More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0213 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0213  DNA primase  100 
 
 		 677 aa  1380    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.387013  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  34.06 
 
 		 613 aa  291  2e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  38.63 
 
 		 604 aa  282  1e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 604 aa  274  4.0000000000000004e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  30.25 
 
 		 600 aa  269  1e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1213  DNA primase  35.31 
 
 		 601 aa  268  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.140428 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  32.38 
 
 		 593 aa  268  2.9999999999999995e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  34.15 
 
 		 599 aa  266  8.999999999999999e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  35.07 
 
 		 587 aa  266  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1910  DNA primase  39.14 
 
 		 587 aa  265  2e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.351058  normal  0.0156727 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0602  DNA primase  31.84 
 
 		 636 aa  264  4e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1100  DNA primase  39.55 
 
 		 614 aa  263  6e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  35.04 
 
 		 588 aa  263  8e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  32.24 
 
 		 632 aa  258  2e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  35.08 
 
 		 664 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  38.9 
 
 		 663 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1964  DNA primase  34.64 
 
 		 632 aa  258  3e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.985881  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  40.16 
 
 		 619 aa  258  3e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  39.57 
 
 		 651 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  38.17 
 
 		 638 aa  255  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  39.62 
 
 		 655 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  33.03 
 
 		 587 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  37.3 
 
 		 599 aa  255  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  38.06 
 
 		 611 aa  255  2.0000000000000002e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  36.11 
 
 		 605 aa  255  2.0000000000000002e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  38.23 
 
 		 605 aa  255  2.0000000000000002e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  40.16 
 
 		 652 aa  254  3e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  39.95 
 
 		 663 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  31.8 
 
 		 626 aa  254  4.0000000000000004e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  33.71 
 
 		 588 aa  253  6e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  34.92 
 
 		 584 aa  253  8.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  36.43 
 
 		 613 aa  253  9.000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1699  DNA primase  38.85 
 
 		 645 aa  253  9.000000000000001e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1042  DNA primase  37.67 
 
 		 666 aa  252  1e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118792  normal  0.884554 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0288  DNA primase  38.26 
 
 		 651 aa  251  2e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.375271  normal  0.0229545 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  37.22 
 
 		 595 aa  251  2e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  31.91 
 
 		 601 aa  251  4e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  36.93 
 
 		 595 aa  250  5e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  30.09 
 
 		 598 aa  250  6e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  29.7 
 
 		 571 aa  250  6e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  30.09 
 
 		 598 aa  250  6e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  30.09 
 
 		 598 aa  250  6e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  33.18 
 
 		 583 aa  250  6e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1835  DNA primase  41.6 
 
 		 623 aa  250  6e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  30.09 
 
 		 598 aa  250  7e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0044  DNA primase  35.16 
 
 		 574 aa  250  7e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.723286  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  30.09 
 
 		 598 aa  250  7e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4297  DNA primase  32.78 
 
 		 640 aa  249  8e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.624136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  36.63 
 
 		 614 aa  249  8e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  30.09 
 
 		 598 aa  249  9e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  33.04 
 
 		 600 aa  249  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0997  DNA primase  36.47 
 
 		 601 aa  249  1e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.941593  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  32.6 
 
 		 582 aa  249  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1345  DNA primase  29.39 
 
 		 595 aa  249  2e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1073  DNA primase  35.81 
 
 		 573 aa  248  2e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.096623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1589  DNA primase  33.72 
 
 		 633 aa  248  2e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.567407  normal  0.0206676 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  33.72 
 
 		 604 aa  248  2e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  39.19 
 
 		 660 aa  248  3e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1716  DNA primase  34.13 
 
 		 626 aa  247  4e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3488  DNA primase  35.86 
 
 		 584 aa  248  4e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00314359  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  38.69 
 
 		 660 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2989  DNA primase  35.43 
 
 		 574 aa  247  4.9999999999999997e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00884135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3086  DNA primase  35.43 
 
 		 574 aa  247  4.9999999999999997e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000597352  hitchhiker  0.000480435 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  38.81 
 
 		 660 aa  247  6e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  32.59 
 
 		 598 aa  247  6e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2696  DNA primase  35.76 
 
 		 586 aa  246  6.999999999999999e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00323272  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1807  DNA primase  34.47 
 
 		 576 aa  246  8e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000348842  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  35.77 
 
 		 694 aa  246  9.999999999999999e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  35.24 
 
 		 578 aa  246  9.999999999999999e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  32.37 
 
 		 598 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1783  DNA primase  37.12 
 
 		 553 aa  246  9.999999999999999e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.461465  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  38.54 
 
 		 660 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  33.04 
 
 		 598 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1105  DNA primase  35.43 
 
 		 574 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000782839  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1286  DNA primase  35.2 
 
 		 574 aa  244  3e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0394  DNA primase  36.88 
 
 		 572 aa  244  3e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2907  DNA primase  35.2 
 
 		 574 aa  244  3e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000550507  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  34.46 
 
 		 544 aa  244  3.9999999999999997e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3686  DNA primase  33.63 
 
 		 636 aa  244  3.9999999999999997e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1417  DNA primase  39.15 
 
 		 652 aa  244  5e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04097  DNA primase  36.04 
 
 		 582 aa  244  5e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07990  DNA primase, catalytic core  35.18 
 
 		 642 aa  244  6e-63  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.160485 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0548  DNA primase  37.08 
 
 		 660 aa  243  7.999999999999999e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00859761  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0728  DNA primase  34.48 
 
 		 631 aa  242  1e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3369  DNA primase  35.33 
 
 		 584 aa  242  1e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000957959  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2458  DNA primase  36.51 
 
 		 567 aa  241  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00693823  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1175  DNA primase  33.33 
 
 		 682 aa  241  2e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00198747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0631  DNA primase  30.51 
 
 		 630 aa  242  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2833  DNA primase  35.57 
 
 		 574 aa  241  2e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0310817  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2234  DNA primase  40.87 
 
 		 621 aa  241  2.9999999999999997e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1154  DNA primase  35.59 
 
 		 575 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000263916  normal  0.0506591 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0825  DNA primase  36.62 
 
 		 655 aa  241  2.9999999999999997e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.263135  hitchhiker  0.0000451849 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0824  DNA primase  36.2 
 
 		 576 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0132507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001623  DNA primase  32.9 
 
 		 588 aa  241  4e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00199304  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0256  DNA primase  37.23 
 
 		 652 aa  240  5e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.230248  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0315  DNA primase  35.61 
 
 		 655 aa  240  6.999999999999999e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0311  DNA primase  34.1 
 
 		 583 aa  240  6.999999999999999e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.157771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  36.27 
 
 		 656 aa  239  8e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0323  DNA primase  35.32 
 
 		 579 aa  239  1e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119133 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00849  DNA primase  36.78 
 
 		 586 aa  239  1e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>