109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4056 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4056  IucA/IucC  100 
 
 		 672 aa  1316    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.512402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0660  IucA/IucC family protein  48.71 
 
 		 570 aa  488  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00702947  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1808  IucA/IucC family protein  36.42 
 
 		 601 aa  329  1.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.653544  normal  0.276743 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0410  IucA/IucC  36.84 
 
 		 578 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.4179  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2837  IucA/IucC  31.24 
 
 		 606 aa  290  7e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.296013  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3331  IucA/IucC family protein  33.19 
 
 		 601 aa  286  8e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3334  IucA/IucC family protein  33.43 
 
 		 591 aa  285  2.0000000000000002e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0215  IucA/IucC family protein  31.02 
 
 		 645 aa  259  1e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1795  siderophore biosynthesis protein  27.71 
 
 		 602 aa  237  7e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1983  petrobactin biosynthesis protein AsbA  28.38 
 
 		 602 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0967971  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3346  petrobactin biosynthesis protein AsbA  28.22 
 
 		 602 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00585589  hitchhiker  0.0000000000000409747 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1838  siderophore biosynthesis protein  27.57 
 
 		 602 aa  232  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.846084  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1812  siderophore biosynthesis protein  27.79 
 
 		 602 aa  232  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000021038  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1981  siderophore biosynthesis protein  27.57 
 
 		 602 aa  232  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.978268  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2016  petrobactin biosynthesis protein AsbA  27.79 
 
 		 602 aa  231  3e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2796000000000001e-41 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3257  IucA/IucC family protein  29.56 
 
 		 584 aa  229  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4016  IucA/IucC family protein  33.23 
 
 		 595 aa  228  3e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0306734  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1844  IucA/IucC family protein  26.78 
 
 		 602 aa  227  5.0000000000000005e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0027586  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3760  IucA/IucC family protein  34.28 
 
 		 594 aa  224  4e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.130185 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2632  IucA/IucC family protein  30.81 
 
 		 593 aa  223  7e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4055  IucA/IucC family protein  33.93 
 
 		 594 aa  221  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0250939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0591  siderophore biosynthesis protein  25.04 
 
 		 810 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4392  IucA/IucC  31.22 
 
 		 596 aa  211  5e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2302  siderophore synthetase component  30.17 
 
 		 609 aa  206  8e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.867655  normal  0.869204 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0585  IucA/IucC family protein  26.96 
 
 		 925 aa  205  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3522  IucA/IucC family protein  28.5 
 
 		 610 aa  201  5e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3172  IucA/IucC family protein  24.15 
 
 		 818 aa  194  4e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5062  IucA/IucC family protein  29.17 
 
 		 588 aa  183  7e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806169 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0718  iron transporter  29.27 
 
 		 613 aa  179  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0698719 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4783  IucA/IucC  27.72 
 
 		 610 aa  166  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1814  siderophore synthetase component, IucA/IucC  25.59 
 
 		 560 aa  161  4e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00455454  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3182  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucA  24.96 
 
 		 574 aa  159  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4634  aerobactin synthase, IucA component  25.38 
 
 		 574 aa  159  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0947  IucA/IucC family protein  25.53 
 
 		 574 aa  144  7e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.251332  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1113  IucA/IucC  28.52 
 
 		 608 aa  137  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0107  IucA/IucC family protein  24.86 
 
 		 578 aa  133  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0111  IucA/IucC family protein  24.86 
 
 		 578 aa  133  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1276  IucA/IucC  25.97 
 
 		 684 aa  130  6e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8365  putative iron transport protein  28.65 
 
 		 519 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0922  IucA/IucC family protein  28.72 
 
 		 581 aa  119  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.285296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0714  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucA  28.71 
 
 		 590 aa  117  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0786  IucA/IucC family protein  28.71 
 
 		 590 aa  117  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001063  vibrioferrin amide bond forming protein PvsD  25.11 
 
 		 580 aa  116  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  25.81 
 
 		 1148 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3750  IucA/IucC family protein  31.92 
 
 		 599 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3094  iron transporter  25.97 
 
 		 584 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2971  IucA/IucC family protein  32.54 
 
 		 555 aa  107  8e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.963882 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01928  iron transporter  24.83 
 
 		 576 aa  98.6  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  30.27 
 
 		 1153 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00878  siderophore biosynthesis protein  33.33 
 
 		 611 aa  94.7  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0338478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2677  IucA/IucC family protein  25.16 
 
