289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3127 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3127  putative FecR  100 
 
 		 326 aa  656    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.892412  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2904  putative FecR  42.59 
 
 		 327 aa  222  6e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0184634  normal  0.161194 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1077  putative FecR  41.12 
 
 		 331 aa  221  9e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428658  normal  0.484443 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2213  putative FecR  41.37 
 
 		 325 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2218  putative FecR  39.06 
 
 		 322 aa  219  7e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0319287  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2206  putative FecR  38.6 
 
 		 328 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.964925  normal  0.072963 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0481  putative FecR  39.82 
 
 		 327 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.133336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4834  transmembrane sensor  40.61 
 
 		 322 aa  209  6e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.895358  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55540  transmembrane sensor  40.06 
 
 		 319 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0301883 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2233  putative FecR  39.94 
 
 		 327 aa  206  5e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.761744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2103  anti-FecI sigma factor, FecR  39.76 
 
 		 326 aa  192  6e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.678011 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3197  putative FecR  40.38 
 
 		 312 aa  179  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0381932  hitchhiker  0.0038104 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2218  Fe2+-dicitrate sensor, membrane component  33.43 
 
 		 326 aa  169  9e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2050  FecR, iron siderophore sensor protein  31.19 
 
 		 329 aa  123  5e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0700  anti-FecI sigma factor, FecR  31.7 
 
 		 309 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.747207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6087  anti-FecI sigma factor, FecR  32.17 
 
 		 332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.223277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3044  FecR protein  28.43 
 
 		 318 aa  108  8.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01860  putative transmembrane sensor  30.3 
 
 		 331 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.305732  normal  0.808706 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3700  anti-FecI sigma factor, FecR  29.93 
 
 		 321 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176614  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  28.96 
 
 		 327 aa  105  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  26.77 
 
 		 311 aa  103  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0228  putative transmembrane sensor  27.49 
 
 		 331 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  29.24 
 
 		 328 aa  102  7e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2882  FecR protein  29.75 
 
 		 334 aa  101  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.35627 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0936  putative FecR  25.6 
 
 		 350 aa  101  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  28.08 
 
 		 314 aa  99.4  8e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3576  anti-FecI sigma factor, FecR  32.49 
 
 		 314 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2195  anti-FecI sigma factor, FecR  32.49 
 
 		 314 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.67028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4120  putative FecR  28.53 
 
 		 324 aa  97.4  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2244  anti-FecI sigma factor, FecR  28.7 
 
 		 333 aa  97.4  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10460  Anti-sigma factor, FecR family  28.25 
 
 		 328 aa  97.4  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.491124  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4509  putative FecR  28.8 
 
 		 338 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03880  Anti-sigma factor protein, FecR family  28.15 
 
 		 335 aa  96.7  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.936876  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1977  putative FecR  26.65 
 
 		 334 aa  96.3  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0657  FecR protein  27.33 
 
 		 337 aa  95.9  8e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4274  FecR protein  28.53 
 
 		 324 aa  95.9  8e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1969  FecR protein  26.09 
 
 		 377 aa  94.4  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.729282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3080  FecR protein  27.16 
 
 		 317 aa  94.4  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2373  putative FecR  27.88 
 
 		 329 aa  94.7  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.518516  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  27.95 
 
 		 320 aa  94.4  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1106  FecR protein  28.31 
 
 		 321 aa  94  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1119  putative FecR  32.3 
 
 		 357 aa  93.6  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.52512  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1285  regulatory protein, putative  27.62 
 
 		 301 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2338  anti-FecI sigma factor, FecR  32.49 
 
 		 314 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.633615  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1007  anti-FecI sigma factor, FecR  26.92 
 
 		 351 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.737355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  27.12 
 
 		 319 aa  91.7  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02746  putative regulatory protein  25.3 
 
 		 351 aa  91.3  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40220  Anti-sigma factor protein, FecR family  30.1 
 
 		 264 aa  91.7  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1412  anti-FecI sigma factor, FecR  25.4 
 
 		 317 aa  90.9  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1815  anti-FecI sigma factor, FecR  25.86 
 
