More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2564 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2564  transcriptional regulator GntR  100 
 
 		 246 aa  494  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0702  GntR family transcriptional regulator  60.7 
 
 		 240 aa  266  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2501  transcriptional regulator, GntR family  53.68 
 
 		 262 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365709  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2162  transcriptional regulator, GntR family  53.25 
 
 		 262 aa  232  5e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  54.13 
 
 		 254 aa  230  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1420  GntR family transcriptional regulator  53.6 
 
 		 236 aa  228  7e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0770  GntR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 255 aa  221  7e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0774402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0841  GntR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 247 aa  213  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2747  transcriptional regulator, GntR family  50.23 
 
 		 233 aa  207  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.756614  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3020  GntR family transcriptional regulator  50.23 
 
 		 239 aa  204  8e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1352  transcriptional regulator, GntR family  48.37 
 
 		 228 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3836  GntR family transcriptional regulator  47 
 
 		 312 aa  191  7e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.155558  normal  0.0735717 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1161  transcriptional regulator GntR  46.98 
 
 		 228 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1104  transcriptional regulator, GntR family  46.76 
 
 		 266 aa  188  7e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1375  GntR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 252 aa  175  8e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473972  normal  0.0210118 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5236  transcriptional regulator, GntR family  43.66 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 260 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 238 aa  115  7.999999999999999e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1405  GntR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 222 aa  94.4  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359865 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 234 aa  92  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5040  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 243 aa  92  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.435911  normal  0.566869 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5712  transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 		 223 aa  91.3  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.678342 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 232 aa  90.9  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 219 aa  89  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  29.31 
 
 		 239 aa  88.6  9e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3123  transcriptional regulator, GntR family  35.19 
 
 		 219 aa  88.2  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  32.6 
 
 		 244 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 265 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  32.08 
 
 		 229 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5344  transcriptional regulator, GntR family  32.34 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227261  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  32.08 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4656  transcriptional regulator, GntR family  27.72 
 
 		 237 aa  82.8  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  31.13 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  31.5 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  34.16 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1021  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.698861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0677  GntR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 254 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 235 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6449  transcriptional regulator, GntR family  34 
 
 		 236 aa  77.8  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110693  normal  0.091376 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16960  transcriptional regulator, GntR family  30.62 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.916885 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1281  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0705  transcriptional regulator, GntR family  33.19 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000407645 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2134  GntR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1964  transcriptional regulator, GntR family  30.33 
 
 		 229 aa  75.1  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.461761  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  29.15 
 
 		 214 aa  75.1  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2213  transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5932  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.733777  normal  0.0408892 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1522  transcriptional regulator, GntR family  28.93 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0498481 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5228  transcriptional regulator, GntR family  29.25 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4862  transcriptional regulator, GntR family  32.12 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.556045  normal  0.353938 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0530  GntR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.710712  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1829  GntR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1443  transcriptional regulator, GntR family  30.2 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  29.47 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  29.06 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5097  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  30.32 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3670  transcriptional regulator, GntR family  31.61 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1637  GntR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57865  normal  0.0951778 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  26.81 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1557  GntR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.76669  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0417  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 254 aa  72  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1292  GntR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284438 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 214 aa  71.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3368  transcriptional regulator, GntR family  31.66 
 
 		 227 aa  71.2  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646565  normal  0.0258143 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  29.73 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0287  GntR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 242 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0978  transcriptional regulator, GntR family  30.61 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.134109  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  29.76 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5170  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0297  transcriptional regulator, GntR family  29.63 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3127  GntR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  29.8 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0589  GntR domain protein  41.67 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4063  GntR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.299746  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  28.14 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>