More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1017 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_1017  PP-loop domain-containing protein  100 
 
 		 330 aa  679    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000000238836 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1454  PP-loop domain-containing protein  82.97 
 
 		 329 aa  569  1e-161  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1511  PP-loop domain-containing protein  81.06 
 
 		 332 aa  555  1e-157  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1647  PP-loop domain-containing protein  78.88 
 
 		 327 aa  550  1e-155  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1255  PP-loop domain-containing protein  54.49 
 
 		 337 aa  386  1e-106  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000242334 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0923  PP-loop domain-containing protein  36.45 
 
 		 328 aa  187  2e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.345442  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2672  hypothetical protein  37.3 
 
 		 302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.850687  normal  0.464248 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0105  PP-loop domain-containing protein  35.48 
 
 		 304 aa  181  2e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000276493 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0991  hypothetical protein  36.77 
 
 		 302 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.250333  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0970  hypothetical protein  36.86 
 
 		 300 aa  171  1e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.13433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0575  PP-loop domain-containing protein  35.83 
 
 		 326 aa  171  1e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2121  PP-loop domain-containing protein  37.04 
 
 		 315 aa  166  4e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.222745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1938  PP-loop domain-containing protein  32.6 
 
 		 315 aa  159  5e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0666  PP-loop domain-containing protein  30.25 
 
 		 308 aa  159  6e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0169  PP-loop domain-containing protein  30.25 
 
 		 308 aa  159  6e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.140995  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0222  PP-loop domain-containing protein  32.92 
 
 		 311 aa  157  3e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0601  PP-loop domain-containing protein  32.8 
 
 		 311 aa  157  3e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160635  normal  0.847232 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1652  PP-loop domain protein  31.83 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.323786  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1317  PP-loop domain-containing protein  33.12 
 
 		 311 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04150  mitochondrion protein, putative  32.32 
 
 		 363 aa  153  4e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.830155  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1144  PP-loop domain protein  30.07 
 
 		 308 aa  151  2e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0483  PP-loop domain-containing protein  35.49 
 
 		 343 aa  150  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.790075  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0795  PP-loop domain-containing protein  28.53 
 
 		 311 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0388011  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0977  PP-loop domain protein  31.6 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.695229  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2212  hypothetical protein  31.1 
 
 		 309 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.731581 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1217  PP-loop domain protein  30.94 
 
 		 304 aa  139  7e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.987774  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0514  PP-loop domain protein  30.61 
 
 		 326 aa  137  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.000618346  normal  0.660635 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00450  PP-loop ATPase superfamily protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04710)  32.26 
 
 		 422 aa  137  4e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.413873 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2822  PP-loop domain protein  29.97 
 
 		 319 aa  136  6.0000000000000005e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0175  PP-loop domain protein  30.86 
 
 		 332 aa  127  3e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39100  conserved protein of the N-type ATP pyrophosphatase superfamily  28.86 
 
 		 376 aa  127  3e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1506  PP-loop domain protein  31.63 
 
 		 304 aa  126  5e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1159  PP-loop domain-containing protein  29.97 
 
 		 300 aa  123  5e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00548011  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1487  PP-loop domain-containing protein  31.23 
 
 		 318 aa  122  7e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0195  PP-loop domain protein  27.83 
 
 		 301 aa  122  8e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1006  PP-loop domain-containing protein  29.39 
 
 		 323 aa  122  9.999999999999999e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000342283  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0727  PP-loop domain-containing protein  29.35 
 
 		 304 aa  119  7e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000064129  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0751  PP-loop domain-containing protein  29.58 
 
 		 304 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000031572  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2405  PP-loop domain protein  27.52 
 
 		 321 aa  116  6e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1159  PP-loop domain-containing protein  28.32 
 
 		 297 aa  114  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557797  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1672  PP-loop domain protein  26.84 
 
 		 318 aa  113  6e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1268  PP-loop domain-containing protein  28.39 
 
 		 323 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2018  PP-loop domain-containing protein  29.79 
 
 		 290 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000229346 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1006  PP-loop domain-containing protein  26.13 
 
 		 287 aa  109  5e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.192569  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1780  PP-loop domain-containing protein  29.68 
 
