More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4154 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3353  response regulator receiver protein  88.54 
 
 		 419 aa  729    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4154  response regulator receiver protein  100 
 
 		 419 aa  841    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.268722 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  56.66 
 
 		 416 aa  479  1e-134  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  55.71 
 
 		 444 aa  465  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1020  response regulator receiver protein  30.73 
 
 		 420 aa  182  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1683  response regulator receiver protein  29.95 
 
 		 430 aa  178  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  30.31 
 
 		 412 aa  178  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4612  response regulator receiver protein  30.07 
 
 		 417 aa  177  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.936503  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1273  response regulator receiver protein  29.75 
 
 		 430 aa  172  6.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 390 aa  168  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2701  response regulator receiver protein  30.68 
 
 		 373 aa  161  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3209  response regulator receiver protein  27.51 
 
 		 416 aa  160  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  24.79 
 
 		 392 aa  149  7e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3115  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  32.98 
 
 		 395 aa  138  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1056  response regulator receiver protein  32.28 
 
 		 373 aa  137  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3205  response regulator receiver protein  31.53 
 
 		 373 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111806 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2647  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  28.22 
 
 		 398 aa  132  7.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1834  response regulator receiver protein  29.33 
 
 		 376 aa  132  9e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002648  type II/IV secretion system ATPase TadZ/CpaE associated with Flp pilus assembly  26.55 
 
 		 402 aa  130  6e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2932  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  28.31 
 
 		 398 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  25.89 
 
 		 392 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2924  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  27.62 
 
 		 399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  27.62 
 
 		 391 aa  124  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1853  AAA ATPase  30.08 
 
 		 397 aa  124  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0455079  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0975  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.05 
 
 		 423 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0679592  normal  0.79779 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  25.47 
 
 		 406 aa  119  7e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1527  response regulator receiver protein  26.7 
 
 		 383 aa  119  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5415  putative pilus assembly protein CpaE  29.13 
 
 		 400 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.677739 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  28.88 
 
 		 400 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1110  response regulator receiver protein  28.61 
 
 		 404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129352  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2638  putative flp pilus assembly protein CpaE  31.51 
 
 		 401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  26.34 
 
 		 412 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  24.66 
 
 		 389 aa  114  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  26.67 
 
 		 377 aa  113  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2272  putative septum site-determining protein  29.19 
 
 		 537 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0796  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  26.09 
 
 		 381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.757443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4443  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.78 
 
 		 391 aa  112  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0191569 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  26.59 
 
 		 400 aa  110  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  26.72 
 
 		 389 aa  109  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0803  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  25.52 
 
 		 381 aa  106  6e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5125  response regulator receiver protein  22.95 
 
 		 587 aa  104  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  0.0818791 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1162  response regulator receiver protein  24.48 
 
 		 389 aa  102  9e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0798  response regulator receiver domain-containing protein  25.88 
 
 		 391 aa  102  9e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2362  response regulator receiver domain-containing protein  28.03 
 
 		 413 aa  100  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382482  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  24.38 
 
 		 402 aa  100  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0656  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  25.24 
 
 		 381 aa  100  6e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.165722 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  26.24 
 
 		 414 aa  99.8  9e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  24.19 
 
 		 387 aa  99.4  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  22.94 
 
 		 397 aa  97.8  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2914  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  27.92 
 
 		 377 aa  97.4  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0546  response regulator receiver protein  24.56 
 
 		 397 aa  96.7  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.881145 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  24.23 
 
 		 400 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2569  response regulator receiver protein  28.23 
 
 		 524 aa  95.1  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.220458  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1086  pilus assembly protein  25.07 
 
 		 439 aa  94  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.807258  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4359  pilus assembly protein  23.35 
 
 		 447 aa  92.8  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4249  putative pilus assembly protein  23.35 
 
 		 447 aa  92.8  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.359357 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3090  response regulator  25.96 
 
 		 402 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14190  septum site-determining protein MinD  27.21 
 
 		 265 aa  92  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000320626  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1315  flp pilus assembly protein, ATPase  25.96 
 
 		 402 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3478  septum site-determining protein MinD  27.38 
 
 		 268 aa  90.9  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144531  normal  0.63228 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2965  response regulator  24.76 
 
 		 402 aa  90.9  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.206584  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  24.63 
 
 		 397 aa  90.5  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2273  putative pilus assembly protein CpaE  26.05 
 
 		 402 aa  90.5  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.865056  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0927  septum site-determining protein MinD  27.67 
 
 		 274 aa  89.7  9e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246443  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0949  septum site-determining protein MinD  27.89 
 
 		 271 aa  89  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.790787  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3423  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  33.1 
 
 		 407 aa  89.4  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664271  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1993  septum site-determining protein MinD  27.24 
 
 		 268 aa  88.6  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.547512  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3967  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  25.24 
 
 		 382 aa  88.2  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467038 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0608  TadE-like  21.47 
 
 		 580 aa  86.7  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.288092  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1521  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  26.38 
 
 		 398 aa  86.3  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3999  response regulator receiver protein  23.27 
 
 		 422 aa  85.5  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1205  septum site-determining protein MinD  29.53 
 
 		 265 aa  86.3  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3019  septum site-determining protein MinD  28.4 
 
 		 266 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2541  hypothetical protein  26.07 
 
 		 412 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.585656  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0904  septum site-determining protein MinD  29.04 
 
 		 267 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1289  hypothetical protein  26.07 
 
 		 412 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0118  hypothetical protein  26.07 
 
 		 405 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.253404  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1769  hypothetical protein  26.07 
 
 		 405 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.694321  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1943  putative fimbriae assembly protein  26.07 
 
 		 412 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00885774  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1047  hypothetical protein  26.07 
 
 		 412 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.401729  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7196  response regulator receiver protein  23.72 
 
 		 402 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0729484  normal  0.300013 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1790  hypothetical protein  26.07 
 
 		 412 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.655567  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1777  hypothetical protein  26.07 
 
 		 412 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.28097  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2545  septum site-determining protein MinD  27.8 
 
 		 267 aa  84  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000689813  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2543  septum site-determining protein MinD  26.26 
 
 		 264 aa  84  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2348  response regulator receiver protein  23.81 
 
 		 414 aa  83.2  0.000000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5493  response regulator receiver protein  23.4 
 
 		 402 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00416697  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2739  response regulator receiver protein  23.69 
 
 		 481 aa  82  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0725  response regulator receiver protein  25.62 
 
 		 428 aa  82  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6779  response regulator receiver protein  23.4 
 
 		 402 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198539  normal  0.241213 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2370  septum site-determining protein MinD  27.45 
 
 		 260 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0304422  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6367  response regulator receiver protein  23.08 
 
 		 402 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.836702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0303  chromosome partitioning ATPase  25 
 
 		 423 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0653  putative pilus assembly protein  23.28 
 
 		 397 aa  80.1  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.868615  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4478  response regulator receiver protein  21.82 
 
 		 425 aa  79.7  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.942803 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0896  septum site-determining protein MinD  24.9 
 
 		 268 aa  79.7  0.00000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.015324  hitchhiker  0.00397046 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2558  septum site-determining protein MinD  26.95 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000169346  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1550  septum site-determining protein MinD  26 
 
 		 267 aa  79.7  0.00000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.300295  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3334  septum site-determining protein MinD  28.78 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0234044  normal  0.602718 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1534  septum site-determining protein MinD  28.24 
 
 		 264 aa  79.3  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341054  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>