More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0606 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0606  60 kDa inner membrane insertion protein  100 
 
 		 465 aa  936    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00155315  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1353  60 kDa inner membrane insertion protein  38.7 
 
 		 443 aa  281  2e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0957559  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1333  60 kDa inner membrane insertion protein  38.7 
 
 		 443 aa  281  2e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000542942  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1631  60 kDa inner membrane insertion protein  36.69 
 
 		 433 aa  265  1e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.22695  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1038  60 kDa inner membrane insertion protein  36.61 
 
 		 448 aa  228  2e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0516206  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.12 
 
 		 575 aa  121  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2322  60 kDa inner membrane insertion protein  33.68 
 
 		 246 aa  117  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2761  60 kDa inner membrane insertion protein  36.15 
 
 		 607 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00156277  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1537  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  32.99 
 
 		 454 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000836687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0131  60 kDa inner membrane insertion protein  36.22 
 
 		 459 aa  107  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0881  60 kDa inner membrane insertion protein  24.94 
 
 		 514 aa  105  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0119  60 kDa inner membrane insertion protein  31.47 
 
 		 209 aa  102  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  28.98 
 
 		 552 aa  102  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2844  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.09 
 
 		 558 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3397  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.09 
 
 		 558 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2241  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.09 
 
 		 558 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3550  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.09 
 
 		 558 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0652  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.09 
 
 		 532 aa  100  4e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0299  60 kDa inner membrane insertion protein  31.25 
 
 		 609 aa  100  4e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3213  protein translocase subunit yidC  30.21 
 
 		 278 aa  100  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.8 
 
 		 518 aa  100  5e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3488  60 kDa inner membrane insertion protein  48 
 
 		 281 aa  100  7e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.123684  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1361  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.94 
 
 		 607 aa  100  7e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.914877  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3154  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.67 
 
 		 553 aa  100  8e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000638548 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0964  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.77 
 
 		 610 aa  99.8  9e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1023  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.77 
 
 		 610 aa  99.8  9e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23580  60 kDa inner membrane insertion protein  33.51 
 
 		 217 aa  99.8  9e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00201404  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0107  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.85 
 
 		 558 aa  99.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0304  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.85 
 
 		 558 aa  99.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0093  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.85 
 
 		 558 aa  99.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  23.99 
 
 		 517 aa  99  1e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3098  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.35 
 
 		 550 aa  99.4  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113724 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0976  60 kDa inner membrane insertion protein  31.02 
 
 		 515 aa  99  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000560326  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3235  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.62 
 
 		 557 aa  98.6  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.627922  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4201  protein translocase subunit yidC  25.48 
 
 		 547 aa  98.2  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.017626 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0578  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.43 
 
 		 600 aa  98.2  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1977  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4466  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.5 
 
 		 552 aa  98.2  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3986  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.5 
 
 		 552 aa  98.2  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3326  60 kDa inner membrane insertion protein  30.66 
 
 		 229 aa  97.8  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010032  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.47 
 
 		 560 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.2 
 
 		 553 aa  96.7  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9905  normal  0.344368 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3825  protein translocase subunit yidC  29.55 
 
 		 553 aa  96.7  8e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  29.66 
 
 		 539 aa  96.7  8e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4620  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.64 
 
 		 581 aa  96.3  9e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2549  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.51 
 
 		 552 aa  96.7  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3163  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.51 
 
 		 552 aa  96.7  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.133827  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3181  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.51 
 
 		 553 aa  96.3  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.118061 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3099  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.51 
 
 		 554 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.0227553 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3215  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.33 
 
 		 554 aa  96.3  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15042  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5612  inner membrane protein, 60 kDa  27.73 
 
 		 562 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5134  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.73 
 
 		 563 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6520  putative inner membrane protein translocase component YidC  34.04 
 
 		 555 aa  95.5  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0764  60 kDa inner membrane insertion protein  34.48 
 
 		 311 aa  95.1  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.105413  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1201  60 kDa inner membrane insertion protein  31.14 
 
