More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1618 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1618  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1601  NUDIX hydrolase  90.77 
 
 		 195 aa  377  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0469554  normal  0.381093 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1929  NUDIX hydrolase  91.28 
 
 		 195 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.347104  normal  0.0451011 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1217  NUDIX hydrolase  85.48 
 
 		 194 aa  343  1e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0420645  normal  0.0231273 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1320  NUDIX hydrolase  83.87 
 
 		 194 aa  336  9.999999999999999e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1533  NUDIX hydrolase  73.91 
 
 		 181 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4699  NUDIX hydrolase  73.91 
 
 		 181 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.367881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1077  NUDIX hydrolase  73.91 
 
 		 181 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1557  NUDIX hydrolase  73.91 
 
 		 181 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338858  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1675  NUDIX hydrolase  71.74 
 
 		 198 aa  280  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.366016 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1479  NUDIX hydrolase  71.74 
 
 		 181 aa  279  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.277899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1458  NUDIX hydrolase  71.74 
 
 		 198 aa  279  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.644739  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1250  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  71.2 
 
 		 181 aa  276  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1981  mutT/nudix family protein  71.2 
 
 		 181 aa  276  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0391  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  71.2 
 
 		 181 aa  276  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2508  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  71.2 
 
 		 181 aa  276  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0771  nudix hydrolase  71.2 
 
 		 181 aa  276  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.176902  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1812  nudix hydrolase  71.2 
 
 		 181 aa  276  1e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1733  MutT/NUDIX NTP pyrophosphatase  71.2 
 
 		 181 aa  276  1e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1828  nudix hydrolase  71.2 
 
 		 181 aa  276  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.54633  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1733  NUDIX hydrolase  71.74 
 
 		 181 aa  275  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.361555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2504  putative ADP-ribose pyrophosphatase, NUDIX hydrolase, nudF  71.2 
 
 		 181 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.589893 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1661  NUDIX hydrolase  67.93 
 
 		 181 aa  263  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.753225  normal  0.0347123 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0744  NUDIX hydrolase  66.47 
 
 		 186 aa  245  3e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1077  NUDIX hydrolase  64.24 
 
 		 173 aa  232  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.167553 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3410  NUDIX hydrolase  64.81 
 
 		 184 aa  230  8.000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.564798  normal  0.674483 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3231  NUDIX hydrolase  59.34 
 
 		 182 aa  228  6e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1874  hypothetical protein  62.57 
 
 		 181 aa  226  1e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0897889 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1009  NUDIX hydrolase  64.81 
 
 		 183 aa  225  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.454999  normal  0.558933 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2482  NUDIX hydrolase  59.56 
 
 		 182 aa  225  3e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000632611  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1363  hypothetical protein  61.21 
 
 		 184 aa  221  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.352829  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4167  NUDIX hydrolase  62.2 
 
 		 183 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.39086 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1057  NUDIX hydrolase  62.35 
 
 		 185 aa  218  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0747  hypothetical protein  57.54 
 
 		 177 aa  218  3e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1452  NUDIX hydrolase  62.2 
 
 		 183 aa  218  5e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.396235  normal  0.240783 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2533  NUDIX hydrolase  56.74 
 
 		 179 aa  215  2.9999999999999998e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39630  NUDIX hydrolase  61.35 
 
 		 185 aa  215  4e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3595  NUDIX hydrolase  59.67 
 
 		 187 aa  214  5.9999999999999996e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00459276  normal  0.106205 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4269  NUDIX hydrolase  60.98 
 
 		 183 aa  214  8e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0630119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2472  NUDIX hydrolase  58.56 
 
 		 182 aa  212  2.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0242513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1272  NUDIX hydrolase  61.11 
 
 		 183 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1676  NUDIX hydrolase  58.89 
 
 		 182 aa  209  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.564236  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2817  NUDIX hydrolase  56.83 
 
 		 201 aa  209  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  hitchhiker  0.00000248326 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2091  NUDIX hydrolase  58.93 
 
