223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3803 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3803  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 409 aa  805    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1101  putative hydrolase  68.99 
 
 		 407 aa  510  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0309641  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11990  putative hydrolase  68.86 
 
 		 407 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  27.36 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  24.84 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  26.41 
 
 		 315 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  27 
 
 		 265 aa  64.7  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  27.11 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  25.33 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54830  putative transferase  24.18 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103759  unclonable  4.60495e-22 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  27.47 
 
 		 271 aa  59.7  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1039  alpha/beta hydrolase fold protein  27.69 
 
 		 277 aa  58.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2296  alpha/beta hydrolase fold protein  21.32 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1434  alpha/beta hydrolase  27.01 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  29.25 
 
 		 397 aa  57  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4793  transferase  23.45 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4315  alpha/beta hydrolase fold  22.22 
 
 		 295 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0387901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 339 aa  55.8  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  24.36 
 
 		 371 aa  56.2  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03008  hypothetical protein  22.05 
 
 		 278 aa  55.8  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1408  alpha/beta hydrolase fold  22.22 
 
 		 295 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.598825  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5144  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  25.4 
 
 		 285 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3293  alpha/beta hydrolase fold  32.77 
 
 		 323 aa  55.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104393  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  24.43 
 
 		 267 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7140  alpha/beta hydrolase fold protein  23.74 
 
 		 425 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4403  alpha/beta hydrolase fold  22.22 
 
 		 295 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  22.76 
 
 		 297 aa  54.7  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3126  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 		 303 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  0.0127742 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4235  alpha/beta hydrolase fold  28.8 
 
 		 252 aa  54.3  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5795  poly(3-hydroxyalkanoic acid) depolymerase  25.4 
 
 		 285 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.945125  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  24.36 
 
 		 345 aa  54.3  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0502  alpha/beta hydrolase fold  27.73 
 
 		 263 aa  53.9  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0653  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 		 310 aa  53.9  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.754721  normal  0.0538261 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  23.27 
 
 		 264 aa  53.5  0.000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2364  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 		 352 aa  53.5  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0460  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  25.69 
 
 		 285 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0529  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  24.61 
 
 		 285 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  23.62 
 
 		 279 aa  53.1  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 		 271 aa  53.1  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66830  poly(3-hydroxyalkanoic acid) depolymerase  25 
 
 		 285 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  26.81 
 
 		 279 aa  52.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1781  alpha/beta hydrolase fold protein  31.09 
 
 		 260 aa  52.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0393  Poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  25.79 
 
 		 284 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208502 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1049  alpha/beta hydrolase fold  21.98 
 
 		 296 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  19.92 
 
 		 257 aa  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5507  alpha/beta hydrolase fold  22.18 
 
 		 269 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124996 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1764  alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 		 256 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112264  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3966  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  26.44 
 
 		 298 aa  52.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  25.2 
 
 		 265 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0017  alpha/beta hydrolase fold  28.81 
 
 		 327 aa  52  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0512561 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3368  alpha/beta hydrolase fold protein  31.93 
 
 		 326 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2809  alpha/beta hydrolase fold  28.12 
 
 		 271 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  24.48 
 
 		 312 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  22.03 
 
 		 257 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3368  hydrolase, alpha/beta fold family  24.76 
 
 		 254 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000257055  hitchhiker  3.4538199999999996e-20 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1334  Alpha/beta hydrolase fold  22.67 
 
 		 294 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  22.03 
 
 		 257 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  24.29 
 
 		 316 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5045  alpha/beta hydrolase fold  33.6 
 
 		 325 aa  51.2  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.6879  normal  0.399471 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0434  alpha/beta fold family hydrolase  19.1 
 
 		 279 aa  51.2  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3860  prolyl aminopeptidase  24.36 
 
 		 286 aa  51.6  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4706  normal  0.0554671 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5054  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  25.79 
 
 		 283 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  22.03 
 
 		 257 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3177  Alpha/beta hydrolase fold-1  29.41 
 
 		 272 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.97494  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2485  alpha/beta hydrolase fold  28.18 
 
 		 353 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.125677 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  25.83 
 
 		 562 aa  51.2  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3365  alpha/beta hydrolase fold  29.91 
 
 		 265 aa  50.8  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.6363  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5004  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  25.4 
 
 		 283 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  26.19 
 
 		 279 aa  50.4  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1960  hydrolase, alpha/beta fold family  24.76 
 
 		 254 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000316355  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2306  alpha/beta hydrolase fold  25.67 
 
 		 262 aa  50.4  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1990  alpha/beta hydrolase fold protein  26.24 
 
 		 308 aa  50.8  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000207277 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  24.62 
 
 		 425 aa  50.8  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1673  alpha/beta hydrolase fold protein  27.02 
 
 		 267 aa  50.4  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.114563 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 		 264 aa  50.4  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4878  poly(3-hydroxyalkanoate) depolymerase  25.4 
 
 		 305 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.636657 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1299  hypothetical protein  27.97 
 
 		 262 aa  49.7  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000570356  normal  0.587837 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2766  alpha/beta hydrolase fold protein  37.74 
 
 		 277 aa  49.7  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  23.99 
 
 		 277 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1813  alpha/beta fold family hydrolase  24.76 
 
 		 254 aa  49.7  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0124402  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1788  alpha/beta fold family hydrolase  24.76 
 
 		 254 aa  49.7  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000383201  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1770  alpha/beta fold family hydrolase  24.76 
 
 		 254 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.841886  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2328  alpha/beta hydrolase fold protein  27.94 
 
 		 270 aa  49.3  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.674989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1953  alpha/beta fold family hydrolase  24.76 
 
 		 254 aa  49.7  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00974943  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  23.99 
 
 		 277 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0429  alpha/beta fold family hydrolase  18.73 
 
 		 279 aa  49.3  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1989  hydrolase, alpha/beta fold family  24.76 
 
 		 254 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1399299999999999e-49 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2060  hydrolase, alpha/beta fold family  24.76 
 
 		 254 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000582824  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  28.81 
 
 		 309 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  23.99 
 
 		 292 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1448  Alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 		 286 aa  48.5  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  27.21 
 
 		 287 aa  48.5  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3567  alpha/beta hydrolase fold  31.2 
 
 		 328 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.253365  hitchhiker  0.00645223 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3857  hydrolase, alpha/beta fold family  20.44 
 
 		 257 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  23.75 
 
 		 275 aa  48.5  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4536  alpha/beta hydrolase fold protein  26.5 
 
 		 279 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.821334  normal  0.0123379 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1764  alpha/beta hydrolase fold protein  29.86 
 
 		 265 aa  48.5  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0171248  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  27.27 
 
 		 263 aa  48.5  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5680  alpha/beta hydrolase fold protein  38.76 
 
 		 324 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  24.37 
 
 		 265 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>