 		 600 aa  94.7  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00276614 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1038  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.3 
 
 		 530 aa  94.4  4e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.493548  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0354  60 kDa inner membrane insertion protein  32.7 
 
 		 589 aa  94.4  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.265544  normal  0.0945801 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2367  protein translocase subunit yidC  50.56 
 
 		 291 aa  94.4  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000622766  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2085  60 kDa inner membrane insertion protein  25.81 
 
 		 557 aa  94.4  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.39067  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4367  60 kDa inner membrane insertion protein  37.68 
 
 		 223 aa  94.4  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.888297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0981  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.3 
 
 		 528 aa  94.4  4e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.37895  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0004  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.74 
 
 		 584 aa  94  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0662479 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0079  putative inner membrane protein translocase component YidC  32.03 
 
 		 597 aa  94  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2760  60 kDa inner membrane insertion protein  30.43 
 
 		 341 aa  93.6  6e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644122  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3895  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.02 
 
 		 567 aa  93.6  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.676329  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0448  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.14 
 
 		 544 aa  93.6  6e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3613  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.48 
 
 		 555 aa  94  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2630  YidC translocase/secretase  30.52 
 
 		 616 aa  93.6  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380149  normal  0.0394817 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3503  60 kDa inner membrane insertion protein  30.8 
 
 		 617 aa  93.2  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0094107 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0823  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.77 
 
 		 530 aa  93.2  8e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0550  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.13 
 
 		 526 aa  93.6  8e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.31 
 
 		 560 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2351  60 kDa inner membrane insertion protein  30.52 
 
 		 616 aa  93.2  9e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0911692 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3460  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.33 
 
 		 555 aa  93.2  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.03518  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.31 
 
 		 560 aa  93.2  9e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.31 
 
 		 560 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2308  60 kDa inner membrane insertion protein  31.17 
 
 		 614 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.093917 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0080  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.7 
 
 		 597 aa  92.8  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0122237  normal  0.388079 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1263  60 kDa inner membrane insertion protein  31.92 
 
 		 531 aa  92.8  1e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00209254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5299  60 kDa inner membrane insertion protein  28.45 
 
 		 565 aa  92.8  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.477817  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2149  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  31.25 
 
 		 231 aa  92.4  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0877  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.86 
 
 		 635 aa  93.2  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0924516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.31 
 
 		 560 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6369  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.73 
 
 		 578 aa  92  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0095  60 kDa inner membrane insertion protein  34.34 
 
 		 224 aa  92  2e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  27.24 
 
 		 542 aa  92  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3458  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.06 
 
 		 554 aa  92  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3757  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.06 
 
 		 554 aa  92  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1254  60 kDa inner membrane insertion protein  33.73 
 
 		 628 aa  92.4  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000727923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  33.67 
 
 		 541 aa  91.7  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3940  protein translocase subunit yidC  32 
 
 		 541 aa  92.4  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000301662  unclonable  0.0000000000640431 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0637  putative inner membrane protein translocase component YidC  48.04 
 
 		 626 aa  91.3  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73410  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.31 
 
 		 578 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.431479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1896  preprotein translocase subunit YidC  35.58 
 
 		 291 aa  91.7  3e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000421909  hitchhiker  1.20858e-25 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1393  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  25.48 
 
 		 532 aa  91.7  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0006  protein translocase subunit yidC  31.5 
 
 		 541 aa  91.3  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101193  unclonable  0.0000000000873101 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3611  60 kDa inner membrane insertion protein  29.92 
 
 		 566 aa  91.3  4e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2561  60 kDa inner membrane insertion protein  25.68 
 
 		 587 aa  90.9  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4929  60 kDa inner membrane insertion protein  30.15 
 
 		 544 aa  90.9  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000771873  unclonable  0.00000001353 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0004  inner membrane protein, 60 kDa  31.5 
 
 		 541 aa  90.5  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2930  hypothetical protein  27.92 
 
 		 556 aa  90.5  6e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>