 		 181 aa  210  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1462  mutT/nudix family protein  61.73 
 
 		 183 aa  209  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2117  NUDIX hydrolase  56.83 
 
 		 196 aa  209  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.018357 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2571  NUDIX hydrolase  57.78 
 
 		 181 aa  208  4e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.188087  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0360  MutT/nudix family protein  55.68 
 
 		 183 aa  208  5e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0848637  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2079  NUDIX hydrolase  58.33 
 
 		 182 aa  207  8e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.912784 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15850  hypothetical protein  62.42 
 
 		 184 aa  204  5e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0332954 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2017  NUDIX hydrolase  56.11 
 
 		 183 aa  200  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2641  NUDIX hydrolase  53.63 
 
 		 185 aa  198  5e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3774  NUDIX hydrolase  54.22 
 
 		 181 aa  196  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.288557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3823  NUDIX hydrolase  52.75 
 
 		 198 aa  187  5.999999999999999e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721473  normal  0.0483324 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0463  NUDIX hydrolase  48.13 
 
 		 187 aa  187  8e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.627854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0721  NUDIX hydrolase  54.19 
 
 		 157 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.267739 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1841  hypothetical protein  45.3 
 
 		 187 aa  167  1e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2127  NUDIX hydrolase  45.86 
 
 		 187 aa  167  1e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1410  NUDIX hydrolase  52.11 
 
 		 212 aa  162  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0240  NUDIX hydrolase  52.11 
 
 		 183 aa  158  5e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.930023  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1223  NUDIX hydrolase  49.35 
 
 		 182 aa  157  7e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.186298 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2404  NUDIX hydrolase  43.03 
 
 		 187 aa  148  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.387956  normal  0.764687 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2670  mutT/nudix family protein  42.42 
 
 		 187 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3237  NUDIX hydrolase  38.67 
 
 		 187 aa  140  9e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.653435  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3650  NUDIX hydrolase  39.02 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0951104 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3444  NUDIX hydrolase  40.61 
 
 		 187 aa  139  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2080  NUDIX hydrolase  39.02 
 
 		 187 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2258  NUDIX hydrolase  39.02 
 
 		 187 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2253  NUDIX hydrolase  39.02 
 
 		 187 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0537  NUDIX hydrolase  31.48 
 
 		 190 aa  88.2  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.572946  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0480  NUDIX hydrolase  33.55 
 
 		 184 aa  84.3  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.227834  hitchhiker  0.00765199 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0013  NUDIX hydrolase  38.22 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.466543  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2673  ADP-ribose pyrophosphatase  35.51 
 
 		 166 aa  72.4  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2285  NUDIX hydrolase  41.58 
 
 		 178 aa  72  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0320  NUDIX hydrolase  32.53 
 
 		 169 aa  72  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.951053 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1416  NUDIX hydrolase  34.51 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  37.93 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3323  NUDIX hydrolase  35.64 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000568303  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  35.58 
 
 		 184 aa  67  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0066  NUDIX family hydrolase  33.06 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156967  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  33.06 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  33.06 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0774  NUDIX hydrolase  38.89 
 
 		 171 aa  65.1  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 		 153 aa  64.3  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0775  NUDIX hydrolase  35.92 
 
 		 177 aa  63.9  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1735  MutT/nudix family protein  28.12 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0883  NUDIX hydrolase  27.52 
 
 		 164 aa  62.8  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2213  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.254598 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2144  NUDIX hydrolase  31.37 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0380  NUDIX hydrolase  39.56 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000301987  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1903  NUDIX hydrolase  31.45 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.772083  normal  0.185103 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  30.33 
 
 		 137 aa  60.5  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  38.64 
 
 		 163 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1315  putative phosphatase  30.61 
 
 		 176 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.174362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  30.83 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2820  NUDIX hydrolase  31.29 
 
 		 176 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.202234  normal  0.119996 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  37.17 
 
 		 144 aa  60.5  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4556  NUDIX hydrolase  29.84 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.499474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0433  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.35127  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>