122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3760 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3760  IucA/IucC family protein  100 
 
 		 594 aa  1182    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.130185 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4016  IucA/IucC family protein  90.08 
 
 		 595 aa  1049    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0306734  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4055  IucA/IucC family protein  97.98 
 
 		 594 aa  1163    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0250939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2302  siderophore synthetase component  53.18 
 
 		 609 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.867655  normal  0.869204 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4392  IucA/IucC  51.29 
 
 		 596 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2632  IucA/IucC family protein  50.43 
 
 		 593 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3522  IucA/IucC family protein  42.98 
 
 		 610 aa  446  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3346  petrobactin biosynthesis protein AsbA  32.89 
 
 		 602 aa  317  4e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00585589  hitchhiker  0.0000000000000409747 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1812  siderophore biosynthesis protein  32.34 
 
 		 602 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000021038  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2016  petrobactin biosynthesis protein AsbA  32.34 
 
 		 602 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2796000000000001e-41 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1838  siderophore biosynthesis protein  32.34 
 
 		 602 aa  313  5.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.846084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1981  siderophore biosynthesis protein  32.34 
 
 		 602 aa  313  5.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.978268  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1795  siderophore biosynthesis protein  32.51 
 
 		 602 aa  313  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1844  IucA/IucC family protein  32.67 
 
 		 602 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0027586  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1983  petrobactin biosynthesis protein AsbA  32.35 
 
 		 602 aa  307  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0967971  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0410  IucA/IucC  36.97 
 
 		 578 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.4179  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3334  IucA/IucC family protein  37.39 
 
 		 591 aa  283  5.000000000000001e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0215  IucA/IucC family protein  39.3 
 
 		 645 aa  278  1e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3331  IucA/IucC family protein  39.06 
 
 		 601 aa  279  1e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2837  IucA/IucC  32.62 
 
 		 606 aa  270  7e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.296013  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1808  IucA/IucC family protein  38.91 
 
 		 601 aa  263  4.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.653544  normal  0.276743 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0591  siderophore biosynthesis protein  32.16 
 
 		 810 aa  248  2e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3257  IucA/IucC family protein  32.27 
 
 		 584 aa  244  3e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0660  IucA/IucC family protein  39.83 
 
 		 570 aa  235  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00702947  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5062  IucA/IucC family protein  37.44 
 
 		 588 aa  229  8e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806169 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4056  IucA/IucC  33.99 
 
 		 672 aa  221  3e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.512402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3172  IucA/IucC family protein  30.33 
 
 		 818 aa  215  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0585  IucA/IucC family protein  31.24 
 
 		 925 aa  197  6e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0718  iron transporter  32.79 
 
 		 613 aa  196  1e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0698719 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4783  IucA/IucC  31.11 
 
 		 610 aa  186  8e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00878  siderophore biosynthesis protein  32.53 
 
 		 611 aa  171  5e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0338478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0947  IucA/IucC family protein  31.04 
 
 		 574 aa  167  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.251332  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1814  siderophore synthetase component, IucA/IucC  28.1 
 
 		 560 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00455454  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4634  aerobactin synthase, IucA component  30 
 
 		 574 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0107  IucA/IucC family protein  27.96 
 
 		 578 aa  163  7e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0111  IucA/IucC family protein  27.96 
 
 		 578 aa  163  7e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3182  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucA  29.65 
 
 		 574 aa  163  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0922  IucA/IucC family protein  32.08 
 
 		 581 aa  159  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.285296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0714  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucA  31.72 
 
 		 590 aa  159  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0786  IucA/IucC family protein  31.72 
 
 		 590 aa  159  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001063  vibrioferrin amide bond forming protein PvsD  28.82 
 
 		 580 aa  157  4e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3094  iron transporter  30.15 
 
 		 584 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01928  iron transporter  30.06 
 
 		 576 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1113  IucA/IucC  32.4 
 
 		 608 aa  146  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3139  IucA/IucC family protein  27.56 
 
 		 586 aa  146  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09310  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  31.95 
 
 		 586 aa  144  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00047621  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1276  IucA/IucC  27.35 
 
 		 684 aa  140  7.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  27.52 
 
 		 1148 aa  140  8.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3750  IucA/IucC family protein  32.19 
 
