More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1568 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1568  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 109 aa  215  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.630321 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2188  carboxymuconolactone decarboxylase  79.61 
 
 		 129 aa  174  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009485  BBta_0837  putative carboxymuconolactone decarboxylase  86.6 
 
 		 110 aa  173  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012791  Vapar_3680  Carboxymuconolactone decarboxylase  79.8 
 
 		 152 aa  165  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2083  Carboxymuconolactone decarboxylase  72.82 
 
 		 123 aa  160  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.995495 
 
 
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NC_010682  Rpic_2477  Carboxymuconolactone decarboxylase  75.26 
 
 		 118 aa  159  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.333736 
 
 
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NC_013457  VEA_001374  4-carboxymuconolactone decarboxylase  69 
 
 		 125 aa  157  5e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000000210016  n/a   
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_1479  carboxymuconolactone decarboxylase  73 
 
 		 133 aa  155  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009080  BMA10247_1134  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  68.93 
 
 		 132 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1373  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  68.93 
 
 		 132 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.378973  n/a   
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A1863  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  68.93 
 
 		 132 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008836  BMA10229_A0034  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  68.93 
 
 		 132 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0633482  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2209  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  70.59 
 
 		 132 aa  149  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231556  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2653  Carboxymuconolactone decarboxylase  71.57 
 
 		 138 aa  149  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009074  BURPS668_2219  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  67.96 
 
 		 132 aa  148  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007434  BURPS1710b_2385  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  67.96 
 
 		 132 aa  148  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_2257  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein  67.96 
 
 		 132 aa  148  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.769981  n/a   
 
 
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NC_003910  CPS_3139  putative 4-carboxymuconolactone decarboxylase  65 
 
 		 132 aa  148  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287088  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1817  Carboxymuconolactone decarboxylase  69.23 
 
 		 152 aa  147  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.291528 
 
 
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NC_010622  Bphy_0944  carboxymuconolactone decarboxylase  76.42 
 
 		 132 aa  147  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292875  normal  1 
 
 
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NC_008345  Sfri_3873  carboxymuconolactone decarboxylase  61.76 
 
 		 125 aa  146  9e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_004347  SO_0083  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  61.17 
 
 		 128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009997  Sbal195_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  63 
 
 		 128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007951  Bxe_A2370  putative carboxymuconolactone decarboxylase  72.16 
 
 		 148 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.006176  normal  0.29565 
 
 
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NC_011663  Sbal223_0086  Carboxymuconolactone decarboxylase  63 
 
 		 128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010506  Swoo_4049  carboxymuconolactone decarboxylase  62.75 
 
 		 134 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009052  Sbal_4266  carboxymuconolactone decarboxylase  63 
 
 		 128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008321  Shewmr4_0089  carboxymuconolactone decarboxylase  60.19 
 
 		 128 aa  144  5e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009665  Shew185_0083  carboxymuconolactone decarboxylase  62 
 
 		 128 aa  142  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007348  Reut_B5696  carboxymuconolactone decarboxylase  65 
 
 		 130 aa  140  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013422  Hneap_1703  Carboxymuconolactone decarboxylase  61.11 
 
 		 131 aa  139  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.232307  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_02340  Carboxymuconolactone decarboxylase  64 
 
 		 138 aa  137  6e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0293457  n/a   
 
 
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NC_010551  BamMC406_1753  carboxymuconolactone decarboxylase  73 
 
 		 144 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.165068 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1430  carboxymuconolactone decarboxylase  74 
 
 		 145 aa  135  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.346703  hitchhiker  0.00433375 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5144  carboxymuconolactone decarboxylase  71.03 
 
 		 144 aa  134  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0349025  normal  0.605964 
 
 
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NC_008390  Bamb_1781  carboxymuconolactone decarboxylase  72 
 
 		 144 aa  134  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_1867  carboxymuconolactone decarboxylase  73 
 
 		 144 aa  134  5e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.159406  hitchhiker  0.000781215 
 
 
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NC_008062  Bcen_6236  carboxymuconolactone decarboxylase  73 
 
 		 144 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.291446  n/a   
 
 
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NC_008542  Bcen2424_1843  carboxymuconolactone decarboxylase  73 
 
 		 144 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.19287  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_7471  Carboxymuconolactone decarboxylase  65.98 
 
 		 299 aa  130  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008786  Veis_1856  carboxymuconolactone decarboxylase  57 
 
 		 275 aa  121  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.519725  normal  0.376905 
 
 
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NC_008554  Sfum_2098  carboxymuconolactone decarboxylase  56 
 
 		 295 aa  119  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.327283  normal  0.0268513 
 
 
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NC_008726  Mvan_4934  carboxymuconolactone decarboxylase  50.46 
 
 		 150 aa  114  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249654  decreased coverage  0.00938968 
 
 
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NC_007516  Syncc9605_0521  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  53.61 
 
 		 127 aa  113  6.9999999999999995e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.66457 
 
 
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NC_014158  Tpau_4060  Carboxymuconolactone decarboxylase  49.02 
 
