95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3942 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3942  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  698    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.291769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3564  siderophore biosynthesis protein  74.39 
 
 		 337 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3811  siderophore biosynthesis protein  73.23 
 
 		 337 aa  484  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2826  PvdYII  70.41 
 
 		 337 aa  461  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2862  hypothetical protein  61.75 
 
 		 328 aa  395  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.276239  normal  0.0557452 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4245  siderophore biosynthesis protein, putative  86.34 
 
 		 205 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25460  hypothetical protein  49.34 
 
 		 352 aa  294  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1824  hypothetical protein  53.57 
 
 		 364 aa  264  2e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1543  hypothetical protein  48.19 
 
 		 338 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4792  hypothetical protein  47.79 
 
 		 338 aa  260  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0336601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1564  hypothetical protein  48.57 
 
 		 338 aa  259  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31691  normal  0.229802 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1621  hypothetical protein  48.19 
 
 		 338 aa  259  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185713 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1646  hypothetical protein  48.19 
 
 		 338 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1166  hypothetical protein  48.19 
 
 		 338 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74147  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4748  hypothetical protein  45.32 
 
 		 400 aa  256  4e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586037 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1592  hypothetical protein  47.76 
 
 		 336 aa  256  4e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0260061  normal  0.0225725 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4035  hypothetical protein  50 
 
 		 316 aa  256  5e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.610793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1092  putative acetylase  42.6 
 
 		 366 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474828 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2789  hypothetical protein  54.34 
 
 		 357 aa  249  4e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.112907 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1682  hypothetical protein  41.35 
 
 		 339 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3739  hypothetical protein  49.58 
 
 		 344 aa  246  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.531376  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3320  putative siderophore biosynthesis protein  45.42 
 
 		 380 aa  241  2e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0248153 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4806  N6-hydroxylysine O-acetyltransferase protein  46.92 
 
 		 343 aa  239  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.223021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1346  hypothetical protein  44.66 
 
 		 347 aa  228  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.299655  normal  0.123425 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4037  hypothetical protein  48.13 
 
 		 341 aa  227  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3727  hypothetical protein  44.57 
 
 		 366 aa  224  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.752292  normal  0.168128 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5061  hypothetical protein  41.61 
 
 		 354 aa  223  3e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00103312 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5729  acetylase  45.78 
 
 		 349 aa  222  7e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.404247  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0921  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  47.83 
 
 		 316 aa  220  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.62624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0948  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  48.03 
 
 		 315 aa  218  8.999999999999998e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.633043  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0785  putative siderophore biosynthesis protein IucB  46.83 
 
 		 316 aa  217  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0713  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  46.43 
 
 		 316 aa  217  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0191  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  46.43 
 
 		 316 aa  217  2e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000449097 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4633  N(6)-hydroxylysine O-acetyltransferase, aerobactin biosynthetic  48.03 
 
 		 315 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3181  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  46.72 
 
 		 315 aa  212  7e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0274  siderophore biosynthesis protein IucB (N6-hydroxylysine acetyl transferase)  44.35 
 
 		 303 aa  211  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173921  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06234  siderophore biosynthesis acetylase AceI, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G03400)  40.36 
 
 		 443 aa  199  7e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0685832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1813  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  40.71 
 
 		 274 aa  192  8e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.419117  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0585  IucA/IucC family protein  40.81 
 
 		 925 aa  188  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0175917 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00608  conserved hypothetical protein  45.64 
 
 		 443 aa  179  5.999999999999999e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10080  siderophore biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04450)  41.74 
 
 		 503 aa  178  1e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.277497  normal  0.331437 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3256  hypothetical protein  39.26 
 
 		 357 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4788  hypothetical protein  36.34 
 
 		 344 aa  149  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1539  hypothetical protein  40.31 
 
 		 341 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1162  hypothetical protein  40.48 
 
 		 343 aa  145  9e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1642  hypothetical protein  40.48 
 