 		 317 aa  90.1  4e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2778  anti-FecI sigma factor, FecR  26.95 
 
 		 320 aa  89.4  9e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1816  anti-FecI sigma factor, FecR  29.86 
 
 		 374 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.256693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1989  anti-FecI sigma factor, FecR  36.25 
 
 		 344 aa  89.4  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1044  anti-FecI sigma factor, FecR  26.54 
 
 		 320 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4589  anti-FecI sigma factor, FecR  26.1 
 
 		 326 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1521  putative FecR  24.11 
 
 		 336 aa  88.2  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1006  anti-FecI sigma factor, FecR  27.3 
 
 		 320 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47180  Anti-sigma factor, FecR family  32.24 
 
 		 313 aa  87.4  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.735537  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2919  putative IRON transport-sensory transduction transmembrane protein  27.18 
 
 		 274 aa  86.7  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.645522 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  26.2 
 
 		 324 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4607  anti-FecI sigma factor, FecR  29.3 
 
 		 326 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0724  FecR protein  25.95 
 
 		 330 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.533854  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4378  putative FecR  27.3 
 
 		 321 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.620498  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2736  putative FecR  26.6 
 
 		 326 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117212 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3545  anti-FecI sigma factor, FecR  27.43 
 
 		 374 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.534763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0786  putative FecR  24.42 
 
 		 383 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0948035  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2192  ECF subfamily RNA polymerase sigma factor  27.43 
 
 		 374 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2680  putative FecR  29.1 
 
 		 320 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06170  putative transmembrane sensor  30.29 
 
 		 323 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.202236  normal  0.0195078 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0850  3-compartiment signal transduction system, component PRHR transmembrane protein  31.05 
 
 		 316 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.360715  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3602  putative FecR  27.83 
 
 		 320 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.225931 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4217  anti-FecI sigma factor, FecR  27.53 
 
 		 320 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4730  FecR protein  30.57 
 
 		 327 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2581  FecR protein  28.76 
 
 		 321 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.175988  normal  0.154477 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4484  anti-FecI sigma factor, FecR  22.81 
 
 		 310 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.656085 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2427  anti-FecI sigma factor, FecR  26.3 
 
 		 324 aa  81.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4053  anti-FecI sigma factor, FecR  26.15 
 
 		 324 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2297  FecR protein  24.92 
 
 		 327 aa  80.5  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4466  anti-FecI sigma factor, FecR  28.57 
 
 		 326 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7284  two component sensor kinase  25.93 
 
 		 319 aa  80.1  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0733  anti-FecI sigma factor, FecR  24.35 
 
 		 328 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.420828 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0379  anti-FecI sigma factor, FecR  28.57 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.45013  normal  0.45289 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0445  regulatory protein, putative  29.13 
 
 		 330 aa  79.3  0.00000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.563383  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4534  putative FecR  27.09 
 
 		 316 aa  79  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.375141 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4851  anti-FecI sigma factor, FecR  28.72 
 
 		 318 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3665  anti-FecI sigma factor, FecR  26.1 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.234972 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21540  Anti-sigma factor, FecR family  31.78 
 
 		 317 aa  78.6  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20000  putative transmembrane sensor  27.33 
 
 		 328 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2780  anti-FecI sigma factor, FecR  26.44 
 
 		 320 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603267  normal  0.262675 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1150  anti-FecI sigma factor, FecR  26.87 
 
 		 322 aa  78.2  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1733  FecR protein  26.78 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.204897 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5188  putative FecR  27.24 
 
 		 323 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1205  putative transmembrane sensor  26.37 
 
 		 317 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95753  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17700  anti-sigma factor, FecR family  27.59 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1050  putative FecR  27.63 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3477  fec operon regulator FecR  28.64 
 
 		 320 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2817  putative regulatory protein  21.33 
 
 		 373 aa  76.3  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00787345  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03905  putative regulatory protein  23.36 
 
 		 368 aa  76.3  0.0000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.425706  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0377  anti-FecI sigma factor, FecR  28.21 
 
 		 318 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.435624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4090  putative transmembrane sensor  29.89 
 
 		 327 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>