63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3265 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3265  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 172 aa  350  7e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3491  GCN5-related N-acetyltransferase  42.94 
 
 		 179 aa  131  6e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4310  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 		 170 aa  100  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0151  putative aminoglycoside N(6')-acetyltransferase (aacA4)  35 
 
 		 184 aa  96.7  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0128  GCN5-related N-acetyltransferase  39.01 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.304461 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0417  GCN5-related N-acetyltransferase  34.78 
 
 		 161 aa  94.7  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0797  GCN5-related N-acetyltransferase  34.81 
 
 		 177 aa  90.1  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.407987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0409  hypothetical protein  31.87 
 
 		 195 aa  75.9  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.141827  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2030  GCN5-related N-acetyltransferase  36.73 
 
 		 169 aa  70.9  0.000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0137  hypothetical protein  30.19 
 
 		 377 aa  69.3  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3211  GCN5-related N-acetyltransferase  28.82 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2321  hypothetical protein  25.81 
 
 		 190 aa  67.4  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1809  GCN5-related N-acetyltransferase  29.75 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.548795 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2040  GCN5-related N-acetyltransferase  37.23 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0168765 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2464  hypothetical protein  26.45 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  31.51 
 
 		 359 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3002  acetyltransferase  30.82 
 
 		 359 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0585331  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2961  acetyltransferase, GNAT family  31.29 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000203094 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2964  acetyltransferase  29.45 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0101732  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0811  GCN5-related N-acetyltransferase  38.46 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2753  acetyltransferase  29.45 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.228276  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2681  acetyltransferase  33.78 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2702  acetyltransferase  31.29 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3332  siderophore biosynthesis protein (malonyl-CoA decarboxylase)  28.82 
 
 		 209 aa  61.2  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1132  GCN5-related N-acetyltransferase  30.14 
 
 		 167 aa  60.5  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2836  hypothetical protein  29.8 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.513936  normal  0.134808 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2755  GCN5-related N-acetyltransferase  27.67 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0858714  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1585  6'-aminoglycoside N-acetyltransferase/2''-aminoglycoside phosphotransferase  27.63 
 
 		 479 aa  58.9  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.616804  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2806  aminoglycoside phosphotransferase  27.63 
 
 		 479 aa  58.9  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0356715  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2761  aminoglycoside phosphotransferase  27.63 
 
 		 479 aa  58.9  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0883  aminoglycoside N6'-acetyltransferase  23.08 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.119771  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3580  GCN5-related N-acetyltransferase  29.45 
 
 		 166 aa  57.8  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2533  GCN5-related N-acetyltransferase  32.84 
 
 		 163 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.162076 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0216  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  30.06 
 
 		 225 aa  57  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0274  siderophore biosynthesis protein IucB (N6-hydroxylysine acetyl transferase)  27.01 
 
 		 303 aa  57  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.173921  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2479  GCN5-related N-acetyltransferase  31.34 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0272191 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4816  GCN5-like N-acetyltransferase  29.47 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.231469  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0918  GCN5-related N-acetyltransferase  27.22 
 
 		 167 aa  53.9  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.378966  normal  0.0701309 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2964  acetyltransferase, GNAT family  38.82 
 
 		 178 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0786  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 		 169 aa  53.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.901222  normal  0.0729138 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4846  acetyltransferase  30.82 
 
 		 194 aa  52  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2439  hypothetical protein  27.33 
 
 		 187 aa  50.8  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.397369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2276  bifunctional AAC/APH  29.08 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0137497 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1134  acetyltransferase  31.76 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0596  GCN5-related N-acetyltransferase  24 
 
 		 170 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.355051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_464  acetyltransferase, GNAT family  31.58 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000240753  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2640  GCN5-related N-acetyltransferase  28.1 
 
 		 184 aa  48.1  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221093  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0589  hypothetical protein  23.73 
 
 		 187 aa  47  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3684  GCN5-related N-acetyltransferase  26.39 
 
 		 172 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0579  GCN5-related N-acetyltransferase  23.33 
 
 		 170 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3994  GCN5-related N-acetyltransferase  29.1 
 
 		 175 aa  46.6  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2020  GCN5-related N-acetyltransferase  21.83 
 
 		 159 aa  45.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.712015  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2594  hypothetical protein  26.74 
 
 		 187 aa  44.3  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184474  normal  0.69464 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2896  GCN5-related N-acetyltransferase  32.5 
 
 		 198 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1552  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.97 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0523  acetyltransferase  34.44 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00459421  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4324  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  27.85 
 
 		 205 aa  43.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2344  GCN5-related N-acetyltransferase  29.3 
 
 		 234 aa  43.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.708691  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4412  hypothetical protein  28.57 
 
 		 222 aa  42.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1462  GCN5-related N-acetyltransferase  38.03 
 
 		 207 aa  42.4  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2254  GCN5-related N-acetyltransferase  36.92 
 
 		 166 aa  42.4  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4748  hypothetical protein  24.4 
 
 		 400 aa  42.4  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.586037 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0799  GCN5-related N-acetyltransferase  38.57 
 
 		 148 aa  40.8  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.576419 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>