130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0660 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0660  IucA/IucC family protein  100 
 
 
570 aa  1106    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00702947  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4056  IucA/IucC  50.15 
 
 
672 aa  525  1e-148  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.512402  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1808  IucA/IucC family protein  42.23 
 
 
601 aa  380  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.653544  normal  0.276743 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0410  IucA/IucC  41.37 
 
 
578 aa  327  3e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.4179  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3334  IucA/IucC family protein  35.96 
 
 
591 aa  293  8e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2837  IucA/IucC  35.4 
 
 
606 aa  288  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.296013  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0215  IucA/IucC family protein  36.55 
 
 
645 aa  287  4e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3331  IucA/IucC family protein  35.89 
 
 
601 aa  283  5.000000000000001e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1838  siderophore biosynthesis protein  32.32 
 
 
602 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.846084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1981  siderophore biosynthesis protein  32.32 
 
 
602 aa  258  1e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.978268  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1795  siderophore biosynthesis protein  32.15 
 
 
602 aa  258  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2632  IucA/IucC family protein  35.03 
 
 
593 aa  258  3e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1983  petrobactin biosynthesis protein AsbA  31.44 
 
 
602 aa  258  3e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0967971  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2016  petrobactin biosynthesis protein AsbA  32.14 
 
 
602 aa  257  5e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2796000000000001e-41 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1812  siderophore biosynthesis protein  32.14 
 
 
602 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000021038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3346  petrobactin biosynthesis protein AsbA  31.07 
 
 
602 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00585589  hitchhiker  0.0000000000000409747 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1844  IucA/IucC family protein  29.52 
 
 
602 aa  246  9e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0027586  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3760  IucA/IucC family protein  40 
 
 
594 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.130185 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4055  IucA/IucC family protein  39.58 
 
 
594 aa  243  7.999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0250939  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4016  IucA/IucC family protein  39.24 
 
 
595 aa  241  4e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0306734  normal  0.343521 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2302  siderophore synthetase component  35.79 
 
 
609 aa  234  3e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.867655  normal  0.869204 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3522  IucA/IucC family protein  34.24 
 
 
610 aa  230  4e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3257  IucA/IucC family protein  32.45 
 
 
584 aa  228  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0591  siderophore biosynthesis protein  29.29 
 
 
810 aa  226  1e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.124028  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4392  IucA/IucC  33.56 
 
 
596 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3172  IucA/IucC family protein  25.97 
 
 
818 aa  208  3e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5062  IucA/IucC family protein  34.51 
 
 
588 aa  207  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806169 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0585  IucA/IucC family protein  29.77 
 
 
925 aa  194  5e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4783  IucA/IucC  30.81 
 
 
610 aa  192  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1814  siderophore synthetase component, IucA/IucC  26.97 
 
 
560 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00455454  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00878  siderophore biosynthesis protein  34 
 
 
611 aa  182  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0338478  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3750  IucA/IucC family protein  37.21 
 
 
599 aa  179  9e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0718  iron transporter  29.39 
 
 
613 aa  177  4e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0698719 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8365  putative iron transport protein  34.87 
 
 
519 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1113  IucA/IucC  32.36 
 
 
608 aa  171  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2971  IucA/IucC family protein  34.87 
 
 
555 aa  171  4e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.963882 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4634  aerobactin synthase, IucA component  28.96 
 
 
574 aa  171  4e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0947  IucA/IucC family protein  29.01 
 
 
574 aa  170  8e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.251332  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3182  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucA  28.47 
 
 
574 aa  168  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0922  IucA/IucC family protein  30.1 
 
 
581 aa  162  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.285296  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09310  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  30.52 
 
 
586 aa  162  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00047621  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  32.23 
 
 
1153 aa  160  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0714  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucA  29.65 
 
 
590 aa  157  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0786  IucA/IucC family protein  29.65 
 
 
590 aa  157  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3094  iron transporter  30.63 
 
 
584 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  28.81 
 
 
1148 aa  153  7e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0107  IucA/IucC family protein  27.35 
 
 
578 aa  150  8e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0111  IucA/IucC family protein  27.35 
 
 
578 aa  150  8e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01928  iron transporter  28.48 
 
