42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2040 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_2040  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
158 aa  315  1e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0168765 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0417  GCN5-related N-acetyltransferase  42.95 
 
 
161 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0128  GCN5-related N-acetyltransferase  40.94 
 
 
159 aa  105  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.304461 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0797  GCN5-related N-acetyltransferase  41.29 
 
 
177 aa  102  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.407987  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0151  putative aminoglycoside N(6')-acetyltransferase (aacA4)  40 
 
 
184 aa  90.5  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436335  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4310  GCN5-related N-acetyltransferase  35.71 
 
 
170 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3491  GCN5-related N-acetyltransferase  37.16 
 
 
179 aa  78.6  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3265  GCN5-related N-acetyltransferase  35.04 
 
 
172 aa  65.1  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2681  acetyltransferase  28.86 
 
 
177 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2702  acetyltransferase  28.86 
 
 
177 aa  60.8  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2753  acetyltransferase  28.19 
 
 
177 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.228276  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2961  acetyltransferase, GNAT family  28.19 
 
 
177 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000203094 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  27.52 
 
 
359 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2964  acetyltransferase  28.19 
 
 
177 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0101732  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  28.86 
 
 
359 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0883  aminoglycoside N6'-acetyltransferase  23.53 
 
 
200 aa  54.7  0.0000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.119771  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2755  GCN5-related N-acetyltransferase  26.85 
 
 
179 aa  53.9  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0858714  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2761  aminoglycoside phosphotransferase  25.49 
 
 
479 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2806  aminoglycoside phosphotransferase  25.49 
 
 
479 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0356715  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1585  6'-aminoglycoside N-acetyltransferase/2''-aminoglycoside phosphotransferase  25.49 
 
 
479 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.616804  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0579  GCN5-related N-acetyltransferase  26.19 
 
 
170 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2964  acetyltransferase, GNAT family  26.9 
 
 
178 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2321  hypothetical protein  27.39 
 
 
190 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2276  bifunctional AAC/APH  26.9 
 
 
179 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0137497 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2464  hypothetical protein  28.03 
 
 
190 aa  51.6  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2030  GCN5-related N-acetyltransferase  32.21 
 
 
169 aa  51.2  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0811  GCN5-related N-acetyltransferase  25.85 
 
 
190 aa  50.8  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0596  GCN5-related N-acetyltransferase  25.4 
 
 
170 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355051  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0918  GCN5-related N-acetyltransferase  31.9 
 
 
167 aa  49.7  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.378966  normal  0.0701309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1809  GCN5-related N-acetyltransferase  30.34 
 
 
194 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.548795 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0786  GCN5-related N-acetyltransferase  30.63 
 
 
169 aa  47.4  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.901222  normal  0.0729138 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1134  acetyltransferase  26.67 
 
 
142 aa  45.4  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3994  GCN5-related N-acetyltransferase  30.59 
 
 
175 aa  45.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3580  GCN5-related N-acetyltransferase  28.74 
 
 
166 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4816  GCN5-like N-acetyltransferase  25.97 
 
 
190 aa  45.4  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.231469  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3684  GCN5-related N-acetyltransferase  27.11 
 
 
172 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2533  GCN5-related N-acetyltransferase  28.92 
 
 
163 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.162076 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2020  GCN5-related N-acetyltransferase  21.92 
 
 
159 aa  42  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.712015  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2344  GCN5-related N-acetyltransferase  28.4 
 
 
234 aa  41.6  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.708691  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0137  hypothetical protein  23.39 
 
 
377 aa  41.2  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4846  acetyltransferase  31.37 
 
 
194 aa  40.8  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2479  GCN5-related N-acetyltransferase  30.1 
 
 
164 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0272191 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>