More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1303 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_1303  PadR-like family transcriptional regulator  100 
 
 		 156 aa  298  2e-80  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.213126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0311  PadR-like family transcriptional regulator  69.68 
 
 		 159 aa  218  3e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0247  PadR-like family transcriptional regulator  75.48 
 
 		 157 aa  210  7e-54  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.917894 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0792  PadR family transcriptional regulator  68.39 
 
 		 157 aa  207  5e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1033  transcriptional regulator, PadR-like family  31.47 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.735179  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3486  PadR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.179924 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1018  PadR-like family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 166 aa  70.9  0.000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.42575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1327  PadR-like family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00110327  decreased coverage  0.00407043 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3525  PadR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.328828  normal  0.432086 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2305  transcriptional regulator, PadR-like family  37.5 
 
 		 250 aa  64.7  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0038  PadR-like family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2736  PadR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.504798 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02940  predicted transcriptional regulator  35.42 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0630  transcriptional regulator, PadR-like family  35.42 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.870897  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0629  PadR-like family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0411  PadR-like family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3252  PadR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3365  PadR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.230818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02890  hypothetical protein  35.42 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2108  transcriptional regulator, PadR-like family  27.78 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48804 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3537  PadR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.113716  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4384  transcriptional regulator, PadR family  35.42 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.19199  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2866  transcriptional regulator, PadR-like family  34.62 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0964  transcriptional regulator, PadR-like family  38.16 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000310235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3507  transcriptional regulator, PadR family  36.67 
 
 		 207 aa  62  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4033  transcriptional regulator, PadR-like family  34.09 
 
 		 255 aa  62  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.878781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1087  PadR-like family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.7443 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00550  predicted transcriptional regulator  34.15 
 
 		 271 aa  61.6  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.100515 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1371  PadR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.114848 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1408  transcriptional regulator, PadR-like family  44.74 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.364205  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1147  PadR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 240 aa  61.2  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4874  PadR-like family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 189 aa  60.8  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3199  transcriptional regulator, PadR-like family  37.97 
 
 		 277 aa  60.8  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2223  PadR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 372 aa  60.5  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0957891  hitchhiker  0.0000188934 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0565  PadR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0868  PadR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 131 aa  60.5  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.343891 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1207  transcriptional regulator, PadR-like family  32.03 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4307  PadR-like family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3031  transcriptional regulator, PadR-like family  42.86 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0982  PadR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1748  transcriptional regulator, PadR-like family  31.86 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000246986  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4205  transcriptional regulator PadR-like  32.43 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5903  transcriptional regulator, PadR-like family  38.03 
 
 		 316 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33122  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2503  PadR-like family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3585  transcriptional regulator, PadR-like family  32.63 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.785047  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2053  transcriptional regulator, PadR-like family  34.88 
 
 		 180 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000846941 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1309  PadR-like family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.123604 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2852  transcriptional regulator, PadR-like family  33.91 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.118488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0626  PadR-like family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0651  PadR-like family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.991167  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03708  hypothetical protein  41.18 
 
 		 218 aa  57.8  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.473027  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2278  PadR-like family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 203 aa  57.8  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0846058  normal  0.116293 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0164  PadR-like family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 200 aa  57.8  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.924623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3245  transcriptional regulator, PadR-like family  34.12 
 
 		 206 aa  57.4  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0525  PadR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 176 aa  57  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520723  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3835  transcriptional regulator, PadR-like family  39.44 
 
 		 263 aa  57  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0380451  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3227  PadR-like family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 195 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.381918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1577  PadR-like family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 210 aa  57  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.63756 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1415  PadR-like family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 209 aa  57  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2175  transcriptional regulator, PadR-like family  37.5 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000935551  normal  0.0245277 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3967  PadR-like family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3509  PadR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000686547 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1462  transcriptional regulator, PadR-like family  34.69 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3405  transcriptional regulator, PadR family  37.5 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0778  transcriptional regulator, PadR-like family  34.02 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3571  PadR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.333448 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2928  transcriptional regulator, PadR-like family  31.96 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.425588  hitchhiker  0.00045831 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3475  PadR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.108637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3401  transcriptional regulator, PadR family  37.5 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.827661  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0796  transcriptional regulator, PadR-like family  38.16 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3876  PadR family transcriptional regulator  36 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.483976  normal  0.0238497 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1237  transcriptional regulator, PadR-like family  38.46 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0180596 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0961  PadR-like family transcriptional regulator  36 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3476  transcriptional regulator, PadR-like family  46.55 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0905  PadR family transcriptional regulator  36 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.760063  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4067  transcriptional regulator, PadR-like family  44.12 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.690798 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3954  transcriptional regulator, PadR-like family  44.12 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.564811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8234  transcriptional regulator, PadR-like family  32.65 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3121  transcriptional regulator, PadR-like family  38.37 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6747  transcriptional regulator protein-like protein  31.71 
 
 		 250 aa  55.1  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0953  PadR-like family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000151261  hitchhiker  0.000286609 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1695  transcriptional regulator, PadR-like family  36.67 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000619842 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3441  PadR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.690369  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1530  PadR-like family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.210269 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0529  PadR-like family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 215 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.85519  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5885  transcriptional regulator, PadR-like family  34.25 
 
 		 334 aa  54.7  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1242  PadR-like family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 218 aa  54.3  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000724616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5462  PadR-like family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 249 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802601 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1993  transcriptional regulator, PadR-like family  39.56 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.765293  normal  0.399206 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2396  transcriptional regulator, PadR-like family  30.93 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.109028  normal  0.171865 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3281  PadR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 109 aa  53.9  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5307  PadR-like family transcriptional regulator  40 
 
 		 250 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4741  transcriptional regulator, PadR-like family  36.71 
 
 		 116 aa  53.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0619  PadR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 305 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.224139  normal  0.712803 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2059  PadR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2833  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5149  transcriptional regulator, PadR-like family  39.74 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0918525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4612  PadR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 234 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3130  PadR-like family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 237 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5239  PadR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>