289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4484 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4484  anti-FecI sigma factor, FecR  100 
 
 		 310 aa  627  1e-179  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.656085 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0734  anti-FecI sigma factor, FecR  72.58 
 
 		 310 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.721156 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0733  anti-FecI sigma factor, FecR  69.68 
 
 		 328 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.420828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0700  anti-FecI sigma factor, FecR  70.65 
 
 		 328 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3758  FecR protein  31.23 
 
 		 324 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320078 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10460  Anti-sigma factor, FecR family  28.89 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.491124  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2297  FecR protein  30.32 
 
 		 327 aa  107  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.703309 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01860  putative transmembrane sensor  29.87 
 
 		 331 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.305732  normal  0.808706 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1204  regulatory protein, putative  28.43 
 
 		 320 aa  103  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4589  anti-FecI sigma factor, FecR  28.83 
 
 		 326 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4400  putative FecR  29.49 
 
 		 350 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0568232  normal  0.23003 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4053  anti-FecI sigma factor, FecR  30.88 
 
 		 324 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0857  anti-FecI sigma factor, FecR  27.78 
 
 		 328 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.407643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2187  anti-FecI sigma factor, FecR  30.42 
 
 		 318 aa  98.2  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.779531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0758  anti-FecI sigma factor, FecR  30.72 
 
 		 315 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37420  putative transmembrane sensor protein  30.72 
 
 		 318 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5954  anti-FecI sigma factor, FecR  28.33 
 
 		 315 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0140157 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03905  putative regulatory protein  26.33 
 
 		 368 aa  97.1  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.425706  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0930  putative FecR  26.97 
 
 		 329 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0228  putative transmembrane sensor  28.08 
 
 		 331 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4466  anti-FecI sigma factor, FecR  27.41 
 
 		 326 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0700  anti-FecI sigma factor, FecR  30.66 
 
 		 309 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.747207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4509  putative FecR  28.94 
 
 		 338 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4607  anti-FecI sigma factor, FecR  27.41 
 
 		 326 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4534  putative FecR  30.07 
 
 		 316 aa  95.1  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.375141 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1439  putative FecR  26.84 
 
 		 328 aa  94  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0379  anti-FecI sigma factor, FecR  30.29 
 
 		 318 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.45013  normal  0.45289 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47390  putative transmembrane sensor  29.05 
 
 		 327 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3700  anti-FecI sigma factor, FecR  27.34 
 
 		 321 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176614  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0351  anti-FecI sigma factor, FecR  29.68 
 
 		 318 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.547847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3602  putative FecR  28.33 
 
 		 320 aa  92.8  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.225931 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2882  FecR protein  29.03 
 
 		 334 aa  92.4  8e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.35627 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0377  anti-FecI sigma factor, FecR  29.77 
 
 		 318 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.435624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2623  anti-FecI sigma factor, FecR  28.21 
 
 		 329 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.539768  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13450  putative transmembrane sensor  28.88 
 
 		 317 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.315618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3477  fec operon regulator FecR  27.19 
 
 		 320 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1006  anti-FecI sigma factor, FecR  31 
 
 		 320 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3044  FecR protein  25.86 
 
 		 318 aa  89.7  5e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39810  putative transmembrane sensor  30.32 
 
 		 316 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3125  putative FecR  29.39 
 
 		 315 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0724  FecR protein  26.76 
 
 		 330 aa  88.2  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.533854  normal  0.985224 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3785  putative FecR  27.39 
 
 		 327 aa  89  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1205  putative transmembrane sensor  27.24 
 
 		 317 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95753  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45010  Anti-sigma factor, FecR-like protein  28.57 
 
 		 311 aa  87.4  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4851  anti-FecI sigma factor, FecR  28.9 
 
 		 318 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4378  putative FecR  28.9 
 
 		 321 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.620498  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3373  putative transmembrane sensor  30.32 
 
 		 316 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.15441  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1443  putative transcriptional regulator, putative  24.92 
 
 		 320 aa  87.4  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4073  anti-FecI sigma factor, FecR  29.15 
 
 		 313 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.749827 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3562  anti-FecI sigma factor, FecR  31.31 
 
