More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4170 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4170  ABC transporter related  100 
 
 		 253 aa  511  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4567  ABC transporter related  90.69 
 
 		 249 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  91.09 
 
 		 249 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1571  ABC transporter related  88.66 
 
 		 249 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.98621  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1451  ABC transporter related  66.26 
 
 		 266 aa  337  7e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0342777  hitchhiker  0.000812004 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1753  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  66.94 
 
 		 266 aa  336  2.9999999999999997e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.50264  normal  0.705877 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1492  ABC transporter related  65.84 
 
 		 262 aa  334  7e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.221725  normal  0.375358 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1402  ABC transporter related  64.4 
 
 		 257 aa  330  1e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1859  ABC transporter-related protein  64.66 
 
 		 259 aa  327  8e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.200968 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0223  ABC transporter related  65.2 
 
 		 250 aa  327  9e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3166  ABC transporter related  65.71 
 
 		 249 aa  323  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.219899  normal  0.262442 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1773  putative amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  62.65 
 
 		 257 aa  314  8e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.547469  normal  0.0486237 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2931  ABC transporter-related protein  63.22 
 
 		 264 aa  314  9.999999999999999e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.409418  normal  0.382842 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1682  ABC transporter related  61.98 
 
 		 260 aa  312  2.9999999999999996e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2022  ABC transporter related  61.98 
 
 		 260 aa  312  2.9999999999999996e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0830509  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1794  ABC transporter related  62.45 
 
 		 269 aa  312  2.9999999999999996e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1840  ABC transporter related  60.98 
 
 		 266 aa  304  7e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.260615 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2388  ABC transporter related  59.35 
 
 		 259 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0199374  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2927  ABC transporter related  60.16 
 
 		 258 aa  303  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0722568  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1852  ABC transporter-related protein  61.16 
 
 		 253 aa  300  2e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2575  ABC transporter related  58.13 
 
 		 258 aa  293  1e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114621  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  58.78 
 
 		 250 aa  287  1e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3311  ABC transporter related  60 
 
 		 275 aa  279  3e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00410965  normal  0.0296755 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2815  ABC transporter related  57.2 
 
 		 250 aa  277  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454528  normal  0.076686 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.79 
 
 		 250 aa  273  2.0000000000000002e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1320  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  57.2 
 
 		 250 aa  272  4.0000000000000004e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.37 
 
 		 250 aa  271  7e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1394  ABC transporter related  53.44 
 
 		 250 aa  270  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.665987 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1605  ABC transporter related  56.79 
 
 		 256 aa  271  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0934  ABC transporter related  53.04 
 
 		 250 aa  268  7e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00957205  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1416  ABC transporter related  53.04 
 
 		 250 aa  268  7e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908871  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1899  ABC transporter related  52.05 
 
 		 250 aa  261  6e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.200717 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4560  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  51.64 
 
 		 250 aa  256  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0886359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1335  ABC transporter related  50 
 
 		 249 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0569483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1296  ABC transporter related  50 
 
 		 249 aa  254  8e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  50.2 
 
 		 252 aa  243  3e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2652  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP binding protein, putative  50.2 
 
 		 741 aa  241  9e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1826  ABC-transporter  49.8 
 
 		 758 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.256194  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1672  ABC-transporter  49.8 
 
 		 746 aa  238  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.504815  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1650  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  49.8 
 
 		 752 aa  238  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0908  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP binding protein, putative  49.4 
 
 		 761 aa  237  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1439  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  49.4 
 
 		 755 aa  237  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0721  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  49.4 
 
 		 746 aa  237  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0441  putative branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP binding protein  49.4 
 
 		 749 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.721247  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  47.76 
 
 		 250 aa  232  5e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2928  ABC transporter related  44.08 
 
 		 252 aa  219  3e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  44 
 
 		 256 aa  217  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  44 
 
 		 256 aa  217  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4075  ABC transporter related  45.64 
 
 		 268 aa  215  5e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.231771 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  47.76 
 
 		 250 aa  214  7e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  44.4 
 
 		 256 aa  214  8e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4001  ABC transporter related  45.71 
 
 		 251 aa  214  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172922  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2305  ABC transporter related protein  43.21 
 
 		 251 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1075  ABC transporter related  45.64 
 
 		 278 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00032373  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0546  ABC transporter related  46.69 
 
 		 260 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.747453 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  43.03 
 
 		 252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2314  ABC transporter related  42.45 
 
 		 249 aa  213  2.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3213  ABC transporter related  44.4 
 
 		 256 aa  211  7.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3539  ABC transporter related  44.08 
 
 		 256 aa  211  7.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.610144  normal  0.120136 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3782  ABC transporter related  43.15 
 
 		 263 aa  211  9e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3527  ABC transporter related  44.9 
 
 		 257 aa  211  9e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4607  ABC transporter related  44.03 
 
 		 251 aa  211  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  44.94 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3591  ABC transporter-related protein  44.26 
 
 		 250 aa  209  3e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3304  ABC transporter component  43.39 
 
 		 250 aa  209  4e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  44.08 
 
 		 254 aa  209  4e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3487  ABC transporter related  44.4 
 
 		 256 aa  209  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.170607  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  44.08 
 
 		 254 aa  209  4e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3344  ABC transporter ATP-binding protein  43.67 
 
 		 256 aa  208  6e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4485  ABC transporter related  46.25 
 
 		 264 aa  208  6e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1176  ABC transporter related  44.54 
 
 		 252 aa  208  7e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4208  ABC transporter related  43.27 
 
 		 246 aa  208  8e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5860  ABC transporter related  45.38 
 
 		 272 aa  207  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3736  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.44 
 
 		 251 aa  206  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1754  ABC transporter related  43.41 
 
 		 621 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2329  ABC transporter related  41.49 
 
 		 251 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.170291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1435  ABC transporter related  42.62 
 
 		 256 aa  206  4e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.446323 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5956  ABC transporter related  42.86 
 
 		 256 aa  205  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00448247  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  45.8 
 
 		 266 aa  205  6e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3049  ABC transporter related  41.15 
 
 		 263 aa  205  7e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  44.31 
 
 		 259 aa  204  9e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4701  ABC transporter related  40.49 
 
 		 840 aa  204  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676085  normal  0.601296 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2988  ABC transporter related  45.27 
 
 		 250 aa  204  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.682077  normal  0.759622 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6266  ABC transporter related  42.45 
 
 		 258 aa  203  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5164  ABC transporter related  42.32 
 
 		 256 aa  203  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1619  ABC transporter related  45.61 
 
 		 250 aa  203  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2517  ABC transporter related  41.49 
 
 		 256 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.547475  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2237  ABC transporter related  44.31 
 
 		 255 aa  202  4e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.945618  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3167  ABC transporter related  41.08 
 
 		 251 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1375  ABC transporter related  42.39 
 
 		 255 aa  202  4e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2955  ABC transporter related  41.08 
 
 		 251 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.26025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3371  ABC transporter related  41.77 
 
 		 258 aa  202  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0196  ABC transporter related  43.39 
 
 		 251 aa  202  6e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6436  ABC transporter related  41.22 
 
 		 261 aa  201  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1822  ABC transporter related  45.23 
 
 		 250 aa  201  7e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0791  ABC transporter-related protein  43.27 
 
 		 248 aa  201  8e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3915  ABC transporter related  40.74 
 
 		 259 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3331  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.08 
 
 		 259 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0006  ABC transporter related  43.37 
 
 		 255 aa  200  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.112174 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3265  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  40.74 
 
 		 259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.734875 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>