60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1617 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1617  hypothetical protein  100 
 
 
343 aa  670    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00170035 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1162  hypothetical protein  96.21 
 
 
343 aa  598  1e-170  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1642  hypothetical protein  96.21 
 
 
343 aa  598  1e-170  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118312  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4788  hypothetical protein  90.12 
 
 
344 aa  555  1e-157  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173815  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1539  hypothetical protein  86.63 
 
 
341 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1560  hypothetical protein  86.05 
 
 
341 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0159357  normal  0.172237 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1596  hypothetical protein  78.84 
 
 
338 aa  473  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.91747  hitchhiker  0.00122514 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4037  hypothetical protein  46.15 
 
 
341 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3942  hypothetical protein  37.31 
 
 
337 aa  170  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.291769  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2789  hypothetical protein  43.38 
 
 
357 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.112907 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1682  hypothetical protein  35.92 
 
 
339 aa  162  9e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4245  siderophore biosynthesis protein, putative  45.18 
 
 
205 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2862  hypothetical protein  43.5 
 
 
328 aa  158  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.276239  normal  0.0557452 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3727  hypothetical protein  40.74 
 
 
366 aa  157  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.752292  normal  0.168128 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3811  siderophore biosynthesis protein  44.67 
 
 
337 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3564  siderophore biosynthesis protein  43.15 
 
 
337 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2826  PvdYII  44.44 
 
 
337 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5729  acetylase  37.36 
 
 
349 aa  153  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.404247  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1824  hypothetical protein  34.09 
 
 
364 aa  151  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3739  hypothetical protein  35.03 
 
 
344 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.531376  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4748  hypothetical protein  42.21 
 
 
400 aa  151  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.586037 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1092  putative acetylase  34.45 
 
 
366 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.474828 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4806  N6-hydroxylysine O-acetyltransferase protein  37.93 
 
 
343 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.223021  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3320  putative siderophore biosynthesis protein  39.13 
 
 
380 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0248153 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25460  hypothetical protein  33.45 
 
 
352 aa  144  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1543  hypothetical protein  33.89 
 
 
338 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1564  hypothetical protein  37.13 
 
 
338 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31691  normal  0.229802 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0274  siderophore biosynthesis protein IucB (N6-hydroxylysine acetyl transferase)  31.72 
 
 
303 aa  138  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173921  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1621  hypothetical protein  32.77 
 
 
338 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185713 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1592  hypothetical protein  36.45 
 
 
336 aa  135  8e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0260061  normal  0.0225725 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1646  hypothetical protein  32.09 
 
 
338 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1166  hypothetical protein  32.09 
 
 
338 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74147  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4792  hypothetical protein  35.96 
 
 
338 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0336601  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4035  hypothetical protein  36.07 
 
 
316 aa  132  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.610793  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3181  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  36.65 
 
 
315 aa  130  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4633  N(6)-hydroxylysine O-acetyltransferase, aerobactin biosynthetic  36.65 
 
 
315 aa  130  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0948  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  37.73 
 
 
315 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.633043  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10080  siderophore biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04450)  33.9 
 
 
503 aa  127  3e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.277497  normal  0.331437 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1346  hypothetical protein  37.99 
 
 
347 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.299655  normal  0.123425 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0191  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  36.36 
 
 
316 aa  123  4e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000449097 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0713  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  36.36 
 
 
316 aa  123  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0785  putative siderophore biosynthesis protein IucB  36.36 
 
 
316 aa  123  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06234  siderophore biosynthesis acetylase AceI, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03400)  39.59 
 
 
443 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0685832  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5061  hypothetical protein  37.89 
 
 
354 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00103312 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0921  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  35.94 
 
 
316 aa  118  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.62624  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0585  IucA/IucC family protein  29.43 
 
 
925 aa  107  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1813  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  27.43 
 
 
274 aa  104  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.419117  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00608  conserved hypothetical protein  32.86 
 
 
443 aa  102  7e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3256  hypothetical protein  32.13 
 
 
357 aa  97.4  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2836  hypothetical protein  26.88 
 
 
192 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.513936  normal  0.134808 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0409  hypothetical protein  29.48 
 
 
195 aa  65.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.141827  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3332  siderophore biosynthesis protein (malonyl-CoA decarboxylase)  29.38 
 
 
209 aa  59.3  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1700  hypothetical protein  28.68 
 
 
244 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508073  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1768  hypothetical protein  28.68 
 
 
224 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.258477  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1721  hypothetical protein  28.68 
 
 
244 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.880139  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1809  GCN5-related N-acetyltransferase  28.99 
 
 
194 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.548795 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0216  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  32.65 
 
 
225 aa  51.2  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00758  conserved hypothetical protein  31.58 
 
 
496 aa  50.1  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4412  hypothetical protein  27.36 
 
 
222 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  26.56 
 
 
842 aa  45.8  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>