More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0202 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0202  type II secretion system protein E  100 
 
 		 199 aa  398  9.999999999999999e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.277035 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0186  type II secretion system protein E  84.85 
 
 		 360 aa  344  6e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.301874  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3167  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  56.12 
 
 		 577 aa  220  9e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.644973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0777  hypothetical protein  58.64 
 
 		 481 aa  218  3.9999999999999997e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.336131 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04882  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  55.1 
 
 		 577 aa  217  8.999999999999998e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.415694  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0163  hypothetical protein  58.42 
 
 		 461 aa  216  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.104571  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0665  hypothetical protein  55.21 
 
 		 473 aa  216  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0550  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  56.41 
 
 		 574 aa  216  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0157  hypothetical protein  58.42 
 
 		 461 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.208845 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0156  hypothetical protein  58.42 
 
 		 461 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.836049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0155  hypothetical protein  58.42 
 
 		 461 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0160  hypothetical protein  58.42 
 
 		 461 aa  216  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4447  type IV pilus biogenesis protein PilB  54.36 
 
 		 566 aa  214  5e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0626  hypothetical protein  55.96 
 
 		 473 aa  214  7e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1175  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  56.41 
 
 		 571 aa  214  9e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.323553  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0509  pilus biogenesis ATPase  55.38 
 
 		 572 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0385141 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4220  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  58.29 
 
 		 577 aa  213  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  53.85 
 
 		 568 aa  213  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2079  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  58.03 
 
 		 578 aa  213  9.999999999999999e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292786 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2034  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  55.1 
 
 		 577 aa  213  9.999999999999999e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.226289  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0805  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  55.84 
 
 		 577 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0768  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  55.84 
 
 		 577 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2370  type IV pilus assembly protein, PilB  53.81 
 
 		 571 aa  212  1.9999999999999998e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.881077  normal  0.0893992 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0651  hypothetical protein  57.89 
 
 		 461 aa  213  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.796568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0419  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  55.73 
 
 		 569 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.447977  hitchhiker  0.00974258 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0416  type IV pilus biogenesis protein PilB  55.73 
 
 		 569 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0420  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  55.73 
 
 		 569 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3605  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  55.73 
 
 		 569 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.464844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3942  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  55.73 
 
 		 570 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3680  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  55.84 
 
 		 578 aa  212  2.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3919  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  55.73 
 
 		 570 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00735332  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  52.06 
 
 		 557 aa  211  3.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4060  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  55.73 
 
 		 570 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0244852  normal  0.314215 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3867  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  55.73 
 
 		 570 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000581945 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5488  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  55.33 
 
 		 580 aa  211  4.9999999999999996e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.388204  normal  0.1076 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  51.27 
 
 		 571 aa  211  4.9999999999999996e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3423  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  55.73 
 
 		 569 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3919  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  56.35 
 
 		 555 aa  211  4.9999999999999996e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.762326  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2000  type IV pilus assembly protein PilB  54.92 
 
 		 562 aa  211  5.999999999999999e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.758865  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  53.33 
 
 		 568 aa  211  5.999999999999999e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2818  type II secretion system protein E  58.46 
 
 		 455 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.016239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0766  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  55.28 
 
 		 578 aa  211  7e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.59759  normal  0.16115 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2114  pilus biogenesis protein  54.59 
 
 		 577 aa  211  7.999999999999999e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  53.33 
 
 		 568 aa  210  9e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03469  hypothetical protein  55.21 
 
 		 561 aa  210  9e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0841  type II secretion system protein E  54.27 
 
 		 578 aa  210  9e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0657263  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0787  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  54.69 
 
 		 549 aa  210  1e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0639  type II secretion system protein E  54.36 
 
 		 571 aa  210  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2902  type II secretion system protein E  55.28 
 
 		 577 aa  210  1e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  52.82 
 
 		 571 aa  210  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  54.12 
 
 		 554 aa  210  1e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00106  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  57.89 
 
