77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0417 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007958  RPD_0417  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
161 aa  332  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0128  GCN5-related N-acetyltransferase  63.06 
 
 
159 aa  209  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.304461 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0151  putative aminoglycoside N(6')-acetyltransferase (aacA4)  54.07 
 
 
184 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436335  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4310  GCN5-related N-acetyltransferase  44.16 
 
 
170 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0797  GCN5-related N-acetyltransferase  38.06 
 
 
177 aa  107  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.407987  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3491  GCN5-related N-acetyltransferase  36.65 
 
 
179 aa  105  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2040  GCN5-related N-acetyltransferase  42.28 
 
 
158 aa  105  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0168765 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3265  GCN5-related N-acetyltransferase  34.78 
 
 
172 aa  84.7  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1585  6'-aminoglycoside N-acetyltransferase/2''-aminoglycoside phosphotransferase  30.56 
 
 
479 aa  72.4  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.616804  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2806  aminoglycoside phosphotransferase  30.56 
 
 
479 aa  72.4  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0356715  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2761  aminoglycoside phosphotransferase  30.56 
 
 
479 aa  72.4  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2681  acetyltransferase  27.7 
 
 
177 aa  71.2  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2702  acetyltransferase  27.7 
 
 
177 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2961  acetyltransferase, GNAT family  27.03 
 
 
177 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000203094 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2464  hypothetical protein  27.43 
 
 
190 aa  67  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2321  hypothetical protein  27.49 
 
 
190 aa  66.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0596  GCN5-related N-acetyltransferase  30.6 
 
 
170 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355051  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2964  acetyltransferase  26.35 
 
 
177 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0101732  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2753  acetyltransferase  26.35 
 
 
177 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.228276  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  27.03 
 
 
359 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0579  GCN5-related N-acetyltransferase  29.85 
 
 
170 aa  63.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  26.35 
 
 
359 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1809  GCN5-related N-acetyltransferase  32.93 
 
 
194 aa  62.4  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.548795 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2964  acetyltransferase, GNAT family  25.5 
 
 
178 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0409  hypothetical protein  28.75 
 
 
195 aa  61.6  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.141827  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2755  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
179 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0858714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2276  bifunctional AAC/APH  24.18 
 
 
179 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0137497 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0918  GCN5-related N-acetyltransferase  30.43 
 
 
167 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.378966  normal  0.0701309 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2836  hypothetical protein  25.31 
 
 
192 aa  55.1  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.513936  normal  0.134808 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3727  hypothetical protein  26.67 
 
 
366 aa  53.9  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.752292  normal  0.168128 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0137  hypothetical protein  27.33 
 
 
377 aa  53.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0786  GCN5-related N-acetyltransferase  31.08 
 
 
169 aa  53.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.901222  normal  0.0729138 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3211  GCN5-related N-acetyltransferase  29.73 
 
 
194 aa  53.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4324  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  30.41 
 
 
205 aa  52  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3332  siderophore biosynthesis protein (malonyl-CoA decarboxylase)  28.05 
 
 
209 aa  52.4  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3580  GCN5-related N-acetyltransferase  28.28 
 
 
166 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0274  siderophore biosynthesis protein IucB (N6-hydroxylysine acetyl transferase)  25.75 
 
 
303 aa  52  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173921  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2030  GCN5-related N-acetyltransferase  32.06 
 
 
169 aa  50.8  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0811  GCN5-related N-acetyltransferase  41.43 
 
 
190 aa  50.4  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2533  GCN5-related N-acetyltransferase  28.17 
 
 
163 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.162076 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25460  hypothetical protein  25.97 
 
 
352 aa  48.5  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1092  putative acetylase  25.44 
 
 
366 aa  47.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.474828 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0589  hypothetical protein  25.81 
 
 
187 aa  47.8  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2020  GCN5-related N-acetyltransferase  22.22 
 
 
159 aa  47.8  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.712015  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2746  hypothetical protein  31.29 
 
 
191 aa  47.4  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.126222  hitchhiker  0.000868803 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5729  acetylase  26.8 
 
 
349 aa  47.8  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.404247  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4846  acetyltransferase  30.77 
 
 
194 aa  47.4  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4816  GCN5-like N-acetyltransferase  31.88 
 
 
190 aa  46.6  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.231469  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4412  hypothetical protein  29.58 
 
 
222 aa  47  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3320  putative siderophore biosynthesis protein  25.61 
 
 
380 aa  45.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0248153 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2789  hypothetical protein  25.95 
 
 
357 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.112907 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3739  hypothetical protein  24.85 
 
 
344 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.531376  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1943  hypothetical protein  29.14 
 
 
199 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.47552  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3684  GCN5-related N-acetyltransferase  26.57 
 
 
172 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2479  GCN5-related N-acetyltransferase  26.43 
 
 
164 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0272191 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0883  aminoglycoside N6'-acetyltransferase  23.03 
 
 
200 aa  43.9  0.0009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.119771  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10080  siderophore biosynthesis protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04450)  25.95 
 
 
503 aa  43.9  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.277497  normal  0.331437 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3994  GCN5-related N-acetyltransferase  28.28 
 
 
175 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2756  GCN5-related N-acetyltransferase  25.19 
 
 
149 aa  43.9  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  28.65 
 
 
842 aa  43.5  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1543  hypothetical protein  27.27 
 
 
338 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.362175  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1564  hypothetical protein  27.27 
 
 
338 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31691  normal  0.229802 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1682  hypothetical protein  25.81 
 
 
339 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1646  hypothetical protein  27.27 
 
 
338 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1166  hypothetical protein  27.27 
 
 
338 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.74147  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1592  hypothetical protein  27.27 
 
 
336 aa  42.4  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0260061  normal  0.0225725 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4792  hypothetical protein  27.27 
 
 
338 aa  42.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0336601  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1621  hypothetical protein  27.27 
 
 
338 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00185713 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4748  hypothetical protein  25.49 
 
 
400 aa  42  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.586037 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2557  hypothetical protein  29.63 
 
 
184 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.463676  normal  0.298043 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0216  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  26.67 
 
 
225 aa  41.6  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2569  acetyltransferase  23.03 
 
 
173 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.447023  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4245  siderophore biosynthesis protein, putative  25.64 
 
 
205 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1134  acetyltransferase  35 
 
 
142 aa  40.8  0.009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1700  hypothetical protein  26.03 
 
 
244 aa  40.4  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508073  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1768  hypothetical protein  26.03 
 
 
224 aa  40.4  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.258477  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1721  hypothetical protein  26.03 
 
 
244 aa  40.4  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.880139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>