 		 628 aa  84.7  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.211511  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2584  IucA/IucC  25.51 
 
 		 594 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0652267  decreased coverage  0.000722878 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0174  IucA/IucC family protein  26.39 
 
 		 655 aa  83.2  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0181  IucA/IucC family protein  26.17 
 
 		 655 aa  80.9  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0888  IucA/IucC family protein  27.1 
 
 		 720 aa  80.5  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1652  siderophore synthase  22.28 
 
 		 588 aa  77  0.0000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09310  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  27.58 
 
 		 586 aa  75.1  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00047621  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3139  IucA/IucC family protein  25.94 
 
 		 586 aa  72.8  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  26.6 
 
 		 998 aa  72.4  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2631  IucA/IucC family protein  26.68 
 
 		 577 aa  72  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2212  hypothetical protein  22.2 
 
 		 656 aa  71.2  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2251  hypothetical protein  22.2 
 
 		 656 aa  71.2  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2587  IucA/IucC  26.09 
 
 		 619 aa  70.9  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.296644  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3523  IucA/IucC family protein  25.1 
 
 		 615 aa  69.7  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1781  hypothetical protein  21.86 
 
 		 653 aa  68.2  0.0000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2674  IucA/IucC family protein  24.01 
 
 		 618 aa  67.4  0.0000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.247069  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  26.02 
 
 		 998 aa  65.5  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  29.47 
 
 		 991 aa  63.5  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0949  IucA/IucC family protein  23.72 
 
 		 577 aa  63.2  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6950  IucA/IucC family protein  29.52 
 
 		 587 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3682  IucA/IucC  27.3 
 
 		 637 aa  58.5  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0920  IucA/IucC family protein  24.61 
 
 		 582 aa  57.4  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1984  petrobactin biosynthesis protein AsbB  24.75 
 
 		 612 aa  57.4  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.216331  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0635  putative siderophore biosynthesis protein  24.27 
 
 		 610 aa  57  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.809608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0712  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  25.89 
 
 		 582 aa  57  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0192  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  25.89 
 
 		 582 aa  57  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000752976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0784  IucA/IucC family protein  25.89 
 
 		 582 aa  57  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2658  IucA/IucC family protein  26.42 
 
 		 572 aa  57  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.539637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3180  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  24.28 
 
 		 580 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4632  aerobactin synthase, IucC component  24.28 
 
 		 580 aa  55.1  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001065  vibrioferrin amide bond forming protein PvsB  43.86 
 
 		 610 aa  54.3  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1812  siderophore synthetase component, IucA/IucC  19.37 
 
 		 578 aa  53.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2301  siderophore synthetase component  24.82 
 
 		 562 aa  52.8  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1112  IucA/IucC  29.85 
 
 		 617 aa  52  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28831  normal  0.852167 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3462  IucA/IucC family protein  22.62 
 
 		 594 aa  52  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.479032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0658  IucA/IucC family protein  29.47 
 
 		 616 aa  51.2  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.577175  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1796  siderophore biosynthesis protein  24.26 
 
 		 610 aa  51.2  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3345  petrobactin biosynthesis protein AsbB  23.27 
 
 		 612 aa  50.8  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0268839  hitchhiker  0.0000000000000416803 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0108  IucA/IucC family protein  22.52 
 
 		 592 aa  50.8  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0112  IucA/IucC family protein  22.52 
 
 		 592 aa  50.8  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1839  siderophore biosynthesis protein  24.26 
 
 		 610 aa  50.4  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1813  siderophore biosynthesis protein  24.26 
 
 		 610 aa  50.4  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00844264  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1280  hypothetical protein  21.07 
 
 		 580 aa  50.4  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1982  siderophore biosynthesis protein  24.26 
 
 		 612 aa  50.4  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0288  IucA/IucC family protein  25.24 
 
 		 635 aa  50.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5060  IucA/IucC family protein  27.75 
 
 		 615 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00130311 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2017  petrobactin biosynthesis protein AsbB  24.26 
 
 		 610 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0614699999999996e-42 
 
 
-
 
NC_003296  RS00879  siderophore biosynthesis protein  26.48 
 
 		 589 aa  48.9  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0128879  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1279  hypothetical protein  20.72 
 
 		 580 aa  47.4  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3734  IucA/IucC family protein  26.88 
 
 		 563 aa  47.8  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0245205  normal  0.144633 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>