135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2924 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2924  hypothetical protein  100 
 
 		 431 aa  895    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000413391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4035  HipA-like  75.36 
 
 		 419 aa  669    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190145  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3753  HipA domain-containing protein  74.88 
 
 		 419 aa  654    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4331  HipA domain-containing protein  75.36 
 
 		 419 aa  669    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.842416  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4227  HipA domain-containing protein  74.4 
 
 		 419 aa  658    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3588  HipA domain-containing protein  48.59 
 
 		 391 aa  323  4e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252568  normal  0.492905 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1137  hypothetical protein  40.24 
 
 		 418 aa  301  1e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.185234  normal  0.0419305 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2599  HipA domain-containing protein  34.38 
 
 		 444 aa  186  9e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04069  HipA domain protein  32.3 
 
 		 424 aa  184  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4376  HipA domain-containing protein  33.67 
 
 		 429 aa  180  4.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0338797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4363  HipA domain-containing protein  32.3 
 
 		 449 aa  179  9e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0212485  normal  0.0590338 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2637  HipA domain-containing protein  31.7 
 
 		 433 aa  179  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000320909  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2229  HipA domain protein  30.73 
 
 		 429 aa  177  3e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0159  HipA domain protein  32 
 
 		 380 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0465  HipA domain-containing protein  35 
 
 		 419 aa  163  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2426  HipA-like protein  31.83 
 
 		 430 aa  159  8e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2264  HipA domain-containing protein  30.64 
 
 		 435 aa  158  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4311  HipA domain-containing protein  32.35 
 
 		 418 aa  159  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.340239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0109  HipA domain protein  30.64 
 
 		 435 aa  157  4e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0495  HipA domain-containing protein  32.09 
 
 		 411 aa  156  8e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0101  hypothetical protein  28.02 
 
 		 433 aa  155  1e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.292641  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0092  hypothetical protein  29.11 
 
 		 432 aa  155  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1467  HipA domain protein  28.92 
 
 		 433 aa  155  1e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2664  hypothetical protein  29.95 
 
 		 439 aa  150  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3781  hypothetical protein  28.43 
 
 		 430 aa  147  5e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1474  HipA domain protein  30.58 
 
 		 426 aa  146  8.000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.738708  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1315  hypothetical protein  27.25 
 
 		 434 aa  145  1e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0628  HipA domain-containing protein  28.01 
 
 		 392 aa  140  3e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000875188 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4190  hypothetical protein  34.58 
 
 		 295 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.196944 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0266  HipA domain protein  28 
 
 		 414 aa  99.8  8e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.506615  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6144  hypothetical protein  27.46 
 
 		 412 aa  99.4  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5216  HipA domain-containing protein  28.97 
 
 		 420 aa  96.7  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.939418  normal  0.517526 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9054  hypothetical protein  30.55 
 
 		 414 aa  92  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0477  HipA domain-containing protein  28.98 
 
 		 415 aa  90.1  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3690  HipA domain protein  28.37 
 
 		 414 aa  88.2  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.325167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7391  hypothetical protein  29.82 
 
 		 415 aa  87  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2057  HipA domain protein  28.86 
 
 		 421 aa  87  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5344  HipA domain-containing protein  29.27 
 
 		 415 aa  86.7  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.71584 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0620  HipA domain-containing protein  25.13 
 
 		 390 aa  84  0.000000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5437  HipA domain-containing protein  27.48 
 
 		 423 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0896  HipA domain-containing protein  28.74 
 
 		 409 aa  83.2  0.000000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1974  hypothetical protein  31.54 
 
 		 410 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0226  HipA-like protein  29.82 
 
 		 415 aa  79.3  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3717  HipA domain protein  29.75 
 
 		 435 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2868  hypothetical protein  29.39 
 
 		 430 aa  79  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2079  hypothetical protein  31.9 
 
 		 410 aa  77.4  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2039  amidophosphoribosyl transferase  28.78 
 
 		 404 aa  77.4  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03320  hypothetical protein  26.88 
 
