141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3328 on replicon NC_013201
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013201  Hmuk_3328  IucA/IucC family protein  100 
 
 
614 aa  1252    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.935658 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2833  IucA/IucC  47.73 
 
 
813 aa  595  1e-169  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76703  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0218  IucA/IucC family protein  49.59 
 
 
621 aa  575  1.0000000000000001e-163  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0407  IucA/IucC  48.17 
 
 
601 aa  567  1e-160  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27175  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1811  IucA/IucC family protein  42.74 
 
 
599 aa  437  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0594  siderophore biosynthesis protein  39.32 
 
 
639 aa  435  1e-120  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00413673  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3174  IucA/IucC family protein  35.1 
 
 
615 aa  386  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.443243  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1654  IucA/IucC family protein  35.18 
 
 
642 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000012306 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2710  IucA/IucC family protein  35 
 
 
642 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2732  IucA/IucC family protein  35 
 
 
642 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00744667  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2811  IucA/IucC family protein  35 
 
 
642 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2413  IucA/IucC family protein  34.46 
 
 
642 aa  365  1e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1518  IucA/IucC family protein  33.81 
 
 
631 aa  360  6e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.918024 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1508  IucA/IucC family protein  33.93 
 
 
631 aa  360  6e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3032  siderophore biosynthesis protein, putative  33.98 
 
 
601 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1452  IucA/IucC family protein  33.63 
 
 
629 aa  357  5e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2836  IucA/IucC family protein  34.4 
 
 
608 aa  351  3e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160458  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0136  siderophore biosynthesis protein  32.82 
 
 
819 aa  348  2e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0515  IucA/IucC family protein  33.99 
 
 
625 aa  343  5.999999999999999e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3255  IucA/IucC family protein  34.93 
 
 
621 aa  340  5.9999999999999996e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4292  IucA/IucC family protein  35.51 
 
 
597 aa  338  1.9999999999999998e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489466  hitchhiker  0.00330556 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0288  IucA/IucC family protein  35.17 
 
 
635 aa  338  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2837  IucA/IucC family protein  32.89 
 
 
607 aa  336  9e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18665  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0658  IucA/IucC family protein  37.54 
 
 
616 aa  334  3e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.577175  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  36.44 
 
 
842 aa  332  1e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1071  IucA/IucC family protein  35.33 
 
 
613 aa  324  2e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.549269  normal  0.885774 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5060  IucA/IucC family protein  35.8 
 
 
615 aa  325  2e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00130311 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3462  IucA/IucC family protein  35.18 
 
 
594 aa  324  4e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.479032  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2737  IucA/IucC family protein  34.56 
 
 
596 aa  320  5e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425518  normal  0.263271 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2439  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  33.92 
 
 
604 aa  318  1e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2538  IucA/IucC family protein  33.51 
 
 
604 aa  314  2.9999999999999996e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.836144  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2544  IucA/IucC family protein  32.31 
 
 
614 aa  311  2e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2548  IucA/IucC family protein  33.39 
 
 
596 aa  310  5e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.507194 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2445  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  32.14 
 
 
614 aa  309  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4058  IucA/IucC  32.65 
 
 
716 aa  301  2e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.309342  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0920  IucA/IucC family protein  31.43 
 
 
582 aa  297  5e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185756  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2658  IucA/IucC family protein  29.22 
 
 
572 aa  284  4.0000000000000003e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.539637  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0949  IucA/IucC family protein  30.18 
 
 
577 aa  281  2e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0192  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  30 
 
 
582 aa  277  5e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000752976 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0784  IucA/IucC family protein  30 
 
 
582 aa  277  5e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0712  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  29.82 
 
 
582 aa  275  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3180  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  30.36 
 
 
580 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4632  aerobactin synthase, IucC component  30.36 
 
 
580 aa  272  1e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0199  IucA/IucC family protein  33.51 
 
 
602 aa  270  5.9999999999999995e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0412549 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1801  IucA/IucC family protein  34.61 
 
 
799 aa  261  3e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000155987  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1984  petrobactin biosynthesis protein AsbB  27.96 
 
 
612 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.216331  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1839  siderophore biosynthesis protein  26.42 
 
 
610 aa  249  7e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2017  petrobactin biosynthesis protein AsbB  26.42 
 
