More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0452 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0452  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 304 aa  600  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4617  LysR family transcriptional regulator  53.2 
 
 		 299 aa  303  3.0000000000000004e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3958  LysR family transcriptional regulator  54.39 
 
 		 299 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.164551 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3562  LysR family transcriptional regulator  54.61 
 
 		 299 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2684  transcriptional regulator, LysR family  52.9 
 
 		 306 aa  288  7e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1977  LysR family transcriptional regulator  53.24 
 
 		 300 aa  287  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0403  LysR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 298 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.539127 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3774  transcriptional regulator, LysR family  52.22 
 
 		 300 aa  285  9e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2205  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 		 300 aa  285  9e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316824  normal  0.0546535 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4851  transcriptional regulator, LysR family  52.22 
 
 		 300 aa  285  9e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.191603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6337  LysR family transcriptional regulator  53.24 
 
 		 310 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1261  LysR family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 302 aa  282  6.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.312596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3801  carbonate dehydratase  52.56 
 
 		 302 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6037  LysR family transcriptional regulator  53.24 
 
 		 300 aa  281  8.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.941507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0217  transcriptional regulator, LysR family  52.56 
 
 		 302 aa  281  9e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4577  transcriptional regulator, LysR family  51.33 
 
 		 303 aa  280  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3051  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  50.68 
 
 		 298 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0722301  normal  0.0408613 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1934  LysR family transcriptional regulator  52.15 
 
 		 306 aa  280  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0252542 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6341  transcriptional regulator, LysR family  53.92 
 
 		 303 aa  278  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4699  transcriptional regulator, LysR family  52.35 
 
 		 302 aa  276  2e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.716933  normal  0.119558 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2943  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 297 aa  276  4e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703981  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3279  LysR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 301 aa  275  6e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215676  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3318  LysR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 303 aa  271  9e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.551959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4389  LysR family transcriptional regulator  46.44 
 
 		 314 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2875  LysR family transcriptional regulator  50.17 
 
 		 305 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3113  transcriptional regulator LysR family  48.47 
 
 		 300 aa  269  4e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498729  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3851  transcriptional regulator, LysR family  48.62 
 
 		 297 aa  269  5e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3395  transcriptional regulator, LysR family  47.96 
 
 		 294 aa  266  2e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6038  transcriptional regulator, LysR family  49.32 
 
 		 299 aa  267  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.928597  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6533  LysR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 301 aa  265  5e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3684  transcriptional regulator, LysR family  51.21 
 
 		 315 aa  262  4.999999999999999e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.167706 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2777  LysR family transcriptional regulator  50 
 
 		 289 aa  261  8.999999999999999e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1735  transcriptional regulator, LysR family  51.86 
 
 		 298 aa  260  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0563444  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2916  transcriptional regulator, LysR family  47.24 
 
 		 297 aa  259  4e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4895  LysR family transcriptional regulator  49.65 
 
 		 297 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3905  LysR family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 295 aa  258  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.443804  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3707  LysR family transcriptional regulator  45.67 
 
 		 324 aa  257  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.130798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1179  LysR family transcriptional regulator  46.92 
 
 		 303 aa  256  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6722  LysR family transcriptional regulator  47.24 
 
 		 310 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0798  LysR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 302 aa  256  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.445476 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1585  LysR family transcriptional regulator  47.24 
 
 		 310 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6246  LysR family transcriptional regulator  47.24 
 
 		 310 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332518  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0527  LysR family transcriptional regulator  48.07 
 
 		 297 aa  255  7e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0443839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42060  putative transcriptional regulator  48.12 
 
 		 304 aa  254  9e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0011  LysR family transcriptional regulator  46.8 
 
 		 322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0793  LysR family transcriptional regulator  51.1 
 
 		 300 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672309  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1142  transcriptional regulator, LysR family  46.85 
 
 		 297 aa  253  3e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.406449 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4274  transcriptional regulator, LysR family  49.48 
 
 		 297 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4539  transcriptional regulator, LysR family  47.85 
 