 		 297 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0206487  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0414  PP-loop domain protein  28.28 
 
 		 313 aa  105  9e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0017  PP-loop domain-containing protein  27.56 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.128893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0170  PP-loop domain protein  28.16 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0768  PP-loop domain protein  25.08 
 
 		 288 aa  100  4e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.923286  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3611  hypothetical protein  31.09 
 
 		 302 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1363  PP-loop domain protein  27.07 
 
 		 299 aa  98.6  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000000207966  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0716  PP-loop domain-containing protein  26.96 
 
 		 310 aa  94.7  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2277  PP-loop domain protein  28.3 
 
 		 303 aa  92.8  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0127  C32 tRNA thiolase  30.2 
 
 		 282 aa  90.9  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2330  PP-loop domain protein  26.54 
 
 		 311 aa  86.7  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0233  PP-loop domain protein  26.39 
 
 		 269 aa  86.7  6e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1482  PP-loop domain protein  26.77 
 
 		 312 aa  82.8  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1321  PP-loop domain-containing protein  28.15 
 
 		 252 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.32014  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0799  PP-loop domain protein  26.32 
 
 		 247 aa  82.4  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1247  ExsB family protein  27.85 
 
 		 244 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.400272  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1059  PP-loop family protein  27.85 
 
 		 244 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0711  C32 tRNA thiolase  30.24 
 
 		 252 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0128348  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0671  C32 tRNA thiolase  27.02 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.51504e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1810  PP-loop domain-containing protein  27.54 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000000657331  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2830  PP-loop domain-containing protein  26.69 
 
 		 303 aa  79.3  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.669837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0882  PP-loop domain-containing protein  27.43 
 
 		 307 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.175206  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0949  C32 tRNA thiolase  27.92 
 
 		 303 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.744331 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3336  C32 tRNA thiolase  29.39 
 
 		 264 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0903  C32 tRNA thiolase  28.27 
 
 		 290 aa  76.6  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3000  C32 tRNA thiolase  25.9 
 
 		 331 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3479  C32 tRNA thiolase  28.46 
 
 		 258 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.101099  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0952  PP-loop domain protein  27.85 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2366  C32 tRNA thiolase  25.9 
 
 		 326 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.53458  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2980  C32 tRNA thiolase  25.9 
 
 		 331 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0615  C32 tRNA thiolase  28.05 
 
 		 255 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0687614  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0629  PP-loop domain protein  28.05 
 
 		 255 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4975000000000002e-35 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0321  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  28.72 
 
 		 682 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.124455 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0954  PP-loop domain protein  27.85 
 
 		 291 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3499  C32 tRNA thiolase  29.15 
 
 		 269 aa  75.9  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00810912  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2599  PP-loop domain protein  25.43 
 
 		 235 aa  75.5  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000526821  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1896  C32 tRNA thiolase  29.2 
 
 		 289 aa  74.3  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.318261 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1271  C32 tRNA thiolase  26.72 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.051738  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6329  C32 tRNA thiolase  26.72 
 
 		 331 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2544  PP-loop domain protein  27 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.203919  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2974  PP-loop family protein  27.71 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0928  PP-loop family protein  27.73 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2975  C32 tRNA thiolase  27.13 
 
 		 331 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10299  predicted protein  26.09 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.127345  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1130  PP-loop domain protein  26.89 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2259  PP-loop domain-containing protein  27.59 
 
 		 242 aa  72.8  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000140384  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2075  PP-loop domain protein  26.59 
 
 		 280 aa  72.8  0.000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3405  PP-loop domain protein  27.97 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0206  C32 tRNA thiolase  27.53 
 
 		 336 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2415  C32 tRNA thiolase  26.89 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.170221  decreased coverage  0.000000170238 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1407  PP-loop family protein  26.89 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2367  PP-loop domain protein  24.14 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0635  PP-loop domain protein  27.08 
 
 		 276 aa  72.4  0.000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000208948  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0527  PP-loop domain protein  29.96 
 
 		 250 aa  72.4  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0554  C32 tRNA thiolase  26.16 
 
 		 313 aa  72  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.637065 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2890  C32 tRNA thiolase  26.72 
 
 		 340 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.735906  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>