetical protein  29.41 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.49385  hitchhiker  0.000790517 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1560  hypothetical protein  29.48 
 
 		 341 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0159357  normal  0.172237 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00608  conserved hypothetical protein  27.33 
 
 		 443 aa  67.4  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0198  IucA/IucC family protein  31.68 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0130557 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4324  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  25.28 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1801  IucA/IucC family protein  28.65 
 
 		 799 aa  67  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000155987  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1617  hypothetical protein  29.48 
 
 		 343 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00170035 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06234  siderophore biosynthesis acetylase AceI, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03400)  27.71 
 
 		 443 aa  65.9  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0685832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2731  hypothetical protein  26.83 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0416274  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3265  GCN5-related N-acetyltransferase  31.87 
 
 		 172 aa  64.7  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2412  siderophore biosynthesis protein, putative  27.78 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3031  siderophore biosynthesis protein, putative  25 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2810  hypothetical protein  25.75 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.218147 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0417  GCN5-related N-acetyltransferase  28.75 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2961  acetyltransferase, GNAT family  24.46 
 
 		 177 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000203094 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2753  acetyltransferase  23.74 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.228276  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2964  acetyltransferase  23.74 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0101732  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2709  hypothetical protein  24.72 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1596  hypothetical protein  25.43 
 
 		 338 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.91747  hitchhiker  0.00122514 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4788  hypothetical protein  27.17 
 
 		 344 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173815  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  24.46 
 
 		 359 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2702  acetyltransferase  23.74 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  23.74 
 
 		 359 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2681  acetyltransferase  23.74 
 
 		 177 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2276  bifunctional AAC/APH  24.46 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0137497 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2755  GCN5-related N-acetyltransferase  24.46 
 
 		 179 aa  57.8  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0858714  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1655  siderophore biosynthesis protein, putative  25.93 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000687205 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>