 		 407 aa  76.3  0.0000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79257  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0237  HipA domain protein  31.87 
 
 		 415 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0522  hypothetical protein  26.72 
 
 		 408 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4338  HipA domain-containing protein  27.06 
 
 		 460 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.850917 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1056  hypothetical protein  26.69 
 
 		 405 aa  75.1  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1983  HipA domain-containing protein  26.13 
 
 		 420 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.435879  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4145  HipA-like  28.17 
 
 		 407 aa  73.2  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4200  hypothetical protein  29.86 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.250516 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2365  HipA domain-containing protein  29.39 
 
 		 411 aa  70.9  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0940993  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6228  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  27.27 
 
 		 441 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0864  HipA domain-containing protein  25.16 
 
 		 435 aa  69.3  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3279  HipA domain protein  27.36 
 
 		 420 aa  68.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153165  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2399  hypothetical protein  28.18 
 
 		 387 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1246  hypothetical protein  27.45 
 
 		 387 aa  68.2  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4918  HipA domain-containing protein  26.26 
 
 		 429 aa  67.8  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.53112 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0325  HipA domain protein  27.03 
 
 		 430 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2093  HipA domain-containing protein  28.13 
 
 		 412 aa  67  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.244247  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0949  HipA domain protein  28.09 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4942  HipA domain-containing protein  25.58 
 
 		 434 aa  65.9  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0263  HipA domain-containing protein  27.92 
 
 		 430 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0550  HipA N-terminal domain protein  26.27 
 
 		 404 aa  63.5  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04052  HipA-like protein  27.38 
 
 		 400 aa  63.2  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1566  HipA-like  24.53 
 
 		 405 aa  62.8  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4153  hypothetical protein  24.59 
 
 		 450 aa  63.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4463  HipA domain-containing protein  24.82 
 
 		 440 aa  62.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3479  HipA domain-containing protein  28.65 
 
 		 420 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282724 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3351  HipA domain-containing protein  26.67 
 
 		 420 aa  60.5  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3381  HipA domain-containing protein  26.67 
 
 		 420 aa  60.5  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.391293  hitchhiker  0.00344758 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1871  HipA domain-containing protein  26.67 
 
 		 420 aa  60.1  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.911703  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2931  hypothetical protein  27.27 
 
 		 419 aa  60.1  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.431501  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3248  HipA domain-containing protein  28.65 
 
 		 420 aa  60.1  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.980858  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2735  HipA protein  30.32 
 
 		 418 aa  59.7  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2229  hypothetical protein  24.84 
 
 		 433 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3419  HipA domain protein  26.88 
 
 		 425 aa  58.2  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0502  hypothetical protein  26.86 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4194  hypothetical protein  52.94 
 
 		 120 aa  57.4  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.323194 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4573  HipA domain-containing protein  28.05 
 
 		 418 aa  57  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2292  hypothetical protein  26.11 
 
 		 312 aa  56.6  0.0000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0672  HipA domain-containing protein  23.73 
 
 		 457 aa  56.6  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0157438  decreased coverage  0.000108623 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7006  HipA domain protein  23.41 
 
 		 440 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1557  HipA domain protein  24.56 
 
 		 435 aa  55.5  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00079  Amidophosphoribosyl transferase  24.73 
 
 		 330 aa  53.9  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0859  hypothetical protein  21.65 
 
 		 312 aa  52.8  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000274467 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01469  regulator with hipB  24.38 
 
 		 440 aa  52  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2139  HipA N-terminal domain protein  24.38 
 
 		 440 aa  52  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00420525  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01479  hypothetical protein  24.38 
 
 		 440 aa  52  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1590  protein HipA  24.38 
 
 		 440 aa  52  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.943886  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2150  HipA domain-containing protein  24.38 
 
 		 440 aa  52  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  24.02 
 
 		 434 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  26.28 
 
 		 434 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  23.62 
 
 		 434 aa  51.2  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  26.28 
 
 		 434 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0261  HipA domain protein  29.92 
 
 		 152 aa  51.6  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>