116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3625 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3625  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000130147  normal  0.281396 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1769  hypothetical protein  96.3 
 
 		 248 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1472  hypothetical protein  70.9 
 
 		 261 aa  308  5e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3852  hypothetical protein  69.96 
 
 		 261 aa  301  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29385  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1862  hypothetical protein  69.96 
 
 		 249 aa  300  1e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1437  hypothetical protein  69.14 
 
 		 261 aa  297  8e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306922 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3994  hypothetical protein  66.39 
 
 		 249 aa  281  6.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2132  hypothetical protein  68.57 
 
 		 254 aa  266  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203643  normal  0.380542 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15320  hypothetical protein  55.66 
 
 		 249 aa  221  6e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2308  hypothetical protein  62.68 
 
 		 249 aa  202  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27270  hypothetical protein  62.2 
 
 		 249 aa  201  6e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2772  protein of unknown function DUF81  47.77 
 
 		 254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1781  protein of unknown function DUF81  44.81 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.166997  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04702  hypothetical protein  42.86 
 
 		 263 aa  167  1e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.1031 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5106  hypothetical protein  46.15 
 
 		 255 aa  166  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219714  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2986  hypothetical protein  45.37 
 
 		 255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.509534  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3904  protein of unknown function DUF81  40.81 
 
 		 260 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0493804  normal  0.979669 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4018  protein of unknown function DUF81  40.81 
 
 		 260 aa  160  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.006188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1285  protein of unknown function DUF81  43.9 
 
 		 286 aa  159  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3831  hypothetical protein  43.11 
 
 		 277 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2848  hypothetical protein  39.27 
 
 		 244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1137  hypothetical protein  36.32 
 
 		 250 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.307428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1940  hypothetical protein  29.46 
 
 		 269 aa  79  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  30.77 
 
 		 2798 aa  73.9  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0348  hypothetical protein  24.23 
 
 		 242 aa  61.6  0.000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.01487  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0390  protein of unknown function DUF81  29.96 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.601931  normal  0.232819 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  29.49 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1215  permease  29.52 
 
 		 123 aa  60.8  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0302  hypothetical protein  31.11 
 
 		 269 aa  58.5  0.00000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0955  hypothetical protein  30 
 
 		 272 aa  58.5  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.2411 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3910  hypothetical protein  30.47 
 
 		 277 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.562696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  28.79 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00380  predicted permease  25 
 
 		 277 aa  57  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3172  hypothetical protein  29.25 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.934574  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1048  hypothetical protein  25.1 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  27.13 
 
 		 268 aa  54.7  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  28.57 
 
 		 265 aa  54.3  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1682  hypothetical protein  22.55 
 
 		 246 aa  53.9  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2540  permease  31.25 
 
 		 123 aa  53.9  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.971306  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2525  permease  22.45 
 
 		 283 aa  53.5  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3998  hypothetical protein  25 
 
 		 268 aa  53.1  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.192524  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1504  hypothetical protein  26.8 
 
 		 255 aa  53.1  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00278101  normal  0.358981 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3045  protein of unknown function DUF81  35.51 
 
 		 302 aa  53.1  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0541  hypothetical protein  24.75 
 
 		 241 aa  52  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0617449  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  27.65 
 
 		 260 aa  52  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3446  hypothetical protein  30.43 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0555  hypothetical protein  24.75 
 
 		 241 aa  51.2  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.188548  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2883  permease  29.2 
 
 		 117 aa  50.8  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000105992  normal  0.0226836 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0357  hypothetical protein  38.75 
 
 		 121 aa  50.1  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0238  protein of unknown function DUF81  28.9 
 
 		 258 aa  50.4  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1329  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  26.52 
 
 		 259 aa  49.7  0.00004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.520044  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4028  protein of unknown function DUF81  33.67 
 
 		 285 aa  49.3  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  27.98 
 
 		 275 aa  49.3  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0425  hypothetical protein  31.68 
 
 		 121 aa  48.9  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0149  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2784  protein of unknown function DUF81  35.14 
 
 		 119 aa  48.5  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.529871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  27.03 
 
 		 270 aa  48.1  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  27.91 
 
 		 260 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3532  protein of unknown function DUF81  28.74 
 
 		 252 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0267521 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00086  hypothetical protein  25 
 
 		 266 aa  48.1  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3526  protein of unknown function DUF81  29.81 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  36.47 
 
 		 267 aa  48.1  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1448  hypothetical protein  29.52 
 
 		 248 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.342316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1259  hypothetical protein  20.28 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3594  protein of unknown function DUF81  28.57 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2539  hypothetical protein  34.94 
 
 		 124 aa  47.4  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  28.74 
 
 		 260 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1991  hypothetical protein  33.64 
 
 		 121 aa  47  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0197644  normal  0.251198 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1711  protein of unknown function DUF81  23.14 
 
 		 354 aa  47  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  24.65 
 
 		 260 aa  46.2  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1043  hypothetical protein  24.35 
 
 		 255 aa  46.6  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00403886  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  25.44 
 
 		 254 aa  46.2  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0462  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  46.6  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  23.64 
 
 		 263 aa  46.2  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1203  permease  25.11 
 
 		 257 aa  46.2  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05309  integral membrane transmembrane protein  28.57 
 
 		 273 aa  45.8  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0144  membrane protein, permease  33.02 
 
 		 120 aa  45.8  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.703678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1480  hypothetical protein  40.91 
 
 		 264 aa  45.8  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2541  protein of unknown function DUF81  27.98 
 
 		 258 aa  45.4  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  28.19 
 
 		 260 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1449  protein of unknown function DUF81  24.09 
 
 		 254 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.151812  normal  0.0760956 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1858  permease  26.21 
 
 		 253 aa  45.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000306666  hitchhiker  0.00000000438833 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1828  hypothetical protein  26.55 
 
 		 291 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal  0.571531 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  28.19 
 
 		 260 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1722  hypothetical protein  24.64 
 
 		 252 aa  45.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  23.58 
 
 		 266 aa  44.7  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0480  protein of unknown function DUF81  39.39 
 
 		 119 aa  45.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.441073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  26.17 
 
 		 268 aa  44.7  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2922  hypothetical protein  34.48 
 
 		 127 aa  44.3  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.624831 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  25.51 
 
 		 300 aa  44.3  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  26.11 
 
 		 291 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1447  hypothetical protein  25.44 
 
 		 259 aa  44.3  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115265  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  21.79 
 
 		 275 aa  44.3  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  21.79 
 
 		 275 aa  44.3  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1947  hypothetical protein  41.38 
 
 		 262 aa  43.5  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1666  hypothetical protein  26.88 
 
 		 261 aa  43.5  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000437847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2884  permease, putative  32.69 
 
 		 120 aa  43.9  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000289018  normal  0.0343889 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01140  predicted permease  34.82 
 
 		 302 aa  43.5  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  25.86 
 
 		 260 aa  43.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4316  hypothetical protein  41.18 
 
 		 264 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0821  recombinase  38.36 
 
 		 662 aa  43.1  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51455  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>