More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1994 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1965  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.95 
 
 		 611 aa  657    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00683  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.14 
 
 		 588 aa  636    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2332  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  85.47 
 
 		 591 aa  1063    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.790132  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2912  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  56.14 
 
 		 588 aa  636    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.303768  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1653  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.05 
 
 		 588 aa  637    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00109405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1224  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.97 
 
 		 588 aa  643    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0959958 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0459  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.63 
 
 		 605 aa  669    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2865  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.04 
 
 		 600 aa  641    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0750  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.14 
 
 		 588 aa  636    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1994  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  100 
 
 		 592 aa  1228    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.398561  normal  0.821237 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2217  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.93 
 
 		 588 aa  637    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0736  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.14 
 
 		 588 aa  636    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0771  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.14 
 
 		 588 aa  636    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2636  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.66 
 
 		 600 aa  641    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2749  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  53.56 
 
 		 612 aa  637    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2197  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  54.64 
 
 		 590 aa  657    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.223298  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1747  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  85.47 
 
 		 591 aa  1063    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0595  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  58.33 
 
 		 589 aa  707    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0576  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  58.33 
 
 		 589 aa  707    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2704  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  79.4 
 
 		 602 aa  988    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.017234 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2007  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.37 
 
 		 590 aa  657    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.82203  normal  0.426549 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0100  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.67 
 
 		 616 aa  882    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.576611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2863  succinate dehydrogenase subunit A  68.92 
 
 		 594 aa  859    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2323  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  94.09 
 
 		 592 aa  1178    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3829  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  84.8 
 
 		 591 aa  1052    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.726427  normal  0.325233 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1184  succinate dehydrogenase subunit A  60.89 
 
 		 584 aa  733    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2800  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.8 
 
 		 607 aa  646    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01353  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.97 
 
 		 588 aa  650    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0791  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  85.47 
 
 		 591 aa  1063    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127831  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2471  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  59.49 
 
 		 587 aa  724    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.926493  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1612  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.51 
 
 		 590 aa  645    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0976  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.66 
 
 		 600 aa  641    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2150  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  84.46 
 
 		 592 aa  1056    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5838  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  84.63 
 
 		 591 aa  1053    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0088  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.83 
 
 		 600 aa  640    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.61888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1675  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.83 
 
 		 588 aa  657    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.506283  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2029  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  56.72 
 
 		 596 aa  675    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.21  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0263  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  70.05 
 
 		 616 aa  871    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0861  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  71.62 
 
 		 587 aa  860    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1204  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  58.19 
 
 		 594 aa  704    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.431605  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0662  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  85.3 
 
 		 591 aa  1063    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.536777  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2802  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  57.88 
 
 		 590 aa  665    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.35465  normal  0.79012 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0380  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.68 
 
 		 596 aa  680    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1746  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.33 
 
 		 604 aa  667    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721199  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3592  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  84.97 
 
 		 591 aa  1056    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.24 
 
 		 598 aa  656    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.62165  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0809  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  53.92 
 
 		 606 aa  642    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.76713 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1799  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  75.46 
 
 		 601 aa  951    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2108  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.36 
 
 		 590 aa  670    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.018563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0070  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  53.75 
 
 		 607 aa  636    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.563767 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3602  succinate dehydrogenase subunit A  80.07 
 
 		 598 aa  996    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2893  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  85.64 
 
 		 591 aa  1060    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0344  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.68 
 
 		 596 aa  680    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1561  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  55.65 
 
 		 587 aa  669    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1215  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.67 
 
 		 590 aa  672    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3618  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.28 
 
 		 607 aa  641    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.241397  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0109  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  70 
 
 		 616 aa  884    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.461726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2484  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  94.26 
 
 		 592 aa  1157    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.076646 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3602  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.63 
 
 		 605 aa  671    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.609874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3527  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.22 
 
 		 602 aa  646    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3032  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  57.17 
 
 		 604 aa  690    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4431  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  84.97 
 
 		 591 aa  1056    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1435  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.63 
 
 		 597 aa  639    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1797  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.29 
 
 		 589 aa  638    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000334447  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4646  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  84.63 
 
 		 591 aa  1053    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2425  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  75.08 
 
 		 601 aa  943    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0230  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.28 
 
 		 611 aa  643    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1633  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.27 
 
 		 588 aa  635    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00339414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1334  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56 
 
 		 596 aa  641    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.356881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1831  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  85.47 
 
 		 591 aa  1063    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.385612  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1061  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  82.77 
 
 		 592 aa  1051    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.760541  normal  0.0367901 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2932  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.14 
 
 		 588 aa  636    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.606648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2846  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.32 
 
 		 595 aa  650    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3313  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  84.8 
 
 		 591 aa  1052    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.775913 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44030  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.12 
 
 		 590 aa  650    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0592  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.48 
 
 		 587 aa  667    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  84.97 
 
 		 591 aa  1056    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.373287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0501  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  85.47 
 
 		 591 aa  1063    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.426579  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2168  succinate dehydrogenase subunit A  80.87 
 
 		 596 aa  1019    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.274751 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1310  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.7 
 
 		 595 aa  659    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1881  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.56 
 
 		 603 aa  669    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1708  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.27 
 
 		 588 aa  635    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0194037  normal  0.398143 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2970  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.8 
 
 		 588 aa  638    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.431118  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0569  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  53.26 
 
 		 600 aa  640    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.508772  normal  0.102225 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1425  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.22 
 
 		 588 aa  644    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00837732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2470  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  85.47 
 
 		 591 aa  1063    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328563  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6040  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.97 
 
 		 608 aa  644    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.187811 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2883  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.8 
 
 		 588 aa  638    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0212451  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2254  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.71 
 
 		 588 aa  665    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.453422  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0760  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  82.6 
 
 		 592 aa  1047    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3691  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.12 
 
 		 590 aa  650    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1152  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  57.04 
 
 		 590 aa  644    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2202  succinate dehydrogenase subunit A  77.41 
 
 		 602 aa  972    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.443729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3034  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  79.05 
 
 		 597 aa  976    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2795  succinate dehydrogenase subunit A  75.42 
 
 		 601 aa  946    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0609564 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1265  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.48 
 
 		 588 aa  650    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.648217  normal  0.132874 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1623  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  85.47 
 
 		 591 aa  1063    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.829702  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4352  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  76.64 
 
 		 601 aa  964    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.602613  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1382  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.8 
 
 		 588 aa  638    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.332477  normal  0.921061 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0044  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.52 
 
 		 596 aa  650    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>