85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2557 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2557  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  364  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.463676  normal  0.298043 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2746  hypothetical protein  88.52 
 
 
191 aa  320  5e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.126222  hitchhiker  0.000868803 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3457  IucA/IucC  63.84 
 
 
207 aa  218  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3273  putative acetyltransferase  50.56 
 
 
203 aa  185  3e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2439  hypothetical protein  49.71 
 
 
187 aa  169  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.397369  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2594  hypothetical protein  47.73 
 
 
187 aa  159  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184474  normal  0.69464 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1799  hypothetical protein  46.39 
 
 
223 aa  134  7.000000000000001e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000000012554  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0514  aceytltranferase  42.59 
 
 
196 aa  129  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  40.57 
 
 
842 aa  129  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2738  hypothetical protein  43.53 
 
 
188 aa  120  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.482702  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1072  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  36.78 
 
 
209 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0309618  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0287  aceytltranferase  40.74 
 
 
187 aa  119  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2446  hypothetical protein  35.76 
 
 
192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2549  hypothetical protein  41.76 
 
 
188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.432912 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2545  putative siderophore biosynthetic enzyme  35.15 
 
 
192 aa  110  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3461  IucA/IucC  35.39 
 
 
189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4293  hypothetical protein  37.89 
 
 
183 aa  97.8  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.49385  hitchhiker  0.000790517 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0409  hypothetical protein  36.09 
 
 
195 aa  96.7  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.141827  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1809  GCN5-related N-acetyltransferase  36.26 
 
 
194 aa  93.6  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.548795 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2836  hypothetical protein  30.41 
 
 
192 aa  82  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.513936  normal  0.134808 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0591  siderophore biosynthesis protein  28.05 
 
 
810 aa  81.6  0.000000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124028  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1801  IucA/IucC family protein  34.32 
 
 
799 aa  79.7  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000155987  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2810  hypothetical protein  29.17 
 
 
221 aa  79  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.218147 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0198  IucA/IucC family protein  31.14 
 
 
209 aa  78.2  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0130557 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0216  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  31.33 
 
 
225 aa  76.3  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0136  siderophore biosynthesis protein  28.57 
 
 
819 aa  76.6  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2731  hypothetical protein  29.17 
 
 
216 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0416274  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3172  IucA/IucC family protein  28.02 
 
 
818 aa  76.6  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2839  hypothetical protein  28.18 
 
 
447 aa  75.9  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00269793  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3332  siderophore biosynthesis protein (malonyl-CoA decarboxylase)  30.06 
 
 
209 aa  76.3  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2826  PvdYII  34.55 
 
 
337 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4035  hypothetical protein  32.6 
 
 
316 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.610793  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2412  siderophore biosynthesis protein, putative  28.32 
 
 
229 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2709  hypothetical protein  27.98 
 
 
236 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3811  siderophore biosynthesis protein  32.78 
 
 
337 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1655  siderophore biosynthesis protein, putative  29.41 
 
 
221 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000687205 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2833  IucA/IucC  31.28 
 
 
813 aa  69.7  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76703  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4245  siderophore biosynthesis protein, putative  30.11 
 
 
205 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3942  hypothetical protein  31.64 
 
 
337 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.291769  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1509  siderophore biosynthesis protein, putative  25.9 
 
 
221 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1519  siderophore biosynthesis protein, putative  25.9 
 
 
224 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.554005 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3031  siderophore biosynthesis protein, putative  23.21 
 
 
206 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3564  siderophore biosynthesis protein  29.55 
 
 
337 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4792  hypothetical protein  28.81 
 
 
338 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0336601  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1682  hypothetical protein  29.27 
 
 
339 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3256  hypothetical protein  31.69 
 
 
357 aa  64.7  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1166  hypothetical protein  28.81 
 
 
338 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74147  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1621  hypothetical protein  30.06 
 
 
338 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185713 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4037  hypothetical protein  30.27 
 
 
341 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1592  hypothetical protein  28.81 
 
 
336 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0260061  normal  0.0225725 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1646  hypothetical protein  28.81 
 
 
338 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3739  hypothetical protein  28.73 
 
 
344 aa  63.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.531376  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1813  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  26.82 
 
 
274 aa  63.5  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.419117  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25460  hypothetical protein  30 
 
 
352 aa  62.8  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5061  hypothetical protein  31.55 
 
 
354 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00103312 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1453  siderophore biosynthesis protein, putative  25.31 
 
 
227 aa  62  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2862  hypothetical protein  30 
 
 
328 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.276239  normal  0.0557452 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0274  siderophore biosynthesis protein IucB (N6-hydroxylysine acetyl transferase)  28.89 
 
 
303 aa  60.8  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173921  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4748  hypothetical protein  31.64 
 
 
400 aa  60.5  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.586037 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2789  hypothetical protein  29.47 
 
 
357 aa  60.5  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.112907 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0585  IucA/IucC family protein  29.25 
 
 
925 aa  59.7  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3320  putative siderophore biosynthesis protein  30.94 
 
 
380 aa  59.7  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0248153 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4806  N6-hydroxylysine O-acetyltransferase protein  31.14 
 
 
343 aa  59.3  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.223021  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1543  hypothetical protein  27.68 
 
 
338 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1564  hypothetical protein  27.68 
 
 
338 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31691  normal  0.229802 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0921  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  29.75 
 
 
316 aa  58.5  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.62624  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1346  hypothetical protein  26.32 
 
 
347 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.299655  normal  0.123425 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3181  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  26.35 
 
 
315 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0191  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  29.81 
 
 
316 aa  55.8  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000449097 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0948  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  27.98 
 
 
315 aa  55.8  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.633043  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0713  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucB  29.81 
 
 
316 aa  55.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5729  acetylase  31.48 
 
 
349 aa  56.2  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.404247  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0785  putative siderophore biosynthesis protein IucB  29.81 
 
 
316 aa  55.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4633  N(6)-hydroxylysine O-acetyltransferase, aerobactin biosynthetic  26.95 
 
 
315 aa  55.8  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3727  hypothetical protein  29.6 
 
 
366 aa  52.8  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.752292  normal  0.168128 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10080  siderophore biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04450)  28.22 
 
 
503 aa  50.8  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.277497  normal  0.331437 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1092  putative acetylase  28.33 
 
 
366 aa  48.9  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.474828 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1824  hypothetical protein  29.83 
 
 
364 aa  47  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4324  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  32.41 
 
 
205 aa  45.8  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4816  GCN5-like N-acetyltransferase  26.51 
 
 
190 aa  45.1  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.231469  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1865  GCN5-related N-acetyltransferase  29.68 
 
 
175 aa  42.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.360352  normal  0.789976 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00608  conserved hypothetical protein  29.56 
 
 
443 aa  42.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2024  acetyltransferase  30.08 
 
 
210 aa  42.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0919238  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2160  ribosomal-protein-serine acetyltransferase  30.08 
 
 
209 aa  42.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0417  GCN5-related N-acetyltransferase  29.63 
 
 
161 aa  41.2  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>