 		 599 aa  139  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2971  IucA/IucC family protein  33.04 
 
 		 555 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.963882 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  31.82 
 
 		 1153 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2584  IucA/IucC  26.42 
 
 		 594 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0652267  decreased coverage  0.000722878 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2677  IucA/IucC family protein  26.55 
 
 		 628 aa  121  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.211511  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8365  putative iron transport protein  30.41 
 
 		 519 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  32.33 
 
 		 998 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  31.78 
 
 		 998 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  31.89 
 
 		 991 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2631  IucA/IucC family protein  30.79 
 
 		 577 aa  87  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2210  hypothetical protein  23.06 
 
 		 585 aa  85.9  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2249  hypothetical protein  23.06 
 
 		 585 aa  85.9  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2301  siderophore synthetase component  28.57 
 
 		 562 aa  81.6  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0949  IucA/IucC family protein  30.21 
 
 		 577 aa  80.9  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1652  siderophore synthase  24.12 
 
 		 588 aa  78.6  0.0000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001065  vibrioferrin amide bond forming protein PvsB  24.19 
 
 		 610 aa  77.8  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1779  hypothetical protein  21.5 
 
 		 585 aa  76.6  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.762831  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4393  IucA/IucC  27.93 
 
 		 577 aa  75.5  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0888  IucA/IucC family protein  23.57 
 
 		 720 aa  69.7  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3523  IucA/IucC family protein  27.25 
 
 		 615 aa  70.1  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4632  aerobactin synthase, IucC component  27.49 
 
 		 580 aa  70.1  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3734  IucA/IucC family protein  27.43 
 
 		 563 aa  69.3  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0245205  normal  0.144633 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0920  IucA/IucC family protein  25.87 
 
 		 582 aa  67.4  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185756  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2674  IucA/IucC family protein  23.41 
 
 		 618 aa  67  0.0000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.247069  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3180  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  25.71 
 
 		 580 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3092  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  29.79 
 
 		 587 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2212  hypothetical protein  23.45 
 
 		 656 aa  64.7  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2251  hypothetical protein  23.45 
 
 		 656 aa  64.7  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3733  IucA/IucC family protein  27.79 
 
 		 557 aa  63.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0935352  normal  0.031282 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0174  IucA/IucC family protein  29.34 
 
 		 655 aa  63.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0181  IucA/IucC family protein  29.43 
 
 		 655 aa  63.5  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6950  IucA/IucC family protein  28.65 
 
 		 587 aa  61.6  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0288  IucA/IucC family protein  25.78 
 
 		 635 aa  60.8  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2587  IucA/IucC  26.89 
 
 		 619 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.296644  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0712  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  26.57 
 
 		 582 aa  60.1  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0192  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  26.57 
 
 		 582 aa  60.1  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000752976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0784  IucA/IucC family protein  26.57 
 
 		 582 aa  60.1  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0515  IucA/IucC family protein  25.26 
 
 		 625 aa  60.1  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1781  hypothetical protein  22.89 
 
 		 653 aa  59.7  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2970  IucA/IucC family protein  30.72 
 
 		 546 aa  57.4  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1112  IucA/IucC  24.66 
 
 		 617 aa  55.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28831  normal  0.852167 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01930  vibrioferrin biosynthesis protein PvsB  27.59 
 
 		 600 aa  56.2  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00879  siderophore biosynthesis protein  26.55 
 
 		 589 aa  55.1  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0128879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2737  IucA/IucC family protein  27 
 
 		 596 aa  54.7  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425518  normal  0.263271 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09330  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  25.53 
 
 		 592 aa  54.3  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0934837  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  25.82 
 
 		 842 aa  53.5  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2548  IucA/IucC family protein  24.62 
 
 		 596 aa  53.5  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.507194 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3906  IucA/IucC family protein  26.56 
 
 		 633 aa  53.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0108  IucA/IucC family protein  22.86 
 
 		 592 aa  51.2  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0112  IucA/IucC family protein  22.86 
 
 		 592 aa  51.2  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0635  putative siderophore biosynthesis protein  25.08 
 
 		 610 aa  50.8  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.809608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3255  IucA/IucC family protein  30.52 
 
 		 621 aa  50.1  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>