93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS00876 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS00876  putative siderophore biosynthesis protein  100 
 
 		 629 aa  1233    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0231635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1115  IucA/IucC  51.22 
 
 		 589 aa  523  1e-147  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0105  IucA/IucC family protein  30.26 
 
 		 584 aa  243  9e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.379013  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0109  IucA/IucC family protein  30.26 
 
 		 584 aa  243  9e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110366  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2672  IucA/IucC family protein  33.05 
 
 		 637 aa  223  9e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2589  IucA/IucC  32.92 
 
 		 627 aa  213  7e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0521559  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0588  putative siderophore biosynthesis protein  34.09 
 
 		 564 aa  211  3e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6950  IucA/IucC family protein  35.07 
 
 		 587 aa  204  5e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09330  siderophore biosynthesis protein, IucA/IucC family  29.26 
 
 		 592 aa  93.6  9e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0934837  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001065  vibrioferrin amide bond forming protein PvsB  24.25 
 
 		 610 aa  89.4  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3092  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  27.4 
 
 		 587 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2301  siderophore synthetase component  26.97 
 
 		 562 aa  80.9  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4393  IucA/IucC  26.48 
 
 		 577 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3137  IucA/IucC family protein  27.33 
 
 		 570 aa  74.3  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01930  vibrioferrin biosynthesis protein PvsB  26.32 
 
 		 600 aa  72.4  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2631  IucA/IucC family protein  26.11 
 
 		 577 aa  72.4  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3734  IucA/IucC family protein  23.9 
 
 		 563 aa  71.6  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0245205  normal  0.144633 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0718  iron transporter  27.82 
 
 		 613 aa  70.9  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0698719 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1796  siderophore biosynthesis protein  21.08 
 
 		 610 aa  68.2  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1278  IucA/IucC  22.32 
 
 		 602 aa  67.8  0.0000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2970  IucA/IucC family protein  31.4 
 
 		 546 aa  67.8  0.0000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00879  siderophore biosynthesis protein  28.12 
 
 		 589 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0128879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1984  petrobactin biosynthesis protein AsbB  22.45 
 
 		 612 aa  65.1  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.216331  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1112  IucA/IucC  27.91 
 
 		 617 aa  65.1  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28831  normal  0.852167 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2017  petrobactin biosynthesis protein AsbB  21.38 
 
 		 610 aa  64.7  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0614699999999996e-42 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1982  siderophore biosynthesis protein  21.89 
 
 		 612 aa  64.7  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1813  siderophore biosynthesis protein  21.38 
 
 		 610 aa  64.7  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00844264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1839  siderophore biosynthesis protein  21.38 
 
 		 610 aa  64.7  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0112  IucA/IucC family protein  22.44 
 
 		 592 aa  62.8  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0108  IucA/IucC family protein  22.44 
 
 		 592 aa  62.8  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0720  hypothetical protein  25.25 
 
 		 640 aa  61.2  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.72234  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  29.3 
 
 		 998 aa  60.5  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0660  IucA/IucC family protein  28.54 
 
 		 570 aa  60.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00702947  normal  0.916687 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  29.71 
 
 		 998 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3345  petrobactin biosynthesis protein AsbB  22.93 
 
 		 612 aa  60.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0268839  hitchhiker  0.0000000000000416803 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3328  IucA/IucC family protein  26.86 
 
 		 614 aa  59.7  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.935658 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2658  IucA/IucC family protein  26.87 
 
 		 572 aa  59.3  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.539637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  29.61 
 
 		 991 aa  58.5  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1808  IucA/IucC family protein  26.29 
 
 		 601 aa  58.2  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.653544  normal  0.276743 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8364  putative siderophore biosynthesis protein  25.39 
 
 		 545 aa  58.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3749  IucA/IucC family protein  30.12 
 
 		 563 aa  57.8  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.959058  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1279  hypothetical protein  22.53 
 
 		 580 aa  57.8  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0288  IucA/IucC family protein  29.1 
 
 		 635 aa  56.6  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  28.97 
 
 		 842 aa  56.2  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  24.34 
 
 		 1148 aa  56.2  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3255  IucA/IucC family protein  25.89 
 
