141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1670 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1670  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
138 aa  278  1e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.177973  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0148  TPR repeat-containing protein  58.82 
 
 
150 aa  164  5e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00197515  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1979  TPR repeat-containing protein  58.78 
 
 
135 aa  160  7e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.261351  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0511  TPR repeat-containing protein  54.2 
 
 
134 aa  140  7e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.476572  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1491  TPR repeat-containing protein  49.62 
 
 
134 aa  135  1e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00137744  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0505  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  50.79 
 
 
139 aa  126  8.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.6696 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1126  TPR repeat-containing protein  44.7 
 
 
134 aa  113  6.9999999999999995e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000467816  normal  0.192423 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  34.43 
 
 
539 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  34.13 
 
 
306 aa  67.4  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2365  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.38 
 
 
308 aa  67  0.00000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  35.71 
 
 
233 aa  67  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  31.71 
 
 
331 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22531  TPR repeat-containing protein  34.85 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  33.33 
 
 
334 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  31.15 
 
 
706 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 
404 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.08 
 
 
373 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  31.15 
 
 
706 aa  63.9  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0214  TPR repeat-containing protein  35.2 
 
 
308 aa  63.5  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 
280 aa  62.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  30.83 
 
 
462 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 
361 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.47 
 
 
406 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.47 
 
 
406 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  32.22 
 
 
371 aa  61.2  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  31.71 
 
 
581 aa  60.8  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  36.78 
 
 
306 aa  60.5  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  34.45 
 
 
547 aa  60.5  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  30.33 
 
 
582 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0369  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 
446 aa  58.9  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2847  TPR repeat-containing protein  33.04 
 
 
178 aa  56.2  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  28.46 
 
 
280 aa  55.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00751  hypothetical protein  31.45 
 
 
205 aa  56.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.499954 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6629  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.75 
 
 
458 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0935269 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1228  TPR repeat-containing protein  29.77 
 
 
297 aa  55.1  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3735  TPR repeat-containing protein  35.92 
 
 
707 aa  55.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.03 
 
 
542 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.61 
 
 
836 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30 
 
 
1056 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1820  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.1 
 
 
174 aa  52.4  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0341047  normal  0.900404 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2907  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.48 
 
 
471 aa  52.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 
352 aa  52.8  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3965  TPR repeat-containing protein  29.14 
 
 
425 aa  52  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2023  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 
187 aa  51.6  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.665741  normal  0.869796 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2899  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 
269 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1009  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 
273 aa  51.2  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0715627  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2530  TPR repeat-containing protein  26.27 
 
 
260 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3576  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.27 
 
 
261 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20381  hypothetical protein  32.93 
 
 
164 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.136589 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3793  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 
428 aa  50.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.085128 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4022  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 
333 aa  50.4  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.785629 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.41 
 
 
738 aa  50.8  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.63 
 
 
219 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  27.73 
 
 
605 aa  50.1  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1105  TPR repeat-containing protein  34.09 
 
 
732 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.69 
 
 
357 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2200  TPR domain-containing protein  26.09 
 
 
695 aa  48.5  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  26.87 
 
 
617 aa  48.5  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  27.64 
 
 
393 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1162  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 
205 aa  48.1  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.771224 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1891  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 
266 aa  47.8  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2529  TPR repeat-containing protein  28.68 
 
 
243 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2754  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 
295 aa  47.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  31.97 
 
 
284 aa  47.8  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.77 
 
 
286 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.01 
 
 
286 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.767116 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1964  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 
286 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.308952  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  27.56 
 
 
1421 aa  47.4  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 
391 aa  47  0.00008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2953  TPR repeat-containing protein  29.35 
 
 
270 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.162734 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1009  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 
269 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000052453  hitchhiker  0.00393725 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3982  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
305 aa  46.2  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.588459  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12541  Tfp pilus assembly protein PilF  28.21 
 
 
442 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.34619  hitchhiker  0.00140851 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0543  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.78 
 
 
248 aa  46.6  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3165  TPR repeat-containing protein  29.35 
 
 
270 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.27 
 
 
988 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0934  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.32 
 
 
189 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  27.56 
 
 
927 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3135  TPR repeat-containing protein  36.62 
 
 
731 aa  46.2  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0147  TPR repeat-containing protein  27.42 
 
 
306 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1309  TPR repeat-containing protein  28.45 
 
 
515 aa  45.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153473  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2669  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 
189 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00543716  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0693  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 
395 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0712051  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.32 
 
 
249 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17391  Tfp pilus assembly protein PilF  31.53 
 
 
270 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2695  TPR repeat-containing protein  28.46 
 
 
292 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.640048 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.5 
 
 
343 aa  45.4  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.32 
 
 
249 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1678  TPR repeat-containing protein  26.52 
 
 
240 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1997  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 
248 aa  45.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0055  TPR repeat-containing protein  34.92 
 
 
166 aa  45.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0088  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.67 
 
 
185 aa  45.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2382  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  40.32 
 
 
778 aa  45.4  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 
349 aa  45.1  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 
1049 aa  45.1  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00551  hypothetical protein  29.69 
 
 
248 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.276796  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2141  TPR repeat-containing protein  24.47 
 
 
268 aa  44.3  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00531  hypothetical protein  27.14 
 
 
250 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0233  TPR repeat-containing protein  30.84 
 
 
421 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.683027 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  25.6 
 
 
1297 aa  44.3  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>