More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3441 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3441  ABC transporter related  100 
 
 		 330 aa  675    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0257  ABC transporter related  40.51 
 
 		 316 aa  196  4.0000000000000005e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.784545  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0555  ABC transporter related  41.77 
 
 		 303 aa  187  2e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0413767  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2162  ABC transporter related  37.41 
 
 		 327 aa  179  4.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.526088  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02380  2-aminoethylphosphonate transport  37.67 
 
 		 304 aa  176  5e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.174206  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1358  ABC transporter related  35.17 
 
 		 365 aa  174  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0799  ABC transporter related protein  33.11 
 
 		 353 aa  170  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.46134 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2416  multiple sugar-binding ABC transporter, ATP-binding protein  37.39 
 
 		 346 aa  169  5e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.860941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0913  ABC transporter related  38.52 
 
 		 361 aa  169  5e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl511  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding component  30.98 
 
 		 350 aa  168  1e-40  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  33.33 
 
 		 342 aa  167  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1682  ABC transporter-like  37 
 
 		 329 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0202  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  34.75 
 
 		 351 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1011  ABC transporter related  33.33 
 
 		 358 aa  167  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0118273 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002576  ferric iron ABC transporter ATP-binding protein  32.11 
 
 		 343 aa  166  4e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  35.27 
 
 		 352 aa  166  5.9999999999999996e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1180  ABC transporter related  33.99 
 
 		 312 aa  166  6.9999999999999995e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.584734 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0500  ABC transporter related  36.67 
 
 		 359 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026096  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  30.06 
 
 		 348 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000472739  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  34.16 
 
 		 355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1586  ABC transporter related  34.49 
 
 		 355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  36.95 
 
 		 363 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.9 
 
 		 362 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0526  ABC transporter related protein  38.61 
 
 		 314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0396747  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  34.87 
 
 		 363 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4439  ABC transporter related  38.33 
 
 		 333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0195171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03433  hypothetical protein  36.63 
 
 		 343 aa  163  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0657  ABC transporter related protein  37.66 
 
 		 353 aa  163  3e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1537  ABC transporter related  34.15 
 
 		 355 aa  164  3e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0442847  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2864  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  32.59 
 
 		 368 aa  164  3e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2473  ABC transporter related  32.67 
 
 		 356 aa  163  5.0000000000000005e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0449  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.2 
 
 		 366 aa  162  7e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0170  ABC transporter related protein  36.4 
 
 		 360 aa  162  8.000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2297  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.15 
 
 		 352 aa  162  9e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1587  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.22 
 
 		 376 aa  162  9e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.167194 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1602  ABC transporter  32 
 
 		 329 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0412984 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0301  ABC transporter related  38.17 
 
 		 386 aa  162  1e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2648  ABC transporter related  38.18 
 
 		 325 aa  161  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1960  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  32.51 
 
 		 399 aa  160  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1580  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  33.7 
 
 		 372 aa  160  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203005  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3533  ABC transporter related  35.25 
 
 		 372 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.514268  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2841  ABC transporter related  35.96 
 
 		 343 aa  160  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.355371  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0011  ABC transporter related  34.36 
 
 		 359 aa  160  3e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  32.03 
 
 		 354 aa  160  3e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1592  ABC transporter related  35 
 
 		 356 aa  160  3e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.911818  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0018  ferric cations import ATP-binding protein FbpC 1  32.85 
 
 		 319 aa  160  3e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1547  ABC transporter related  35.54 
 
 		 353 aa  160  3e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  31.42 
 
 		 377 aa  160  3e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0662  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  32.81 
 
 		 347 aa  160  3e-38  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2318  ABC transporter related  32.64 
 
 		 358 aa  160  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0300593  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0809  ABC transporter, ATP-binding protein  36.19 
 
 		 350 aa  159  4e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3781  ABC transporter related  32.06 
 
 		 345 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1541  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  32.78 
 
 		 354 aa  160  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.959394  normal  0.682302 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4110  ABC transporter related  36.18 
 
 		 345 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1849  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.33 
 
 		 381 aa  159  5e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.257298  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0759  ABC transporter, ATP-binding protein  36.19 
 
 		 350 aa  159  5e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.850542  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1111  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 384 aa  159  6e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3142  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  35.68 
 
 		 361 aa  159  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21910  putative ATP-binding component of ABC transporter  35.79 
 
 		 331 aa  159  6e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000308593 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1871  ABC transporter ATP-binding protein  35.42 
 
 		 331 aa  159  7e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3670  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  32.36 
 
 		 373 aa  159  7e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1158  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  33.33 
 
 		 372 aa  159  7e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0385  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.25 
 
 		 367 aa  159  8e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1027  ABC transporter related  38.84 
 
 		 370 aa  159  9e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0361894 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3882  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.7 
 
 		 329 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1587  ABC transporter related protein  34.15 
 
 		 367 aa  158  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1271  ABC transporter related  36.11 
 
 		 329 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0543066 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3116  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  33.72 
 
 		 369 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0826  ABC transporter related  34.59 
 
 		 357 aa  158  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0191  ABC-type spermidine/putrescine transport systems, ATPase component  34.93 
 
 		 368 aa  158  1e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0605  ABC transporter related  36.14 
 
 		 396 aa  158  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2002  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  30.33 
 
 		 341 aa  158  1e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0053  ABC transporter related  28.66 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.916211  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0519  ABC transporter related  34.87 
 
 		 368 aa  157  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1453  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.29 
 
 		 368 aa  157  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1642  ABC-type sugar transport system, ATPase component  35.2 
 
 		 361 aa  157  2e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1407  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.29 
 
 		 370 aa  157  3e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.890613  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1308  ABC-type spermidine/putrescine transport systems ATPase components  28.53 
 
 		 385 aa  157  3e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.120436  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6271  ABC transporter related  33.21 
 
 		 356 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0482396  normal  0.559983 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0101  ABC transporter related protein  32.16 
 
 		 366 aa  157  3e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1496  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  34.14 
 
 		 384 aa  157  3e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0341  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  33.47 
 
 		 373 aa  157  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  31.27 
 
 		 342 aa  156  4e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0252  ABC transporter related  33.06 
 
 		 356 aa  156  4e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1009  ABC transporter related  29.63 
 
 		 347 aa  156  4e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000145276 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1806  ABC transporter related  35.66 
 
 		 356 aa  156  4e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.409792  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6134  ABC transporter  32.59 
 
 		 348 aa  156  5.0000000000000005e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.210402  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6716  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  34.65 
 
 		 356 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.217931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4484  ABC transporter-related protein  33.83 
 
 		 330 aa  156  5.0000000000000005e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.495687 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  29.41 
 
 		 342 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0784  ABC transporter related  36 
 
 		 362 aa  156  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0139  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  34.85 
 
 		 343 aa  155  6e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0230499  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4487  ABC transporter related protein  35.46 
 
 		 380 aa  155  6e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.211765  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1284  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  34.4 
 
 		 426 aa  156  6e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.508961  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2469  ABC transporter related  34.78 
 
 		 330 aa  155  6e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1117  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.61 
 
 		 367 aa  156  6e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.417968  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0311  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein CysA  33.7 
 
 		 326 aa  155  7e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0503  sulphate transport system permease protein 1  35.39 
 
 		 360 aa  155  7e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0751  ABC transporter related  34.7 
 
 		 365 aa  155  7e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1328  ABC transporter related  34.44 
 
 		 328 aa  155  7e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207377  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>