 
576 aa  144  5e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3139  IucA/IucC family protein  25.84 
 
 
586 aa  136  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001063  vibrioferrin amide bond forming protein PvsD  24.65 
 
 
580 aa  134  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2677  IucA/IucC family protein  28.66 
 
 
628 aa  121  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.211511  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1276  IucA/IucC  24.59 
 
 
684 aa  117  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2584  IucA/IucC  26.42 
 
 
594 aa  97.4  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0652267  decreased coverage  0.000722878 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  27.72 
 
 
998 aa  91.3  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3523  IucA/IucC family protein  29.18 
 
 
615 aa  87.8  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0174  IucA/IucC family protein  29.17 
 
 
655 aa  86.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  28.16 
 
 
998 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0181  IucA/IucC family protein  31.15 
 
 
655 aa  81.6  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1652  siderophore synthase  25.6 
 
 
588 aa  81.3  0.00000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1781  hypothetical protein  21.4 
 
 
653 aa  79.7  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0888  IucA/IucC family protein  29.27 
 
 
720 aa  77.8  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2631  IucA/IucC family protein  27.13 
 
 
577 aa  77.8  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  28.16 
 
 
991 aa  77.4  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2210  hypothetical protein  22.73 
 
 
585 aa  75.1  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2249  hypothetical protein  22.73 
 
 
585 aa  75.1  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001065  vibrioferrin amide bond forming protein PvsB  24.44 
 
 
610 aa  74.3  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0949  IucA/IucC family protein  27.03 
 
 
577 aa  73.9  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2301  siderophore synthetase component  27.13 
 
 
562 aa  70.9  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2212  hypothetical protein  21.59 
 
 
656 aa  69.7  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2251  hypothetical protein  21.59 
 
 
656 aa  69.7  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3734  IucA/IucC family protein  28.57 
 
 
563 aa  68.2  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0245205  normal  0.144633 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3682  IucA/IucC  29.31 
 
 
637 aa  67.8  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2674  IucA/IucC family protein  24 
 
 
618 aa  66.6  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.247069  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3180  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  26.18 
 
 
580 aa  65.1  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4393  IucA/IucC  26.49 
 
 
577 aa  64.7  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0920  IucA/IucC family protein  26.4 
 
 
582 aa  63.9  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185756  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2658  IucA/IucC family protein  26.22 
 
 
572 aa  63.5  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.539637  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4632  aerobactin synthase, IucC component  26.13 
 
 
580 aa  63.5  0.000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01930  vibrioferrin biosynthesis protein PvsB  28.05 
 
 
600 aa  63.5  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3462  IucA/IucC family protein  23.65 
 
 
594 aa  62.8  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.479032  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00876  putative siderophore biosynthesis protein  28.69 
 
 
629 aa  62  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0231635  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5060  IucA/IucC family protein  28.41 
 
 
615 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00130311 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1779  hypothetical protein  22.64 
 
 
585 aa  61.2  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.762831  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3137  IucA/IucC family protein  25.89 
 
 
570 aa  60.5  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6950  IucA/IucC family protein  35.06 
 
 
587 aa  60.8  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3092  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  27.25 
 
 
587 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1279  hypothetical protein  25.83 
 
 
580 aa  59.3  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1984  petrobactin biosynthesis protein AsbB  20.5 
 
 
612 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.216331  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0712  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  25 
 
 
582 aa  57.4  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0192  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  25 
 
 
582 aa  57.4  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000752976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0784  IucA/IucC family protein  25 
 
 
582 aa  57.4  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0658  IucA/IucC family protein  34.27 
 
 
616 aa  57.4  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.577175  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1813  siderophore biosynthesis protein  22.46 
 
 
610 aa  56.2  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00844264  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1280  hypothetical protein  25.5 
 
 
580 aa  57  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1839  siderophore biosynthesis protein  22.46 
 
 
610 aa  56.2  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1796  siderophore biosynthesis protein  23.15 
 
 
610 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2587  IucA/IucC  22.67 
 
 
619 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.296644  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1982  siderophore biosynthesis protein  22.46 
 
 
612 aa  56.2  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2970  IucA/IucC family protein  28.79 
 
 
546 aa  55.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>