179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1666 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1666  hypothetical protein  100 
 
 
246 aa  482  1e-135  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0625  protein of unknown function DUF218  53.66 
 
 
248 aa  229  4e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0050402  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1910  protein of unknown function DUF218  44.53 
 
 
251 aa  226  3e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0244729 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2596  hypothetical protein  52.42 
 
 
250 aa  219  3e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1732  protein of unknown function DUF218  49.38 
 
 
250 aa  217  1e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000709574  normal  0.252079 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0148  hypothetical protein  48.09 
 
 
251 aa  203  2e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.692112  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1557  hypothetical protein  43.85 
 
 
249 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12821  hypothetical protein  35.19 
 
 
236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  32.43 
 
 
262 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3520  hypothetical protein  32.56 
 
 
263 aa  112  4.0000000000000004e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  31.82 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0399  hypothetical protein  32.95 
 
 
263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30478 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0454  protein of unknown function DUF218  33.08 
 
 
265 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0441  protein of unknown function DUF218  33.08 
 
 
265 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2313  hypothetical protein  31.05 
 
 
251 aa  102  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0069  protein of unknown function DUF218  30.38 
 
 
261 aa  95.9  6e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  27.02 
 
 
242 aa  84.7  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3226  protein of unknown function DUF218  33.18 
 
 
265 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.836956 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3190  protein of unknown function DUF218  32.73 
 
 
278 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.463529  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3001  hypothetical protein  35.95 
 
 
278 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.836994  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0761  protein of unknown function DUF218  32.57 
 
 
262 aa  81.6  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1708  hypothetical protein  29.69 
 
 
280 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050766  normal  0.317979 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0964  protein of unknown function DUF218  28.51 
 
 
244 aa  80.5  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000017074  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3103  protein of unknown function DUF218  28.74 
 
 
256 aa  80.5  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591337  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2014  hypothetical protein  31.73 
 
 
235 aa  80.1  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.82136  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4460  hypothetical protein  32.13 
 
 
267 aa  79.7  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.472125  normal  0.336495 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2685  hypothetical protein  32.8 
 
 
251 aa  79.7  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0188872  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0343  hypothetical protein  30.29 
 
 
251 aa  79  0.00000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.132846  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0452  transmembrane protein  33.07 
 
 
251 aa  76.6  0.0000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0249922  normal  0.582839 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  30.77 
 
 
214 aa  76.3  0.0000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  32.29 
 
 
252 aa  75.5  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_004310  BR1177  hypothetical protein  29.48 
 
 
268 aa  73.9  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00488097  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1136  hypothetical protein  31.23 
 
 
268 aa  74.3  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000241931  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00924  conserved inner membrane protein  30.56 
 
 
259 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0692012  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2723  protein of unknown function DUF218  30.56 
 
 
259 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00143107  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00931  hypothetical protein  30.56 
 
 
259 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0659639  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2405  hypothetical protein  30.56 
 
 
259 aa  73.6  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000200717  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1080  hypothetical protein  30.56 
 
 
259 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00727998  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1027  hypothetical protein  30.56 
 
 
259 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000464041  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1017  hypothetical protein  30.56 
 
 
259 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000186844  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2676  hypothetical protein  30.56 
 
 
259 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000584627  normal  0.41839 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2201  hypothetical protein  30.56 
 
 
259 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000670511  normal  0.151519 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4276  protein of unknown function DUF218  29.14 
 
 
272 aa  72  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2047  hypothetical protein  30.99 
 
 
282 aa  72  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1775  hypothetical protein  31.91 
 
 
282 aa  70.5  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1104  hypothetical protein  30.56 
 
 
258 aa  70.1  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147337  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1055  hypothetical protein  30.56 
 
 
258 aa  70.1  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.102955 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1088  hypothetical protein  30.56 
 
 
258 aa  70.1  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213248  normal  0.252564 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4612  hypothetical protein  31.22 
 
 
262 aa  70.5  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467736  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1023  hypothetical protein  30.56 
 
