More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4726 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4726  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 281 aa  557  1e-158  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2714  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.46 
 
 		 294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.199953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.9 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.469183 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1038  hypothetical protein  32.49 
 
 		 289 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10868  short chain dehydrogenase  31.67 
 
 		 275 aa  132  6e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362326 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1021  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.53 
 
 		 273 aa  132  6e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.659885 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2115  hypothetical protein  32.38 
 
 		 292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1478  hypothetical protein  33.33 
 
 		 300 aa  123  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.520899  normal  0.0228599 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1769  hypothetical protein  33.9 
 
 		 300 aa  122  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.657278  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1437  hypothetical protein  32.98 
 
 		 300 aa  122  8e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0211064 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1415  hypothetical protein  31.8 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0794  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.06 
 
 		 310 aa  120  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.113929  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2868  hypothetical protein  31.14 
 
 		 301 aa  120  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.596125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1875  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.05 
 
 		 280 aa  119  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.370364  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0703  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.82 
 
 		 305 aa  119  7e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.66 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2956  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.27 
 
 		 295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5257  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1934  hypothetical protein  29.17 
 
 		 300 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0777827  normal  0.376049 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1020  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.97 
 
 		 273 aa  115  7.999999999999999e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.812094 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1244  short chain dehydrogenase  33.65 
 
 		 270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.542872  normal  0.404553 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1846  hypothetical protein  29.31 
 
 		 300 aa  112  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1700  hypothetical protein  30.74 
 
 		 301 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.971 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2003  hypothetical protein  30.74 
 
 		 301 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.122286  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00920  short-chain dehydrogenase/oxidoreductase  25.27 
 
 		 295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0793  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.93 
 
 		 310 aa  110  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.190304  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1844  short chain dehydrogenase  33.49 
 
 		 270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.58 
 
 		 271 aa  110  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722445  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5364  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.68 
 
 		 267 aa  110  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.676071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2268  hypothetical protein  28.72 
 
 		 304 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.484059  normal  0.281645 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21640  short chain dehydrogenase  33.01 
 
 		 270 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3753  short chain dehydrogenase  31.25 
 
 		 294 aa  109  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0637159 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4106  short chain dehydrogenase  31.73 
 
 		 295 aa  109  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.779242  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3363  hypothetical protein  30.69 
 
 		 301 aa  109  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.276324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.55 
 
 		 286 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.068211 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1627  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  31.25 
 
 		 271 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0861444  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0115  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.99 
 
 		 278 aa  108  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2215  short chain dehydrogenase  33.66 
 
 		 276 aa  108  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1784  hypothetical protein  29.97 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.59437 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.55 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3282  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3969  short chain dehydrogenase  32.69 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3360  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.55 
 
 		 296 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0880635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.44 
 
 		 279 aa  106  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0404  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.98 
 
 		 302 aa  106  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1337  short chain dehydrogenase  31.73 
 
 		 269 aa  106  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950533 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2561  hypothetical protein  28.92 
 
 		 301 aa  106  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.226357  normal  0.190933 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44570  putative short-chain dehydrogenase  29.73 
 
 		 295 aa  105  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.30545 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1745  short chain dehydrogenase  31.73 
 
 		 269 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1295  short chain dehydrogenase  31.73 
 
 		 271 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.657463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3796  putative short-chain dehydrogenase  29.34 
 
 		 295 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.205058  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2914  hypothetical protein  29.07 
 
 		 301 aa  104  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.35 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3699  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.78 
 
 		 280 aa  105  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0817481  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2754  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.18 
 
 		 275 aa  104  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.433019  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5043  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.14 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.680577 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3851  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR:glucose/ribitol dehydrogenase  31.1 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.277606  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1791  short chain dehydrogenase  29.92 
 
 		 285 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0146977  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0101  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.5 
 
 		 302 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1539  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.5 
 
 		 302 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0120  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.5 
 
 		 302 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1262  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.5 
 
 		 302 aa  102  5e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1074  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.5 
 
 		 302 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2673  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.5 
 
 		 302 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181377  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2820  dehydrogenases with different specificities  33.5 
 
 		 302 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1810  short chain dehydrogenase  29.55 
 
 		 285 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1857  short chain dehydrogenase  29.55 
 
 		 285 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2833  hypothetical protein  30.14 
 
 		 309 aa  102  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2443  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.23 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1283  short-chain type dehydrogenase/reductase  33.66 
 
 		 277 aa  100  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.39 
 
 		 278 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5847  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.35 
 
 		 281 aa  99.4  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4091  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  27.42 
 
 		 258 aa  99  8e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.894673  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3856  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.13 
 
 		 300 aa  98.6  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.514987 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2621  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.24 
 
 		 295 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.786359 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3398  short chain dehydrogenase  31.23 
 
 		 595 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4969  short chain dehydrogenase  31.23 
 
 		 595 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.300188  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2356  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.08 
 
 		 282 aa  97.4  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0998128  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5317  short chain dehydrogenase  31.23 
 
 		 595 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.247804  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2203  short chain dehydrogenase  27.37 
 
 		 273 aa  97.8  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000419362  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4697  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.13 
 
 		 300 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.858083  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5413  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.24 
 
 		 308 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.13 
 
 		 300 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.196954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2823  short chain dehydrogenase  27.63 
 
 		 292 aa  97.1  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00207351  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5157  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.23 
 
 		 271 aa  97.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.42 
 
 		 280 aa  97.1  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.434492  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2028  acetoin reductase  31.4 
 
 		 256 aa  97.1  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0709  short chain dehydrogenase  30.53 
 
 		 595 aa  96.7  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01992  short chain dehydrogenase  25.49 
 
 		 276 aa  96.7  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000620206  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.66 
 
 		 296 aa  96.7  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3401  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.86 
 
 		 318 aa  95.9  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1258  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  29.27 
 
 		 246 aa  95.5  8e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282314 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 		 275 aa  95.1  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0498761  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.76 
 
 		 308 aa  94.7  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.683076  hitchhiker  0.00146118 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33830  short chain dehydrogenase  33.95 
 
 		 568 aa  94.7  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2287  hypothetical protein  31.85 
 
 		 298 aa  94.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3649  short chain dehydrogenase  33.66 
 
 		 595 aa  94  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3066  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.76 
 
 		 273 aa  93.6  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.172953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.9 
 
 		 259 aa  93.6  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8731  short chain dehydrogenase  31.68 
 
 		 590 aa  94  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199229  normal  0.347677 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.52 
 
 		 278 aa  93.6  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>