 		 621 aa  56.2  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2837  IucA/IucC family protein  25.75 
 
 		 607 aa  55.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18665  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1280  hypothetical protein  22.48 
 
 		 580 aa  55.8  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0199  IucA/IucC family protein  30.46 
 
 		 602 aa  55.8  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0412549 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0515  IucA/IucC family protein  28.52 
 
 		 625 aa  55.5  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1801  IucA/IucC family protein  34 
 
 		 799 aa  54.7  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000155987  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3733  IucA/IucC family protein  27.8 
 
 		 557 aa  54.7  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0935352  normal  0.031282 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1845  IucA/IucC family protein  23.08 
 
 		 613 aa  54.3  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.330256  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2587  IucA/IucC  24.13 
 
 		 619 aa  54.3  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.296644  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0888  IucA/IucC family protein  24.71 
 
 		 720 aa  53.9  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1812  siderophore synthetase component, IucA/IucC  19.78 
 
 		 578 aa  53.9  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0136  siderophore biosynthesis protein  23.33 
 
 		 819 aa  53.9  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0949  IucA/IucC family protein  31.71 
 
 		 577 aa  53.9  0.000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4632  aerobactin synthase, IucC component  26.73 
 
 		 580 aa  52.8  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0174  IucA/IucC family protein  28.47 
 
 		 655 aa  53.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3180  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  28 
 
 		 580 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1113  IucA/IucC  29.41 
 
 		 608 aa  51.2  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2837  IucA/IucC  26.09 
 
 		 606 aa  50.8  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.296013  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3523  IucA/IucC family protein  25.44 
 
 		 615 aa  50.4  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0181  IucA/IucC family protein  29.75 
 
 		 655 aa  50.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2836  IucA/IucC family protein  29.25 
 
 		 608 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4785  IucA/IucC  24.56 
 
 		 599 aa  50.4  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00878  siderophore biosynthesis protein  25 
 
 		 611 aa  50.1  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0338478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1652  siderophore synthase  18.52 
 
 		 588 aa  49.3  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0585  IucA/IucC family protein  30.92 
 
 		 925 aa  48.9  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2544  IucA/IucC family protein  27.78 
 
 		 614 aa  48.5  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  27.56 
 
 		 1153 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0407  IucA/IucC  33.33 
 
 		 601 aa  48.5  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27175  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2249  hypothetical protein  21.46 
 
 		 585 aa  48.1  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2210  hypothetical protein  21.46 
 
 		 585 aa  48.1  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2445  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  27.78 
 
 		 614 aa  47.8  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0920  IucA/IucC family protein  24.01 
 
 		 582 aa  47.8  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4292  IucA/IucC family protein  25.23 
 
 		 597 aa  47.8  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489466  hitchhiker  0.00330556 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0658  IucA/IucC family protein  33.33 
 
 		 616 aa  47  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.577175  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1654  IucA/IucC family protein  28.44 
 
 		 642 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000012306 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3032  siderophore biosynthesis protein, putative  22.8 
 
 		 601 aa  47  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5060  IucA/IucC family protein  36.89 
 
 		 615 aa  45.8  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00130311 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2439  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  22.35 
 
 		 604 aa  45.8  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2413  IucA/IucC family protein  28.28 
 
 		 642 aa  45.4  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0410  IucA/IucC  26.62 
 
 		 578 aa  45.8  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.4179  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1071  IucA/IucC family protein  32.03 
 
 		 613 aa  45.8  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.549269  normal  0.885774 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2674  IucA/IucC family protein  23.6 
 
 		 618 aa  45.1  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.247069  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2710  IucA/IucC family protein  28.44 
 
 		 642 aa  45.1  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0594  siderophore biosynthesis protein  26.09 
 
 		 639 aa  45.1  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00413673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2811  IucA/IucC family protein  28.44 
 
 		 642 aa  44.7  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2732  IucA/IucC family protein  28.44 
 
 		 642 aa  44.7  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00744667  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0218  IucA/IucC family protein  27.95 
 
 		 621 aa  43.9  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1811  IucA/IucC family protein  41.1 
 
 		 599 aa  43.9  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>