158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1160 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1160  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  671    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0590  radical SAM domain-containing protein  66.25 
 
 		 317 aa  444  1.0000000000000001e-124  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1611  radical SAM family protein  63.44 
 
 		 320 aa  423  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3555  Radical SAM domain protein  58.63 
 
 		 337 aa  414  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0750  radical SAM domain-containing protein  57.99 
 
 		 319 aa  382  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1628  putative radical SAM superfamily protein  57.05 
 
 		 320 aa  372  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00346391  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2221  hypothetical protein  55.93 
 
 		 329 aa  373  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1069  radical SAM domain-containing protein  57.88 
 
 		 321 aa  369  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.872388  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1779  L-asparaginase II  57.56 
 
 		 317 aa  351  1e-95  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.251936  normal  0.0342174 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0866  L-asparaginase II  56.49 
 
 		 314 aa  350  2e-95  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07461  Fe-S oxidoreductase  53.72 
 
 		 311 aa  347  2e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.390345  normal  0.116185 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13341  Fe-S oxidoreductase  55.45 
 
 		 332 aa  346  4e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.761988 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1763  Radical SAM domain protein  52.66 
 
 		 319 aa  342  5.999999999999999e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07011  Fe-S oxidoreductases  53.53 
 
 		 314 aa  338  9e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0350076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0638  hypothetical protein  52.61 
 
 		 310 aa  335  5e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07041  Fe-S oxidoreductase  51.63 
 
 		 310 aa  334  1e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.156574  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06651  Fe-S oxidoreductase  52.61 
 
 		 310 aa  334  1e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30480  predicted protein  52.41 
 
 		 358 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0078  hypothetical protein  53.64 
 
 		 314 aa  326  3e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06941  Fe-S oxidoreductases  51.63 
 
 		 310 aa  321  9.000000000000001e-87  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.426586  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0305  radical SAM domain-containing protein  48.68 
 
 		 314 aa  302  4.0000000000000003e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0829  radical SAM domain-containing protein  48.26 
 
 		 351 aa  298  6e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0915  Radical SAM domain protein  48.99 
 
 		 351 aa  290  3e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13125  predicted protein  47.56 
 
 		 308 aa  286  5e-76  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.005765  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0073  Radical SAM domain protein  47.18 
 
 		 352 aa  281  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.127824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1988  radical SAM family protein  46.33 
 
 		 328 aa  278  7e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.252976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2228  Radical SAM domain protein  46.01 
 
 		 332 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.419306 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3799  radical SAM family protein  46.2 
 
 		 335 aa  270  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27686  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05035  hypothetical protein  44.48 
 
 		 351 aa  270  2.9999999999999997e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1591  hypothetical protein  45 
 
 		 344 aa  269  5e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0283  Radical SAM domain protein  42.6 
 
 		 364 aa  265  8e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.716398  normal  0.948397 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3861  Radical SAM domain protein  44.3 
 
 		 327 aa  265  1e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3480  radical SAM domain-containing protein  42.77 
 
 		 318 aa  261  1e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1335  Radical SAM domain protein  44.79 
 
 		 337 aa  260  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0945  hypothetical protein  44.09 
 
 		 324 aa  257  2e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1925  Radical SAM domain protein  41.88 
 
 		 338 aa  256  4e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2457  radical SAM family protein  42.68 
 
 		 318 aa  255  8e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00277932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3751  radical SAM domain-containing protein  42.43 
 
 		 337 aa  255  9e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2614  Radical SAM domain protein  42.16 
 
 		 316 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4113  Radical SAM domain protein  42.38 
 
 		 329 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00130178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4074  Radical SAM domain protein  42.38 
 
 		 329 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1566  radical SAM domain-containing protein  39.45 
 
 		 341 aa  230  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1312  radical SAM domain-containing protein  36.42 
 
 		 335 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3171  Radical SAM domain protein  36.61 
 
 		 319 aa  207  3e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1091  Radical SAM domain protein  36.27 
 
 		 319 aa  203  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1674  Radical SAM domain protein  30.77 
 
 		 326 aa  70.9  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1443  Radical SAM domain protein  30.77 
 
 		 440 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  27.61 
 
 		 380 aa  61.6  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  31.25 
 
 		 378 aa  59.7  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  30.63 
 
 		 399 aa  58.2  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  32.48 
 
 		 399 aa  57  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  24.86 
 
 		 347 aa  56.6  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  28.19 
 
 		 317 aa  55.8  0.0000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  30.77 
 
 		 480 aa  55.8  0.0000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  26.14 
 
 		 380 aa  55.1  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  29.5 
 
 		 496 aa  55.8  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  30.56 
 
 		 384 aa  55.8  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1337  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.52 
 
 		 308 aa  54.7  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3778  Radical SAM domain protein  28.78 
 
 		 429 aa  54.7  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10707  coenzyme PQQ synthesis protein E pqqE  31.21 
 
 		 391 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0763  radical SAM family protein  25.77 
 
 		 354 aa  54.3  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959991  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0414  radical SAM domain-containing protein  27.54 
 
 		 330 aa  54.3  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.910572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1519  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 422 aa  53.9  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.481264  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3206  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 412 aa  53.5  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1296  radical SAM domain-containing protein  30.5 
 
 		 395 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595995 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1565  radical SAM domain-containing protein  29.01 
 
 		 296 aa  52.8  0.000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0011  Radical SAM domain protein  25.33 
 
 		 338 aa  52  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  25.83 
 
 		 397 aa  52  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  26.9 
 
 		 358 aa  52  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  26.8 
 
 		 396 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0775  Radical SAM domain protein  27.54 
 
 		 405 aa  51.6  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1685  hypothetical protein  25.52 
 
 		 314 aa  51.2  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0732068  normal  0.0666172 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  28.92 
 
 		 415 aa  51.6  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1001  radical SAM family protein  29.5 
 
 		 401 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  28.46 
 
 		 325 aa  50.8  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1018  radical SAM domain-containing protein  29.5 
 
 		 401 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0572613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5373  Radical SAM domain protein  27.08 
 
 		 327 aa  50.8  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1028  radical SAM domain-containing protein  29.5 
 
 		 401 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  27.74 
 
 		 422 aa  50.8  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  29.17 
 
 		 399 aa  50.4  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1322  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  30.49 
 
 		 317 aa  50.4  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.331504  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  28.08 
 
 		 363 aa  50.4  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  26.83 
 
 		 377 aa  50.4  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1047  radical SAM domain-containing protein  26.77 
 
 		 468 aa  50.1  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0899  Radical SAM domain protein  25.77 
 
 		 345 aa  49.7  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.467857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1609  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  24.39 
 
 		 317 aa  49.7  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2761  radical SAM domain-containing protein  26.06 
 
 		 348 aa  49.7  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0874334  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  28.77 
 
 		 382 aa  49.7  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  28.67 
 
 		 359 aa  49.3  0.00008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5060  radical SAM domain-containing protein  27.78 
 
 		 396 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.32 
 
 		 397 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  26.71 
 
 		 346 aa  48.5  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  29.53 
 
 		 387 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  27.91 
 
 		 418 aa  49.3  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  26.76 
 
 		 389 aa  48.9  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  27.1 
 
 		 399 aa  48.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  27.33 
 
 		 561 aa  47.8  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  21.52 
 
 		 316 aa  47.8  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 391 aa  47.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  28.86 
 
 		 387 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>