 		 302 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7194  transcriptional regulator, LysR family  47 
 
 		 312 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3238  LysR family transcriptional regulator  48.16 
 
 		 305 aa  251  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.722588 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2113  LysR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 300 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1134  transcriptional regulator, LysR family  50.53 
 
 		 297 aa  251  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.329644 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0574  LysR family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 301 aa  250  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8334  transcriptional regulator, LysR family  47.93 
 
 		 297 aa  250  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.671747  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3490  LysR family transcriptional regulator  48.11 
 
 		 296 aa  250  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1684  transcriptional regulator, LysR family  45.2 
 
 		 314 aa  249  4e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.444632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0839  LysR family transcriptional regulator  49.83 
 
 		 297 aa  249  4e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0678785 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6154  transcriptional regulator, LysR family  45.86 
 
 		 297 aa  249  4e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2782  LysR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 310 aa  249  5e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2471  transcriptional regulator, LysR family  45.12 
 
 		 299 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0767  transcriptional regulator, LysR family  45.48 
 
 		 300 aa  247  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4358  LysR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 324 aa  247  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0623  transcriptional regulator, LysR family  45.48 
 
 		 300 aa  247  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5912  transcriptional regulator, LysR family  44.71 
 
 		 310 aa  247  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2204  LysR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 311 aa  247  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.587301  normal  0.0241601 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1360  transcriptional regulator, LysR family  44.48 
 
 		 297 aa  246  3e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6771  transcriptional regulator, LysR family  45.08 
 
 		 301 aa  245  8e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.793683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3237  LysR family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 297 aa  244  9e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2856  LysR family transcriptional regulator  46.1 
 
 		 305 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0366  LysR family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 298 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1771  LysR family transcriptional regulator  47.9 
 
 		 297 aa  244  1.9999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1528  LysR family transcriptional regulator  44.37 
 
 		 307 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.442273  normal  0.763545 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2286  LysR family transcriptional regulator  47.72 
 
 		 297 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.963682  normal  0.493091 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8328  transcriptional regulator, LysR family  49.49 
 
 		 310 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1060  LysR family transcriptional regulator  49.14 
 
 		 311 aa  242  6e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4575  LysR family transcriptional regulator  44.22 
 
 		 322 aa  242  7e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.80821 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2010  transcriptional regulator, LysR family  46.15 
 
 		 295 aa  241  7.999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1473  transcriptional regulator, LysR family  44.29 
 
 		 295 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.714128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4718  LysR family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 291 aa  241  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.654673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3337  LysR family transcriptional regulator  46.9 
 
 		 302 aa  239  5e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.715101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1953  LysR family transcriptional regulator  46.98 
 
 		 297 aa  238  8e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.139294 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0328  LysR family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 297 aa  238  9e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.312105 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49790  transcriptional regulator  43.49 
 
 		 303 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1369  transcriptional regulator, LysR family  43.94 
 
 		 295 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3994  transcriptional regulator LysR family  47.2 
 
 		 297 aa  236  4e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5263  transcriptional regulator, LysR family  45.77 
 
 		 324 aa  235  6e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2096  LysR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 306 aa  235  7e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.785478  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0205  transcription regulator protein  45.8 
 
 		 300 aa  235  8e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.711353 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0152  transcriptional regulator  43.3 
 
 		 296 aa  234  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0631  LysR family transcriptional regulator  44.6 
 
 		 296 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5839  LysR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 305 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.482004 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3064  LysR family transcriptional regulator  44.11 
 
 		 329 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.515173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3801  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  43.45 
 
 		 297 aa  233  3e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000297403 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2811  transcriptional regulator, LysR family  42.81 
 
 		 305 aa  233  4.0000000000000004e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0947284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3612  transcriptional regulator, LysR family  44.25 
 
 		 296 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5477  LysR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 301 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5385  LysR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 301 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.253203 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35510  Regulatory protein, LysR family  44.9 
 
 		 301 aa  231  9e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4450  LysR family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 297 aa  231  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844773  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>