 		 461 aa  209  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3495  type II secretion system protein E  57.89 
 
 		 461 aa  209  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00105  hypothetical protein  57.89 
 
 		 461 aa  209  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0109  hypothetical protein  57.89 
 
 		 461 aa  209  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000141775  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0111  hypothetical protein  57.89 
 
 		 461 aa  209  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000253922  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0113  hypothetical protein  57.89 
 
 		 461 aa  209  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00764351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3108  type II secretion system protein E  52.45 
 
 		 573 aa  209  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.275217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3552  hypothetical protein  57.89 
 
 		 461 aa  209  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180133 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0369  type IV pilus biogenesis protein PilB  54.87 
 
 		 568 aa  209  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0217494  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002545  type 4 fimbrial assembly ATPase PilB  54.69 
 
 		 561 aa  209  3e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.255614  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  50.76 
 
 		 556 aa  209  3e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  51.03 
 
 		 557 aa  209  3e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3438  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  53.33 
 
 		 569 aa  209  3e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.141365  normal  0.083139 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2174  type II secretion system protein E  54.17 
 
 		 579 aa  209  3e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3506  type IV pilus biogenesis protein PilB  56.92 
 
 		 407 aa  208  4e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0425  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  53.33 
 
 		 569 aa  208  4e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00261577  hitchhiker  0.000552387 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0313  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  53.33 
 
 		 569 aa  208  4e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4820  type II secretion system protein E  55.73 
 
 		 566 aa  207  6e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2655  type II secretion system protein E  56.06 
 
 		 432 aa  207  6e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.488787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3783  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  53.33 
 
 		 568 aa  207  7e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.458272  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  52.79 
 
 		 563 aa  207  7e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2825  type IV pilus assembly protein  52.66 
 
 		 575 aa  207  8e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00509282  normal  0.0351792 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1072  general secretory pathway protein E  53.54 
 
 		 463 aa  207  8e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.538099  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3531  type IV pilus biogenesis protein PilB  56.57 
 
 		 407 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3452  type II secretion system protein E  56.5 
 
 		 431 aa  207  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.190294  hitchhiker  0.00352779 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2531  type II/IV secretion system protein  57 
 
 		 419 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  53.93 
 
 		 787 aa  206  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3527  type IV fimbrial biogenesis protein,PilB  57 
 
 		 419 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0755  general secretory pathway protein E  53.54 
 
 		 469 aa  206  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.179891 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4179  type II secretion system protein E  55.15 
 
 		 482 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.262241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0916  general secretory pathway protein E  54.04 
 
 		 453 aa  207  1e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.346946 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3070  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  51.21 
 
 		 575 aa  206  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0453  type II/IV secretion system protein  56.92 
 
 		 407 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0480  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  52.31 
 
 		 562 aa  206  1e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.942114  normal  0.860525 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2681  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  55.21 
 
 		 572 aa  206  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722105  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0110  hypothetical protein  57.37 
 
 		 461 aa  206  1e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157109  normal  0.596737 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1311  type II/IV secretion system protein  56.92 
 
 		 407 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1579  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  52.82 
 
 		 565 aa  206  1e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  51.52 
 
 		 515 aa  206  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3251  type II/IV secretion system protein  56.92 
 
 		 407 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  51.52 
 
 		 561 aa  206  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2184  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  55.21 
 
 		 572 aa  206  2e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.48405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0504  Type II secretory pathway ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB  56 
 
 		 431 aa  206  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.823394  normal  0.112253 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3389  type II secretion system protein E  54.17 
 
 		 569 aa  206  2e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2705  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  51.21 
 
 		 575 aa  206  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0413  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  53.33 
 
 		 568 aa  206  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5698  general secretory pathway protein E  53.03 
 
 		 453 aa  206  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0566211 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5162  type 4 fimbrial biogenesis protein PilB  53.85 
 
 		 561 aa  206  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1527  type II secretion system protein E  52.31 
 
 		 482 aa  206  2e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.155656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>