 		 343 aa  145  9e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118312  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1560  hypothetical protein  41.08 
 
 		 341 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0159357  normal  0.172237 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1617  hypothetical protein  39.85 
 
 		 343 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00170035 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2836  hypothetical protein  40.66 
 
 		 192 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.513936  normal  0.134808 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1596  hypothetical protein  39.78 
 
 		 338 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.91747  hitchhiker  0.00122514 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0409  hypothetical protein  37.78 
 
 		 195 aa  112  9e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.141827  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0216  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  34.44 
 
 		 225 aa  110  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2833  IucA/IucC  30.05 
 
 		 813 aa  95.1  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76703  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1809  GCN5-related N-acetyltransferase  33.13 
 
 		 194 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.548795 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3332  siderophore biosynthesis protein (malonyl-CoA decarboxylase)  30.05 
 
 		 209 aa  90.9  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0591  siderophore biosynthesis protein  23.58 
 
 		 810 aa  76.6  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4412  hypothetical protein  31.58 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  31.18 
 
 		 842 aa  72.4  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2594  hypothetical protein  30 
 
 		 187 aa  70.1  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184474  normal  0.69464 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3457  IucA/IucC  32 
 
 		 207 aa  68.9  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2557  hypothetical protein  31.64 
 
 		 184 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.463676  normal  0.298043 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1943  hypothetical protein  33.08 
 
 		 199 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2439  hypothetical protein  28.24 
 
 		 187 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.397369  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00758  conserved hypothetical protein  29.92 
 
 		 496 aa  68.2  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3273  putative acetyltransferase  31.93 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2839  hypothetical protein  24.21 
 
 		 447 aa  67  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00269793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3172  IucA/IucC family protein  24.87 
 
 		 818 aa  66.6  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2746  hypothetical protein  29.55 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.126222  hitchhiker  0.000868803 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2446  hypothetical protein  27.38 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11377  hypothetical protein  28.24 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.512198 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2545  putative siderophore biosynthetic enzyme  27.33 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3461  IucA/IucC  28.07 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4324  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  26.9 
 
 		 205 aa  62.4  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1721  hypothetical protein  27.65 
 
 		 244 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.880139  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1700  hypothetical protein  27.65 
 
 		 244 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1768  hypothetical protein  27.65 
 
 		 224 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.258477  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0198  IucA/IucC family protein  28.57 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0130557 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4293  hypothetical protein  25.15 
 
 		 183 aa  57  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.49385  hitchhiker  0.000790517 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2549  hypothetical protein  26.37 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.432912 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2738  hypothetical protein  25.7 
 
 		 188 aa  55.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.482702  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1799  hypothetical protein  27.08 
 
 		 223 aa  53.9  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000000012554  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33250  hypothetical protein  39.74 
 
 		 155 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.044034  normal  0.0230066 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0287  aceytltranferase  31.18 
 
 		 187 aa  53.5  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3031  siderophore biosynthesis protein, putative  24.81 
 
 		 206 aa  52.8  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1072  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  26.2 
 
 		 209 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0309618  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1519  siderophore biosynthesis protein, putative  25.37 
 
 		 224 aa  49.7  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.554005 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1509  siderophore biosynthesis protein, putative  25.37 
 
 		 221 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1453  siderophore biosynthesis protein, putative  25.37 
 
 		 227 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0514  aceytltranferase  30.2 
 
 		 196 aa  46.6  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1801  IucA/IucC family protein  26.42 
 
 		 799 aa  45.4  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000155987  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2412  siderophore biosynthesis protein, putative  24.53 
 
 		 229 aa  44.3  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1655  siderophore biosynthesis protein, putative  25.56 
 
 		 221 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000687205 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0128  GCN5-related N-acetyltransferase  25.83 
 
 		 159 aa  43.5  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.304461 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2731  hypothetical protein  25.56 
 
 		 216 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0416274  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0136  siderophore biosynthesis protein  25 
 
 		 819 aa  42.7  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>