 		 323 aa  87  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.252432  normal  0.0132448 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3327  anti-FecI sigma factor, FecR  28.97 
 
 		 327 aa  86.7  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4120  putative FecR  26.54 
 
 		 324 aa  86.3  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3359  anti-FecI sigma factor, FecR  27.8 
 
 		 327 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.643029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4274  FecR protein  26.54 
 
 		 324 aa  85.9  8e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1007  anti-FecI sigma factor, FecR  30.38 
 
 		 351 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.737355  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0689  anti-FecI sigma factor, FecR  28.26 
 
 		 315 aa  85.5  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4090  putative transmembrane sensor  28.04 
 
 		 327 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47180  Anti-sigma factor, FecR family  29.02 
 
 		 313 aa  84.7  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.735537  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1339  FecR protein  26.03 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0845  anti-FecI sigma factor, FecR  30.89 
 
 		 323 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.981282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1133  anti-FecI sigma factor, FecR  28.37 
 
 		 322 aa  84.3  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3281  anti-FecI sigma factor, FecR  30.28 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.911043  normal  0.795886 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2775  anti-FecI sigma factor, FecR  29.11 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3326  anti-FecI sigma factor, FecR  30.95 
 
 		 323 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1969  FecR protein  28.33 
 
 		 377 aa  83.6  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.729282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2218  putative FecR  24.37 
 
 		 322 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0319287  normal  0.363906 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5894  anti-FecI sigma factor, FecR  28.35 
 
 		 353 aa  82  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1044  anti-FecI sigma factor, FecR  29.9 
 
 		 320 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.645854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1077  putative FecR  24.75 
 
 		 331 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428658  normal  0.484443 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4193  anti-FecI sigma factor, FecR  26.27 
 
 		 329 aa  80.9  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.980346  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4217  anti-FecI sigma factor, FecR  28.9 
 
 		 320 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3272  anti-FecI sigma factor, FecR  29.85 
 
 		 327 aa  80.1  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.104014  normal  0.0390784 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37980  putative Fe2+-dicitrate sensor, membrane component  29.67 
 
 		 317 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00265184  normal  0.0208679 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40930  Anti-sigma factor protein, FecR family  27.74 
 
 		 311 aa  80.1  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.868078  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2066  anti-FecI sigma factor, FecR  29.71 
 
 		 324 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0924  putative FecR  23.93 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0859  anti-FecI sigma factor, FecR  29.3 
 
 		 323 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2103  anti-FecI sigma factor, FecR  26.92 
 
 		 326 aa  78.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.678011 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2778  anti-FecI sigma factor, FecR  27.52 
 
 		 320 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2233  putative FecR  26.2 
 
 		 327 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.761744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02746  putative regulatory protein  25.99 
 
 		 351 aa  77.4  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5891  anti-FecI sigma factor, FecR  27.1 
 
 		 327 aa  77.4  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.914486 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3080  FecR protein  25.59 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4014  anti-FecI sigma factor, FecR  28.57 
 
 		 320 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.284425 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2736  putative FecR  27.2 
 
 		 326 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000117212 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64690  putative transmembrane sensor  31.02 
 
 		 340 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0240897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2373  putative FecR  29.05 
 
 		 329 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.518516  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1150  anti-FecI sigma factor, FecR  26.77 
 
 		 322 aa  75.9  0.0000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4612  FecR protein, putative  27.21 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2674  putative FecR  29.06 
 
 		 318 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.249504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3127  putative FecR  22.81 
 
 		 326 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.892412  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2649  anti-FecI sigma factor, FecR  25.3 
 
 		 342 aa  75.1  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2218  Fe2+-dicitrate sensor, membrane component  25.41 
 
 		 326 aa  75.5  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.108208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0654  anti-FecI sigma factor, FecR  30.65 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2050  FecR, iron siderophore sensor protein  26.95 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0996  anti-FecI sigma factor, FecR  26.78 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1977  putative FecR  25.46 
 
 		 334 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.28422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0922  anti-FecI sigma factor, FecR  25.78 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2244  anti-FecI sigma factor, FecR  26.43 
 
 		 333 aa  74.3  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.712365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5188  putative FecR  26.43 
 
 		 323 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.488195 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>