 		 136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.735994  n/a   
 
 
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NC_009712  Mboo_0016  carboxymuconolactone decarboxylase  61.36 
 
 		 261 aa  111  3e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011832  Mpal_2473  Carboxymuconolactone decarboxylase  53.68 
 
 		 260 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15664  normal  1 
 
 
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NC_008527  LACR_2239  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  43.75 
 
 		 122 aa  95.9  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007802  Jann_1188  carboxymuconolactone decarboxylase  49.45 
 
 		 128 aa  87.8  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.373506  normal  1 
 
 
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NC_009952  Dshi_2361  hypothetical protein  52.69 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.850012 
 
 
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NC_010524  Lcho_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  43.16 
 
 		 268 aa  83.2  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000390984 
 
 
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NC_010501  PputW619_2296  4-carboxymuconolactone decarboxylase  45.12 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0265397  normal  0.659303 
 
 
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NC_013595  Sros_7932  4-carboxymuconolactone decarboxylase  46.34 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.729855 
 
 
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NC_010002  Daci_2568  carboxymuconolactone decarboxylase  35.42 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136392 
 
 
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NC_011365  Gdia_0952  Carboxymuconolactone decarboxylase  43.88 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_02850  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  42.27 
 
 		 133 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181902 
 
 
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NC_009656  PSPA7_0318  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase  42.27 
 
 		 133 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.623335  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1275  4-carboxymuconolactone decarboxylase  40.62 
 
 		 130 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.537713  normal  1 
 
 
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NC_008392  Bamb_6219  carboxymuconolactone decarboxylase  40.38 
 
 		 363 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2504  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.76 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0768  4-carboxymuconolactone decarboxylase  35 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000904176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2396  Carboxymuconolactone decarboxylase  42.31 
 
 		 130 aa  76.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.938127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  37.23 
 
 		 373 aa  76.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1725  4-carboxymuconolactone decarboxylase, putative  37.37 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.910283  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0470  carboxymuconolactone decarboxylase  38.54 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0123066  normal  0.044727 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2322  4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.27 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.254356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3215  carboxymuconolactone decarboxylase  40.7 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2974  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.36 
 
 		 125 aa  75.1  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3780  carboxymuconolactone decarboxylase  40.21 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.971956  normal  0.723827 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1954  hypothetical protein  36.89 
 
 		 298 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_003296  RS03072  4-carboxymuconolactone decarboxylase protein  41.24 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2441  carboxymuconolactone decarboxylase  38.3 
 
 		 276 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4122  Carboxymuconolactone decarboxylase  41.05 
 
 		 107 aa  74.7  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.847034 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1011  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.3 
 
 		 402 aa  74.3  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.101506  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1021  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.5 
 
 		 132 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0594936 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5081  Carboxymuconolactone decarboxylase  39.77 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5284  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.01 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.327444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.5 
 
 		 130 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0210047  normal  0.0491818 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  35.78 
 
 		 396 aa  73.6  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4433  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.5 
 
 		 130 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145648  hitchhiker  0.00893399 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1577  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.24 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00107459  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1381  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.5 
 
 		 130 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.760953  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2342  4-carboxymuconolactone decarboxylase  40.23 
 
 		 132 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2126  carboxymuconolactone decarboxylase  40.23 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191574  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1996  carboxymuconolactone decarboxylase  36.73 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0349754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3222  Carboxymuconolactone decarboxylase  37.63 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.02067  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3648  carboxymuconolactone decarboxylase  36.08 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00963465  normal  0.158809 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2524  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  36.73 
 
 		 136 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303227  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4473  4-carboxymuconolactone decarboxylase  33.01 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2082  carboxymuconolactone decarboxylase  36.08 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.984068 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2255  carboxymuconolactone decarboxylase  38.3 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344767  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38170  4-carboxymuconolactone decarboxylase  39.18 
 
 		 130 aa  72  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.230767  n/a   
 
 
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NC_008726  Mvan_0563  4-carboxymuconolactone decarboxylase  38.46 
 
 		 393 aa  72  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  1 
 
 
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NC_009049  Rsph17029_1186  carboxymuconolactone decarboxylase  36.73 
 
 		 136 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.396733  normal  0.385259 
 
 
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NC_012850  Rleg_2469  Carboxymuconolactone decarboxylase  41.57 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.799907  normal  1 
 
 
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NC_009636  Smed_0843  carboxymuconolactone decarboxylase  34.69 
 
 		 259 aa  71.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.536951  normal  0.096524 
 
 
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NC_012917  PC1_0608  Carboxymuconolactone decarboxylase  42.05 
 
 		 99 aa  71.6  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011886  Achl_3850  4-carboxymuconolactone decarboxylase  40.66 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_0655  Carboxymuconolactone decarboxylase  40.4 
 
 		 398 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47766  normal  0.236933 
 
 
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NC_010682  Rpic_2454  4-carboxymuconolactone decarboxylase  37.5 
 
 		 132 aa  72  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.835529  normal  1 
 
 
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