 
610 aa  249  7e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0614699999999996e-42 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1796  siderophore biosynthesis protein  26.59 
 
 
610 aa  249  8e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1813  siderophore biosynthesis protein  26.42 
 
 
610 aa  249  9e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00844264  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1982  siderophore biosynthesis protein  26.54 
 
 
612 aa  249  9e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3345  petrobactin biosynthesis protein AsbB  26.93 
 
 
612 aa  248  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0268839  hitchhiker  0.0000000000000416803 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1812  siderophore synthetase component, IucA/IucC  25.98 
 
 
578 aa  234  4.0000000000000004e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2674  IucA/IucC family protein  28.11 
 
 
618 aa  221  3.9999999999999997e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.247069  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2587  IucA/IucC  28.21 
 
 
619 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.296644  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1845  IucA/IucC family protein  25.9 
 
 
613 aa  216  9e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.330256  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1112  IucA/IucC  28.6 
 
 
617 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28831  normal  0.852167 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0108  IucA/IucC family protein  28.04 
 
 
592 aa  211  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0112  IucA/IucC family protein  28.04 
 
 
592 aa  211  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  28.95 
 
 
1148 aa  205  2e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00879  siderophore biosynthesis protein  28.38 
 
 
589 aa  186  8e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0128879  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  29.5 
 
 
998 aa  182  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2301  siderophore synthetase component  28.1 
 
 
562 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2631  IucA/IucC family protein  27.59 
 
 
577 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  30.14 
 
 
998 aa  172  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  29.61 
 
 
1153 aa  168  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  27.67 
 
 
991 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3523  IucA/IucC family protein  29.66 
 
 
615 aa  167  5e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4393  IucA/IucC  29.44 
 
 
577 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1652  siderophore synthase  24.34 
 
 
588 aa  117  6.9999999999999995e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1280  hypothetical protein  27 
 
 
580 aa  115  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1279  hypothetical protein  26.71 
 
 
580 aa  114  4.0000000000000004e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0181  IucA/IucC family protein  26.57 
 
 
655 aa  99.8  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0174  IucA/IucC family protein  26.28 
 
 
655 aa  97.8  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0718  iron transporter  25.24 
 
 
613 aa  93.2  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0698719 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0888  IucA/IucC family protein  27.46 
 
 
720 aa  91.3  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3906  IucA/IucC family protein  23.38 
 
 
633 aa  89.4  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0635  putative siderophore biosynthesis protein  22.7 
 
 
610 aa  86.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.809608  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3092  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  26.33 
 
 
587 aa  80.9  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3734  IucA/IucC family protein  25.45 
 
 
563 aa  79.3  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0245205  normal  0.144633 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2672  IucA/IucC family protein  22.7 
 
 
637 aa  76.3  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3682  IucA/IucC  23.39 
 
 
637 aa  75.1  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2212  hypothetical protein  22.59 
 
 
656 aa  74.7  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2251  hypothetical protein  22.59 
 
 
656 aa  74.7  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2715  FrgA protein  22.41 
 
 
575 aa  74.3  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2846  FrgA protein  22.48 
 
 
575 aa  73.6  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2584  IucA/IucC  24.13 
 
 
594 aa  70.9  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0652267  decreased coverage  0.000722878 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0720  hypothetical protein  25.93 
 
 
640 aa  70.1  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.72234  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1781  hypothetical protein  21.72 
 
 
653 aa  69.7  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0585  IucA/IucC family protein  26.16 
 
 
925 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4783  IucA/IucC  24.7 
 
 
610 aa  67.4  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00878  siderophore biosynthesis protein  24.18 
 
 
611 aa  67  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0338478  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2589  IucA/IucC  22 
 
 
627 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0521559  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1113  IucA/IucC  25.52 
 
 
608 aa  66.2  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2677  IucA/IucC family protein  29.1 
 
 
628 aa  63.9  0.000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.211511  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2210  hypothetical protein  22.19 
 
 
585 aa  63.2  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2249  hypothetical protein  22.19 
 
 
585 aa  63.2  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0105  IucA/IucC family protein  21.47 
 
 
584 aa  62.8  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.379013  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0109  IucA/IucC family protein  21.47 
 
 
584 aa  62.8  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110366  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001063  vibrioferrin amide bond forming protein PvsD  21.41 
 
 
580 aa  62  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>