 
258 aa  69.7  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.14835  normal  0.458616 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0996  hypothetical protein  30.56 
 
 
258 aa  68.9  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490044  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22350  hypothetical protein  27.1 
 
 
256 aa  68.9  0.00000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4400  hypothetical protein  24.33 
 
 
273 aa  68.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.846693  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1158  hypothetical protein  27.57 
 
 
237 aa  68.2  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00819427  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3570  protein of unknown function DUF218  32.31 
 
 
264 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0547  hypothetical protein  32 
 
 
252 aa  66.6  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.902771 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  32.57 
 
 
264 aa  66.6  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1119  hypothetical protein  27.57 
 
 
237 aa  66.6  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0242849  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1132  hypothetical protein  34.67 
 
 
259 aa  66.6  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3555  hypothetical protein  31.05 
 
 
275 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4373  protein of unknown function DUF218  27.84 
 
 
262 aa  65.9  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.845031  normal  0.225585 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2743  hypothetical protein  32.88 
 
 
281 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.519484 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2202  hypothetical protein  30.27 
 
 
259 aa  65.1  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  27.69 
 
 
264 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1322  hypothetical protein  26.07 
 
 
252 aa  63.9  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1439  hypothetical protein  30 
 
 
259 aa  63.9  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.270449  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3784  hypothetical protein  30.62 
 
 
256 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.570332 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2571  hypothetical protein  31.08 
 
 
266 aa  63.5  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2201  protein of unknown function DUF218  31.08 
 
 
264 aa  63.5  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0561041  normal  0.0364927 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4052  protein of unknown function DUF218  27.45 
 
 
262 aa  63.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1670  hypothetical protein  34.92 
 
 
255 aa  62.8  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1673  hypothetical protein  31.07 
 
 
284 aa  62  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.255885 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2290  hypothetical protein  32.56 
 
 
252 aa  61.2  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0260341  normal  0.357814 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2002  hypothetical protein  24.15 
 
 
254 aa  60.5  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  31.13 
 
 
264 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2431  hypothetical protein  28.14 
 
 
267 aa  60.8  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.53127  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2878  protein of unknown function DUF218  27.34 
 
 
260 aa  60.8  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2924  hypothetical protein  26.67 
 
 
271 aa  60.8  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.825508 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4350  hypothetical protein  30.36 
 
 
256 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.571973  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0413  hypothetical protein  28.44 
 
 
272 aa  60.1  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2303  hypothetical protein  29.51 
 
 
258 aa  60.1  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0127  protein of unknown function DUF218  27.52 
 
 
258 aa  59.3  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.703428  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  29.63 
 
 
266 aa  59.3  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2830  putative lipoprotein transmembrane  28.8 
 
 
225 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.160067  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3048  hypothetical protein  32.24 
 
 
280 aa  59.3  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.09156  normal  0.289832 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1321  hypothetical protein  25.48 
 
 
282 aa  58.9  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000340007  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2225  hypothetical protein  27.32 
 
 
254 aa  58.5  0.00000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.433325  normal  0.444103 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2287  protein of unknown function DUF218  30.98 
 
 
259 aa  58.2  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3453  hypothetical protein  29.91 
 
 
262 aa  58.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4809  hypothetical protein  30.24 
 
 
256 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0162  hypothetical protein  30.05 
 
 
247 aa  57.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12270  hypothetical protein  30.65 
 
 
253 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2494  protein of unknown function DUF218  28.43 
 
 
215 aa  56.6  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3403  hypothetical protein  31.58 
 
 
280 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6345  hypothetical protein  34.39 
 
 
273 aa  57  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.842525  hitchhiker  0.00886625 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0731  hypothetical protein  28.82 
 
 
287 aa  57  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.853147  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1739  hypothetical protein  30.43 
 
 
228 aa  57  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2554  hypothetical protein  35.92 
 
 
264 aa  56.2  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.509149  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0886  hypothetical protein  22.63 
 
 
236 aa  56.2  0.0000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.351499  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1123  hypothetical protein  30.65 
 
 
253 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>