More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2300 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2300  acyl-CoA synthetase  100 
 
 		 423 aa  857    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4394  acyl-CoA synthetase  80.05 
 
 		 423 aa  692    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.812146 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2630  acyl-CoA synthetase  73.63 
 
 		 421 aa  633  1e-180  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.261373  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  59.62 
 
 		 991 aa  482  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  58.43 
 
 		 998 aa  481  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  57.72 
 
 		 998 aa  476  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3524  acyl-CoA synthetase  46.52 
 
 		 433 aa  356  3.9999999999999996e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.12114  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2018  acyl-CoA synthetase  38.48 
 
 		 412 aa  295  1e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.75082e-44 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1814  acyl-CoA synthetase  38.48 
 
 		 412 aa  293  3e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0396009  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1840  acyl-CoA synthetase  38.48 
 
 		 412 aa  293  4e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1983  acyl-CoA synthetase  38.48 
 
 		 412 aa  293  4e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1846  acyl-CoA synthetase  38.67 
 
 		 412 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.259612  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1797  acyl-CoA synthetase  38.23 
 
 		 412 aa  289  8e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3344  acyl-CoA synthetase  36.23 
 
 		 412 aa  286  4e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.685443  hitchhiker  0.0000000000000207537 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1985  acyl-CoA synthetase  38.12 
 
 		 412 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0371  AMP-dependent synthetase and ligase  28.27 
 
 		 544 aa  106  8e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00566676  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1738  AMP-dependent synthetase and ligase  28.37 
 
 		 549 aa  100  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0121059  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  28.99 
 
 		 510 aa  97.8  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0770  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  23.91 
 
 		 451 aa  96.7  6e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  23.84 
 
 		 513 aa  97.1  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  28.19 
 
 		 4575 aa  95.9  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3639  acyl-CoA synthetase  23.96 
 
 		 487 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  23.79 
 
 		 500 aa  93.6  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1667  AMP-binding domain protein  26.93 
 
 		 549 aa  93.2  7e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.327549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0473  O-succinylbenzoate-CoA ligase  24.92 
 
 		 453 aa  93.2  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0829722  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  26.47 
 
 		 525 aa  93.2  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  26.12 
 
 		 492 aa  92.4  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  25.51 
 
 		 520 aa  92  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1581  acyl-CoA synthetase  24.71 
 
 		 487 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000337564  normal  0.0607251 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6735  AMP-dependent synthetase and ligase  27.56 
 
 		 503 aa  91.3  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3770  acyl-CoA synthetase  29.36 
 
 		 548 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1106  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.58 
 
 		 557 aa  91.3  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.422125  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8762  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.38 
 
 		 510 aa  91.3  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3736  acyl-CoA synthetase  23.91 
 
 		 487 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3330  acyl-CoA synthetase  23.96 
 
 		 559 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.13397  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6185  AMP-dependent synthetase and ligase  28.94 
 
 		 574 aa  90.9  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3556  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.58 
 
 		 557 aa  90.9  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207193  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.22 
 
 		 512 aa  90.9  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3537  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.58 
 
 		 557 aa  90.9  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3563  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.58 
 
 		 557 aa  90.9  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3380  acyl-CoA synthetase  23.96 
 
 		 559 aa  90.5  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000453165  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1530  AMP-dependent synthetase and ligase  26.27 
 
 		 522 aa  90.5  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0910104 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  24.23 
 
 		 553 aa  90.5  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.93 
 
 		 514 aa  90.5  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1886  pseudouridine synthase, Rsu  26.8 
 
 		 533 aa  90.1  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0064  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.45 
 
 		 557 aa  90.1  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0518  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.45 
 
 		 557 aa  90.1  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0546  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.45 
 
 		 557 aa  90.1  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3758  acyl-CoA synthetase  29.09 
 
 		 548 aa  90.1  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102214  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3831  acyl-CoA synthetase  29.09 
 
 		 548 aa  90.1  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.948087  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3419  acyl-CoA synthetase  23.33 
 
