More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1021 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1021  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
273 aa  542  1e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.659885 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1020  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  62.91 
 
 
273 aa  298  7e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.812094 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.73 
 
 
289 aa  186  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.469183 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0793  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.31 
 
 
310 aa  186  5e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.190304  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0794  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.46 
 
 
310 aa  180  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.113929  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1875  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.7 
 
 
280 aa  181  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.370364  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2714  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.66 
 
 
294 aa  168  8e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.199953  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0703  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.07 
 
 
305 aa  158  9e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2115  hypothetical protein  37.36 
 
 
292 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10868  short chain dehydrogenase  39.29 
 
 
275 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00362326 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3851  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR:glucose/ribitol dehydrogenase  38.6 
 
 
277 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.277606  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2868  hypothetical protein  34.55 
 
 
301 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.596125  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3363  hypothetical protein  35.77 
 
 
301 aa  139  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.276324  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.92 
 
 
306 aa  139  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0417  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.9 
 
 
247 aa  139  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2561  hypothetical protein  33.45 
 
 
301 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.226357  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.06 
 
 
285 aa  135  6.0000000000000005e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2833  hypothetical protein  32.26 
 
 
309 aa  133  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1491  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
274 aa  132  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106015  normal  0.290492 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 
279 aa  132  9e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319463  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1846  hypothetical protein  33.45 
 
 
300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3699  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0817481  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1437  hypothetical protein  35.02 
 
 
300 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0211064 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1478  hypothetical protein  34.66 
 
 
300 aa  128  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.520899  normal  0.0228599 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2914  hypothetical protein  34.3 
 
 
301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1769  hypothetical protein  35.25 
 
 
300 aa  126  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.657278  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.44 
 
 
312 aa  126  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.169146  normal  0.55969 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.95 
 
 
312 aa  126  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.596903 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3693  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.18 
 
 
309 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5625  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.18 
 
 
309 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.285502  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.18 
 
 
309 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.396312  normal  0.215379 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00920  short-chain dehydrogenase/oxidoreductase  34.31 
 
 
295 aa  124  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2956  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.31 
 
 
295 aa  124  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5257  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1144  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.8 
 
 
307 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.151567  normal  0.117156 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.87 
 
 
309 aa  124  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6830  oxidoreductase  42.27 
 
 
265 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.356358 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1784  hypothetical protein  33.21 
 
 
305 aa  123  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.59437 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1472  short chain dehydrogenase  33.21 
 
 
315 aa  123  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.730562  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2488  hypothetical protein  31.88 
 
 
304 aa  123  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2194  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.92 
 
 
280 aa  123  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0155651  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4726  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.68 
 
 
281 aa  123  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1244  short chain dehydrogenase  36.8 
 
 
270 aa  122  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.542872  normal  0.404553 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 
271 aa  122  6e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722445  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 
278 aa  122  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0762  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.66 
 
 
280 aa  122  9e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2003  hypothetical protein  32.37 
 
 
301 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.122286  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2257  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.44 
 
 
275 aa  121  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.116431  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0404  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.2 
 
 
302 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1700  hypothetical protein  32.37 
 
 
301 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.971 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 
286 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.068211 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  37.81 
 
 
295 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3373  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 
588 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.855673  normal  0.12205 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2287  hypothetical protein  36.82 
 
 
298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3322  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 
588 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.178301 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3311  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 
588 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.768628  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4527  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.19 
 
 
311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1038  hypothetical protein  31.6 
 
 
289 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357237  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2524  short chain dehydrogenase  32.06 
 
 
308 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4313  short chain dehydrogenase  30.8 
 
 
290 aa  120  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1346  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.06 
 
 
308 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1008  short chain dehydrogenase  32.06 
 
 
308 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.388516  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0559  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.06 
 
 
308 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0827865  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1269  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.06 
 
 
308 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12242  short chain dehydrogenase  33.05 
 
 
592 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0208017  normal  0.29752 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3753  short chain dehydrogenase  39.04 
 
 
294 aa  119  6e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1538  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR:glucose/ribitol dehydrogenase  37.05 
 
 
269 aa  119  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0217494  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3360  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 
296 aa  119  6e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0880635  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.61 
 
 
273 aa  119  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 
296 aa  119  6e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 
298 aa  119  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 
285 aa  118  9e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.976299 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1745  short chain dehydrogenase  40.21 
 
 
269 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2034  short chain dehydrogenase  32.03 
 
 
290 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.304907  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1209  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
275 aa  118  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00962961  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3066  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.72 
 
 
273 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.172953  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8731  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
590 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199229  normal  0.347677 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1844  short chain dehydrogenase  41.05 
 
 
270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1790  short chain dehydrogenase  32.96 
 
 
307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000125648 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.49 
 
 
275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0241632 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21640  short chain dehydrogenase  40.53 
 
 
270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.94 
 
 
308 aa  116  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683076  hitchhiker  0.00146118 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.15 
 
 
281 aa  117  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.68 
 
 
276 aa  115  6e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0643496  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2317  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.15 
 
 
263 aa  115  6e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49068  normal  0.325129 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.68 
 
 
318 aa  115  6e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0120  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.6 
 
 
302 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1539  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.6 
 
 
302 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2673  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.71 
 
 
302 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181377  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1074  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.71 
 
 
302 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2820  dehydrogenases with different specificities  35.71 
 
 
302 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3792  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.84 
 
 
290 aa  115  7.999999999999999e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1627  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  37.7 
 
 
271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0101  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.2 
 
 
302 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1415  hypothetical protein  30.69 
 
 
300 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.51 
 
 
274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.879856  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4106  short chain dehydrogenase  39.79 
 
 
295 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.779242  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1262  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  35.2 
 
 
302 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1880  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.82 
 
 
276 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.51 
 
 
274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0106138  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4348  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.51 
 
 
274 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.201544 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>