More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2322 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2322  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 523 aa  1080    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000119755  normal  0.012049 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03427  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.82 
 
 		 522 aa  569  1e-161  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.831251  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3995  AMP-dependent synthetase and ligase  51.32 
 
 		 537 aa  567  1e-160  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000737641  normal  0.189989 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3695  AMP-dependent synthetase and ligase  52.96 
 
 		 534 aa  559  1e-158  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3322  AMP-dependent synthetase and ligase  51.99 
 
 		 532 aa  551  1e-155  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000803182  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3084  AMP-dependent synthetase and ligase  51.63 
 
 		 531 aa  549  1e-155  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0956  AMP-dependent synthetase and ligase  53.1 
 
 		 533 aa  548  1e-155  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.646193  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1058  AMP-dependent synthetase and ligase  53 
 
 		 533 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.599602  normal  0.879487 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1025  AMP-dependent synthetase and ligase  53.1 
 
 		 533 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3334  AMP-dependent synthetase and ligase  52.71 
 
 		 533 aa  545  1e-154  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0892803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0970  AMP-dependent synthetase and ligase  52.22 
 
 		 533 aa  543  1e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3231  AMP-dependent synthetase and ligase  52.18 
 
 		 534 aa  537  1e-151  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000448213  normal  0.730696 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3664  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.52 
 
 		 532 aa  535  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2897  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.13 
 
 		 531 aa  531  1e-150  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00596817  normal  0.874412 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3139  AMP-dependent synthetase and ligase  51.99 
 
 		 534 aa  534  1e-150  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000126557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  49.32 
 
 		 532 aa  533  1e-150  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0883  AMP-dependent synthetase and ligase  51.61 
 
 		 534 aa  528  1e-149  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000227614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2934  AMP-dependent synthetase and ligase  47.64 
 
 		 535 aa  526  1e-148  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1593  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.86 
 
 		 558 aa  501  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1468  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.15 
 
 		 563 aa  494  9.999999999999999e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1886  pseudouridine synthase, Rsu  47.15 
 
 		 533 aa  491  1e-137  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.13 
 
 		 562 aa  487  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21340  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46 
 
 		 562 aa  487  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.556582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1824  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.44 
 
 		 562 aa  484  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.919675  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3845  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.52 
 
 		 562 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4098  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.06 
 
 		 562 aa  479  1e-134  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3836  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.93 
 
 		 562 aa  479  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.934306 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3844  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.8 
 
 		 565 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1339  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.07 
 
 		 562 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.697994  normal  0.273492 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4056  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.99 
 
 		 565 aa  478  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.602751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1573  AMP-dependent synthetase and ligase  45.22 
 
 		 565 aa  480  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.750238  hitchhiker  0.00328561 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4549  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.8 
 
 		 565 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.835945  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4550  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.88 
 
 		 562 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4057  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.69 
 
 		 562 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1495  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.73 
 
 		 562 aa  475  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.246606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1340  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.8 
 
 		 565 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0671762 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4097  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.92 
 
 		 563 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3834  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.51 
 
 		 563 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1825  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.23 
 
 		 562 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0156421  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5859  AMP-dependent synthetase and ligase  45.95 
 
 		 567 aa  463  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4353  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.86 
 
 		 565 aa  463  1e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1496  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.42 
 
 		 562 aa  463  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00382962  normal  0.913508 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21370  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.05 
 
 		 562 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0289  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.51 
 
 		 554 aa  461  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.883702  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0303  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.32 
 
 		 581 aa  457  1e-127  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.993767  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0952  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.23 
 
 		 563 aa  457  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.412461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2188  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.75 
 
 		 557 aa  455  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00109405  hitchhiker  0.000240143 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1761  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.09 
 
 		 557 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066805  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2523  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.16 
 
 		 557 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00313327  normal  0.944689 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0373  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.69 
 
 		 581 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.826783  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3077  AMP-dependent synthetase and ligase  41.28 
 
 		 553 aa  449  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4746  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.2 
 
 		 563 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3734  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.58 
 
 		 560 aa  449  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.862355  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  44.38 
 
 		 549 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2110  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.57 
 
 		 557 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000148173  normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1323  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.27 
 
 		 561 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2177  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.53 
 
 		 557 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000145714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2254  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.53 
 
 		 557 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00142452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2386  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.34 
 
 		 557 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  normal  0.524068 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6801  AMP-dependent synthetase and ligase  43.94 
 
 		 540 aa  445  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.867252  normal  0.1235 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2448  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.61 
 
 		 555 aa  442  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000160034  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1625  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.45 
 
 		 557 aa  442  1e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000265085  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0110  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.26 
 
 		 566 aa  442  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.963067 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2428  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.34 
 
 		 557 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268357  normal  0.181613 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1891  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.34 
 
 		 557 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0198205  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4074  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.42 
 
 		 561 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0476  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.44 
 
 		 557 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1733  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.34 
 
 		 557 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.667013  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0451  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.36 
 
 		 557 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.321292  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1898  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.34 
 
 		 557 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0400392  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1864  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.15 
 
 		 557 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00374532  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3537  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.83 
 
 		 557 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2739  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.17 
 
 		 569 aa  436  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3556  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.83 
 
 		 557 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207193  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0535  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.46 
 
 		 566 aa  437  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1106  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.83 
 
 		 557 aa  436  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.422125  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1344  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.71 
 
 		 572 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.77905 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3563  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.83 
 
 		 557 aa  435  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3148  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.01 
 
 		 560 aa  436  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2685  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.71 
 
 		 557 aa  437  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0867888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0069  AMP-dependent synthetase and ligase  43.8 
 
 		 647 aa  438  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3104  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.81 
 
 		 569 aa  434  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219632  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2581  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.34 
 
 		 557 aa  433  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1934  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.8 
 
 		 558 aa  434  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.015964  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.18 
 
 		 567 aa  435  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.58356  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0518  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.99 
 
 		 557 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2684  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.02 
 
 		 567 aa  435  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.503393 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3797  AMP-dependent synthetase and ligase  42.75 
 
 		 566 aa  434  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.589487 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0064  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.99 
 
 		 557 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1557  AMP-dependent synthetase and ligase  41.73 
 
 		 544 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0353  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase protein  42.91 
 
 		 565 aa  434  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.333466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2848  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.28 
 
 		 557 aa  434  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0546  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.99 
 
 		 557 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6272  AMP-dependent synthetase and ligase  41.73 
 
 		 544 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417798  normal  0.3516 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2857  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.99 
 
 		 569 aa  429  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  42.83 
 
 		 584 aa  431  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128568  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4543  AMP-dependent synthetase and ligase  43.33 
 
 		 562 aa  430  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3299  AMP-dependent synthetase and ligase  43.07 
 
 		 559 aa  429  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3950  AMP-dependent synthetase and ligase  43.25 
 
 		 559 aa  430  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0302713  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0144  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.17 
 
 		 566 aa  430  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>