 		 559 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00837827  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4336  AMP-dependent synthetase and ligase  28.36 
 
 		 515 aa  89.4  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0623029  hitchhiker  0.00463044 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2154  AMP-dependent synthetase and ligase  29.11 
 
 		 513 aa  89  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3688  acyl-CoA synthetase  23.11 
 
 		 487 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000138735  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  22.62 
 
 		 490 aa  88.2  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0394  AMP-dependent synthetase and ligase  28.3 
 
 		 559 aa  89  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2357  AMP-binding domain protein  25.07 
 
 		 550 aa  87.8  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.210215 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3658  acyl-CoA synthetase  22.43 
 
 		 487 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0286615  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4181  acyl-CoA synthetase  27.35 
 
 		 522 aa  87.4  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.273498 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1995  AMP-dependent synthetase and ligase  26.93 
 
 		 541 aa  87.4  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3633  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.12 
 
 		 557 aa  87  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.956552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2184  AMP-dependent synthetase and ligase  26.14 
 
 		 493 aa  87  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.944129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3314  acyl-CoA synthetase  23.15 
 
 		 487 aa  87  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000215254  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3299  AMP-dependent synthetase and ligase  27.3 
 
 		 559 aa  87  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3950  AMP-dependent synthetase and ligase  27.3 
 
 		 559 aa  86.7  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0302713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2427  acyl-CoA synthetase  28.61 
 
 		 535 aa  86.7  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2833  AMP-dependent synthetase and ligase  27.15 
 
 		 568 aa  86.3  9e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0307  AMP-dependent synthetase and ligase  26.89 
 
 		 571 aa  86.3  9e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0610213 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1330  AMP-dependent synthetase and ligase  25.84 
 
 		 502 aa  86.3  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.982491 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6162  AMP-dependent synthetase and ligase  30.06 
 
 		 487 aa  85.5  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5833  AMP-dependent synthetase and ligase  29.07 
 
 		 569 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0339  AMP-dependent synthetase and ligase  28.57 
 
 		 542 aa  86.3  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00517119  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0476  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.26 
 
 		 557 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2882  AMP-dependent synthetase and ligase  26.61 
 
 		 514 aa  86.3  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  23.9 
 
 		 521 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3694  AMP-dependent synthetase and ligase  28.03 
 
 		 532 aa  85.1  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03427  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.93 
 
 		 522 aa  85.1  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.831251  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0557  AMP-binding domain protein  25.71 
 
 		 549 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2450  AMP-dependent synthetase and ligase  28.41 
 
 		 517 aa  85.1  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.459608 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0144  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.72 
 
 		 566 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2848  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.26 
 
 		 557 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  21.88 
 
 		 4968 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  25.43 
 
 		 550 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1763  AMP-dependent synthetase and ligase  28.9 
 
 		 521 aa  84.7  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3482  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.04 
 
 		 557 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0194948  hitchhiker  0.00229302 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3958  AMP-dependent synthetase and ligase  25.42 
 
 		 707 aa  84.7  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3577  amino acid adenylation domain protein  26.29 
 
 		 2412 aa  84.3  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3057  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.27 
 
 		 499 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847241  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2328  AMP-binding domain protein  25.72 
 
 		 561 aa  84  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0106  AMP-dependent synthetase and ligase  27.4 
 
 		 512 aa  84.3  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  28.24 
 
 		 506 aa  84.3  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  27.76 
 
 		 561 aa  84  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0451  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.98 
 
 		 557 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.321292  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1261  AMP-dependent synthetase and ligase  26.15 
 
 		 546 aa  83.6  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0532703  hitchhiker  0.000000308481 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4543  AMP-dependent synthetase and ligase  27.56 
 
 		 562 aa  83.6  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  24.2 
 
 		 512 aa  83.6  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.64 
 
 		 519 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2322  AMP-dependent synthetase and ligase  25.56 
 
 		 523 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000119755  normal  0.012049 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  28.24 
 
 		 565 aa  83.2  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0110  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.26 
 
 		 566 aa  83.6  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.963067 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>